MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014623	ACCCTC	2	12	8590505	8590516	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16002	NC_014623	G	6	6	8590551	8590556	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_014623	ACG	2	6	8590558	8590563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_014623	AAG	2	6	8590580	8590585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_014623	CTG	2	6	8590596	8590601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_014623	GGCAA	2	10	8590847	8590856	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16007	NC_014623	AAG	3	9	8591129	8591137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_014623	GA	3	6	8591142	8591147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_014623	CG	3	6	8591237	8591242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16010	NC_014623	CCA	2	6	8593546	8593551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16011	NC_014623	CTG	2	6	8593593	8593598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_014623	CTT	2	6	8593607	8593612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_014623	G	6	6	8594070	8594075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_014623	TGG	2	6	8594090	8594095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_014623	CGGA	2	8	8594120	8594127	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16016	NC_014623	TTC	2	6	8594277	8594282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_014623	TGC	2	6	8594317	8594322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_014623	GAT	2	6	8594396	8594401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_014623	AGG	2	6	8594425	8594430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_014623	ACC	2	6	8594455	8594460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16021	NC_014623	AGG	2	6	8596165	8596170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_014623	CCT	2	6	8596230	8596235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16023	NC_014623	TGT	2	6	8596290	8596295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_014623	TGCC	2	8	8596425	8596432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16025	NC_014623	CAG	2	6	8596520	8596525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_014623	CT	3	6	8596537	8596542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16027	NC_014623	C	6	6	8596575	8596580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16028	NC_014623	GCC	2	6	8598639	8598644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16029	NC_014623	GGA	2	6	8598649	8598654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_014623	GGT	2	6	8598718	8598723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_014623	CCG	2	6	8598725	8598730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16032	NC_014623	CCG	2	6	8598764	8598769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16033	NC_014623	C	6	6	8598770	8598775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16034	NC_014623	CGG	2	6	8598804	8598809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_014623	AAG	2	6	8598824	8598829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_014623	TGCG	2	8	8599447	8599454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16037	NC_014623	CCTT	2	8	8599487	8599494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_014623	GCT	2	6	8599499	8599504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_014623	GC	3	6	8599525	8599530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16040	NC_014623	CGCC	2	8	8599533	8599540	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16041	NC_014623	CAC	2	6	8599567	8599572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_014623	TA	3	6	8599632	8599637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_014623	AGG	2	6	8599638	8599643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_014623	AGG	2	6	8599647	8599652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_014623	GGA	2	6	8602401	8602406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_014623	GGA	2	6	8602492	8602497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_014623	GAG	2	6	8603547	8603552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_014623	TGGCA	2	10	8603558	8603567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16049	NC_014623	GCA	2	6	8603590	8603595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16050	NC_014623	TCC	2	6	8603984	8603989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16051	NC_014623	CAG	2	6	8604054	8604059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_014623	C	6	6	8604097	8604102	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16053	NC_014623	CGG	2	6	8604105	8604110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16054	NC_014623	CTT	2	6	8604113	8604118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_014623	GCG	2	6	8604119	8604124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_014623	CTT	2	6	8604128	8604133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_014623	GGT	2	6	8604172	8604177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_014623	TGC	2	6	8604201	8604206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_014623	ACC	2	6	8609286	8609291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16060	NC_014623	CCT	2	6	8609292	8609297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16061	NC_014623	GCC	2	6	8609300	8609305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_014623	AGG	2	6	8609347	8609352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_014623	CG	3	6	8609412	8609417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_014623	CACC	2	8	8609418	8609425	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16065	NC_014623	GTGG	2	8	8609429	8609436	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_014623	GCA	2	6	8609458	8609463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_014623	GCC	2	6	8609498	8609503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16068	NC_014623	CCTCT	2	10	8611436	8611445	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16069	NC_014623	AAG	2	6	8612080	8612085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_014623	GACG	2	8	8612106	8612113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16071	NC_014623	CG	3	6	8612191	8612196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_014623	GGA	2	6	8612216	8612221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_014623	GGT	2	6	8612242	8612247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_014623	TCA	2	6	8612256	8612261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_014623	CCT	2	6	8613069	8613074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16076	NC_014623	AACG	2	8	8613078	8613085	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16077	NC_014623	CAC	2	6	8613102	8613107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16078	NC_014623	TCC	2	6	8613114	8613119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16079	NC_014623	CCG	2	6	8613155	8613160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16080	NC_014623	ACC	2	6	8613978	8613983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16081	NC_014623	GGACC	2	10	8614093	8614102	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16082	NC_014623	TTC	2	6	8614119	8614124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16083	NC_014623	GCAGG	2	10	8617822	8617831	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16084	NC_014623	ATG	2	6	8617905	8617910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16088	NC_014623	TCT	2	6	8621395	8621400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_014623	TGGCA	2	10	8621419	8621428	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16090	NC_014623	GGC	2	6	8621433	8621438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16091	NC_014623	CGT	2	6	8621447	8621452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16093	NC_014623	C	7	7	8621548	8621554	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16094	NC_014623	TCG	2	6	8621575	8621580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_014623	AGC	2	6	8621587	8621592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16096	NC_014623	CGC	2	6	8621636	8621641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16097	NC_014623	GC	3	6	8621640	8621645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_014623	TGCC	2	8	8621722	8621729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_014623	CG	3	6	8621782	8621787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16100	NC_014623	GCAG	2	8	8623144	8623151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16101	NC_014623	CCG	2	6	8623183	8623188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16102	NC_014623	CAT	2	6	8623204	8623209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_014623	C	9	9	8623222	8623230	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16104	NC_014623	CGG	2	6	8625561	8625566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_014623	TCC	2	6	8625567	8625572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16106	NC_014623	GGGA	2	8	8625628	8625635	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_014623	GGC	2	6	8625660	8625665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16108	NC_014623	GTCC	2	8	8626519	8626526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16109	NC_014623	CCT	2	6	8626528	8626533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_014623	CAGG	2	8	8626539	8626546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16111	NC_014623	ACC	2	6	8626555	8626560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_014623	CGC	2	6	8626626	8626631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16113	NC_014623	GGCGC	2	10	8626672	8626681	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16114	NC_014623	GACG	2	8	8626712	8626719	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16115	NC_014623	CTG	2	6	8626731	8626736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_014623	CG	3	6	8626745	8626750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_014623	TCT	2	6	8632619	8632624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_014623	GCC	2	6	8632657	8632662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_014623	G	7	7	8632771	8632777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_014623	AGGC	2	8	8632821	8632828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16121	NC_014623	T	6	6	8632876	8632881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_014623	CCG	2	6	8632897	8632902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16123	NC_014623	CCTC	2	8	8633977	8633984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16124	NC_014623	G	7	7	8633987	8633993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_014623	CGC	2	6	8634007	8634012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16126	NC_014623	AAAC	2	8	8634567	8634574	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16127	NC_014623	C	6	6	8634622	8634627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16128	NC_014623	CGC	2	6	8634687	8634692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16129	NC_014623	C	6	6	8634745	8634750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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16133	NC_014623	GTGC	2	8	8644483	8644490	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16241	NC_014623	ATG	2	6	8707168	8707173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16244	NC_014623	GC	3	6	8707354	8707359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16245	NC_014623	CGGG	2	8	8707368	8707375	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16246	NC_014623	ACC	2	6	8709914	8709919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16247	NC_014623	AGC	2	6	8709966	8709971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16248	NC_014623	GC	3	6	8710073	8710078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16249	NC_014623	GC	3	6	8710086	8710091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16250	NC_014623	ATCCCC	2	12	8710092	8710103	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16251	NC_014623	ACG	2	6	8712583	8712588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16252	NC_014623	C	7	7	8712955	8712961	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16253	NC_014623	TCA	2	6	8713058	8713063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16254	NC_014623	C	6	6	8713426	8713431	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16255	NC_014623	AAG	2	6	8713432	8713437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16256	NC_014623	CGG	2	6	8713487	8713492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16257	NC_014623	TTG	2	6	8713536	8713541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16258	NC_014623	GGAG	2	8	8713612	8713619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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