MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19003	NC_014623	TAG	2	6	10049067	10049072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_014623	GCCT	2	8	10049161	10049168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19005	NC_014623	ACC	2	6	10051832	10051837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19006	NC_014623	GGA	2	6	10051879	10051884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_014623	GCT	2	6	10051913	10051918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_014623	TCT	2	6	10051933	10051938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19010	NC_014623	TGC	2	6	10051957	10051962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_014623	ATC	2	6	10053347	10053352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_014623	TGA	2	6	10053767	10053772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19014	NC_014623	TGCG	2	8	10053799	10053806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19015	NC_014623	G	7	7	10053840	10053846	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19017	NC_014623	G	6	6	10053900	10053905	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19021	NC_014623	CG	3	6	10055174	10055179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19033	NC_014623	AC	3	6	10060340	10060345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19046	NC_014623	C	9	9	10065126	10065134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19054	NC_014623	GTC	2	6	10069817	10069822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19056	NC_014623	C	7	7	10069854	10069860	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19057	NC_014623	A	6	6	10070521	10070526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_014623	GGTCGA	2	12	10070573	10070584	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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19063	NC_014623	C	6	6	10070774	10070779	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19089	NC_014623	G	8	8	10083979	10083986	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19106	NC_014623	TGCT	2	8	10091549	10091556	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19107	NC_014623	GCT	3	9	10091554	10091562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19111	NC_014623	GA	3	6	10091679	10091684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_014623	ACG	2	6	10098908	10098913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19115	NC_014623	G	6	6	10099045	10099050	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19116	NC_014623	A	6	6	10099055	10099060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19117	NC_014623	AC	3	6	10099118	10099123	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19118	NC_014623	GCG	2	6	10099809	10099814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_014623	CG	3	6	10102416	10102421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19120	NC_014623	CTA	2	6	10102443	10102448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19124	NC_014623	GGT	2	6	10103223	10103228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19125	NC_014623	GCGCCA	2	12	10103274	10103285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19126	NC_014623	CGA	2	6	10103391	10103396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19127	NC_014623	CTT	2	6	10103404	10103409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19128	NC_014623	AGAA	2	8	10103439	10103446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19129	NC_014623	TCC	2	6	10103456	10103461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19130	NC_014623	ACGG	2	8	10103472	10103479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19131	NC_014623	G	6	6	10103538	10103543	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19132	NC_014623	CCG	2	6	10103563	10103568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19133	NC_014623	TGC	2	6	10103641	10103646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19134	NC_014623	ACTT	2	8	10103696	10103703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19135	NC_014623	A	6	6	10103804	10103809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19136	NC_014623	CG	4	8	10105150	10105157	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19137	NC_014623	C	8	8	10105169	10105176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19138	NC_014623	AC	3	6	10107364	10107369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19139	NC_014623	G	6	6	10107395	10107400	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19140	NC_014623	GCC	2	6	10107507	10107512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19141	NC_014623	CTC	2	6	10107573	10107578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19142	NC_014623	CG	3	6	10107738	10107743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19143	NC_014623	CGT	2	6	10108291	10108296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19144	NC_014623	TGC	2	6	10108299	10108304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19145	NC_014623	GAA	2	6	10110535	10110540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19146	NC_014623	GCCGG	2	10	10110604	10110613	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19147	NC_014623	C	8	8	10110614	10110621	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19148	NC_014623	C	7	7	10110636	10110642	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19149	NC_014623	G	6	6	10110652	10110657	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19150	NC_014623	CCG	2	6	10110786	10110791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19151	NC_014623	AGG	2	6	10110809	10110814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19152	NC_014623	C	7	7	10112147	10112153	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19153	NC_014623	ACC	2	6	10112164	10112169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19154	NC_014623	GCA	2	6	10112191	10112196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19155	NC_014623	GAACC	2	10	10112244	10112253	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19156	NC_014623	CGGCA	2	10	10113351	10113360	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19157	NC_014623	CCG	2	6	10113376	10113381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19158	NC_014623	AGC	2	6	10113411	10113416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19159	NC_014623	CG	3	6	10114404	10114409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19160	NC_014623	GA	3	6	10115052	10115057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19161	NC_014623	GAC	2	6	10115124	10115129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19162	NC_014623	TC	3	6	10115192	10115197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19163	NC_014623	TCT	2	6	10115205	10115210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19164	NC_014623	CCCG	2	8	10115306	10115313	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19165	NC_014623	GCTC	2	8	10116499	10116506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19166	NC_014623	TTG	2	6	10116516	10116521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19167	NC_014623	ATTTC	2	10	10116610	10116619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19168	NC_014623	CG	3	6	10116648	10116653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19169	NC_014623	A	7	7	10116684	10116690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19170	NC_014623	ATTCC	2	10	10117358	10117367	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19171	NC_014623	GCG	2	6	10117379	10117384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19173	NC_014623	CAGG	2	8	10122642	10122649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19174	NC_014623	GCCCT	2	10	10122657	10122666	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19175	NC_014623	CGG	2	6	10122713	10122718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19184	NC_014623	C	7	7	10124539	10124545	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19185	NC_014623	ACGA	2	8	10124629	10124636	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19188	NC_014623	TTCA	2	8	10124938	10124945	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19189	NC_014623	GA	3	6	10124984	10124989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19215	NC_014623	C	6	6	10131573	10131578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19234	NC_014623	CGC	2	6	10132394	10132399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19236	NC_014623	G	6	6	10132438	10132443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19240	NC_014623	ACCCC	2	10	10132813	10132822	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
19241	NC_014623	TGC	2	6	10135414	10135419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19246	NC_014623	C	6	6	10136106	10136111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19247	NC_014623	CCT	2	6	10136170	10136175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19249	NC_014623	CCA	2	6	10136245	10136250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19250	NC_014623	TGG	2	6	10136272	10136277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19251	NC_014623	CTC	2	6	10136692	10136697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19252	NC_014623	CTT	2	6	10136921	10136926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19253	NC_014623	CT	3	6	10137270	10137275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19254	NC_014623	CCG	2	6	10141671	10141676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19255	NC_014623	CAA	2	6	10141698	10141703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19256	NC_014623	CTGA	2	8	10146076	10146083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19257	NC_014623	AAC	2	6	10146089	10146094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19258	NC_014623	C	6	6	10146103	10146108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19259	NC_014623	CCT	2	6	10146125	10146130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19260	NC_014623	CGC	2	6	10150453	10150458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19261	NC_014623	AGCA	2	8	10150480	10150487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19262	NC_014623	TC	4	8	10150505	10150512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19263	NC_014623	GTC	2	6	10150538	10150543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19264	NC_014623	CA	3	6	10150544	10150549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19265	NC_014623	TGG	2	6	10150557	10150562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19266	NC_014623	GTGA	2	8	10150574	10150581	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19267	NC_014623	GGC	2	6	10150586	10150591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19268	NC_014623	CCG	2	6	10150656	10150661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19269	NC_014623	TCC	2	6	10150670	10150675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19270	NC_014623	CGG	2	6	10150681	10150686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19271	NC_014623	TGC	2	6	10150796	10150801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19272	NC_014623	GAC	2	6	10150848	10150853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19273	NC_014623	GTC	2	6	10150856	10150861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19274	NC_014623	CTC	2	6	10151441	10151446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19275	NC_014623	C	7	7	10152665	10152671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19276	NC_014623	CCCG	2	8	10152844	10152851	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19277	NC_014623	TGG	2	6	10152933	10152938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19278	NC_014623	CCCG	2	8	10154855	10154862	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19279	NC_014623	CCT	2	6	10155493	10155498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19280	NC_014623	TCCG	2	8	10155518	10155525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19281	NC_014623	CG	3	6	10156081	10156086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19282	NC_014623	CGC	2	6	10156097	10156102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19283	NC_014623	CCT	2	6	10156183	10156188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19284	NC_014623	C	6	6	10156196	10156201	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19285	NC_014623	GC	3	6	10156203	10156208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19286	NC_014623	GCC	2	6	10156220	10156225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19288	NC_014623	GCCG	2	8	10162099	10162106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19289	NC_014623	GGA	2	6	10162121	10162126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19290	NC_014623	CCTG	2	8	10162629	10162636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19291	NC_014623	TGG	2	6	10162659	10162664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19292	NC_014623	AG	3	6	10163591	10163596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19293	NC_014623	CTC	2	6	10163636	10163641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19294	NC_014623	GGCA	2	8	10165170	10165177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19295	NC_014623	TCC	2	6	10165197	10165202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19296	NC_014623	CT	3	6	10165227	10165232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19297	NC_014623	CTTCTG	2	12	10165236	10165247	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19302	NC_014623	GTT	2	6	10165936	10165941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19307	NC_014623	CGT	2	6	10166390	10166395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19308	NC_014623	C	7	7	10166413	10166419	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19317	NC_014623	CTC	2	6	10167031	10167036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19319	NC_014623	CGGG	2	8	10167098	10167105	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19320	NC_014623	CTG	2	6	10167134	10167139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19321	NC_014623	CT	3	6	10167177	10167182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19322	NC_014623	CTG	2	6	10167184	10167189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19323	NC_014623	TTG	2	6	10167226	10167231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19325	NC_014623	GAT	2	6	10167973	10167978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19326	NC_014623	AG	3	6	10167980	10167985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19327	NC_014623	TGA	2	6	10168003	10168008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19331	NC_014623	GGC	2	6	10168512	10168517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19342	NC_014623	G	7	7	10182593	10182599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19343	NC_014623	TGC	3	9	10182629	10182637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19344	NC_014623	C	7	7	10183255	10183261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19360	NC_014623	CAG	2	6	10184097	10184102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19361	NC_014623	CG	3	6	10184114	10184119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19362	NC_014623	CCCT	2	8	10184614	10184621	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19363	NC_014623	CCT	2	6	10187920	10187925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19366	NC_014623	CGG	3	9	10190608	10190616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19369	NC_014623	CCA	2	6	10190687	10190692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19370	NC_014623	AC	3	6	10190693	10190698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19371	NC_014623	CCA	2	6	10190699	10190704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19372	NC_014623	GCC	2	6	10190798	10190803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19373	NC_014623	CGC	2	6	10190921	10190926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19374	NC_014623	CG	3	6	10193801	10193806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19375	NC_014623	CCA	2	6	10193815	10193820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19376	NC_014623	GGA	2	6	10193828	10193833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19377	NC_014623	GCCC	3	12	10193845	10193856	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19378	NC_014623	CGG	2	6	10193919	10193924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19379	NC_014623	GGC	2	6	10193925	10193930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19380	NC_014623	GACCG	2	10	10193993	10194002	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19381	NC_014623	CCG	2	6	10194038	10194043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19382	NC_014623	CG	3	6	10194070	10194075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19384	NC_014623	GCC	2	6	10194129	10194134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19455	NC_014623	GCGCA	2	10	10226135	10226144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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19475	NC_014623	AGC	2	6	10236279	10236284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19487	NC_014623	CAT	2	6	10239614	10239619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19488	NC_014623	GCAA	2	8	10239877	10239884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19489	NC_014623	GA	3	6	10239900	10239905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19490	NC_014623	GGGTG	2	10	10239974	10239983	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19491	NC_014623	CG	3	6	10242495	10242500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19492	NC_014623	G	6	6	10243233	10243238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19496	NC_014623	AC	3	6	10243377	10243382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19497	NC_014623	GCT	2	6	10243383	10243388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19498	NC_014623	ACC	2	6	10246269	10246274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19499	NC_014623	GC	3	6	10246321	10246326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19500	NC_014623	CG	3	6	10246347	10246352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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