MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014623	TCC	2	6	6871525	6871530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_014623	CCGC	2	8	6871544	6871551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13003	NC_014623	GCTCC	2	10	6871555	6871564	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13004	NC_014623	TGCC	2	8	6871595	6871602	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_014623	GT	3	6	6871607	6871612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_014623	CCA	2	6	6871656	6871661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13007	NC_014623	CCT	2	6	6873330	6873335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13008	NC_014623	C	7	7	6873359	6873365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13009	NC_014623	GCC	2	6	6873445	6873450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13010	NC_014623	C	7	7	6873455	6873461	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13011	NC_014623	CTCC	2	8	6873471	6873478	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13012	NC_014623	C	7	7	6873477	6873483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13013	NC_014623	TCC	2	6	6873490	6873495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_014623	AGG	2	6	6885223	6885228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_014623	CAG	2	6	6885241	6885246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_014623	GGC	2	6	6885260	6885265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_014623	CGC	2	6	6885286	6885291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_014623	TCC	2	6	6888315	6888320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_014623	CCGC	2	8	6889492	6889499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13020	NC_014623	TC	4	8	6891106	6891113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13021	NC_014623	CTC	2	6	6893263	6893268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_014623	TTC	2	6	6893315	6893320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_014623	GACG	2	8	6893345	6893352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_014623	ACGCA	2	10	6900597	6900606	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13025	NC_014623	CGCC	2	8	6900613	6900620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13026	NC_014623	CCCG	2	8	6900648	6900655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13027	NC_014623	GC	3	6	6901693	6901698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_014623	TTC	2	6	6901782	6901787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_014623	CG	3	6	6902940	6902945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13030	NC_014623	CCTA	2	8	6904278	6904285	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13031	NC_014623	CGTC	2	8	6904318	6904325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13032	NC_014623	GGC	2	6	6907742	6907747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_014623	TCC	2	6	6907777	6907782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13034	NC_014623	GGC	2	6	6907783	6907788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_014623	CGGC	2	8	6907802	6907809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_014623	GGAC	2	8	6908883	6908890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13037	NC_014623	AACGT	2	10	6908958	6908967	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13038	NC_014623	C	6	6	6908970	6908975	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13039	NC_014623	AGG	2	6	6908986	6908991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_014623	TCG	2	6	6910181	6910186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_014623	GAT	2	6	6912373	6912378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_014623	ACG	2	6	6912394	6912399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_014623	CAGG	2	8	6912451	6912458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_014623	GTC	2	6	6912461	6912466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_014623	CG	3	6	6913696	6913701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_014623	CCGT	2	8	6913752	6913759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_014623	GCGCC	2	10	6913819	6913828	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13048	NC_014623	CGC	2	6	6913834	6913839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_014623	CAGG	2	8	6918715	6918722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_014623	CGT	2	6	6918731	6918736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_014623	GCC	2	6	6920449	6920454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_014623	GC	3	6	6920501	6920506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13053	NC_014623	TAA	2	6	6923447	6923452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_014623	ACC	2	6	6923454	6923459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13055	NC_014623	TCG	2	6	6925386	6925391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_014623	GTG	2	6	6925399	6925404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_014623	C	6	6	6925414	6925419	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13058	NC_014623	AC	3	6	6928481	6928486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13059	NC_014623	AGC	2	6	6928492	6928497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_014623	CGG	2	6	6928500	6928505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_014623	CAG	2	6	6930497	6930502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_014623	TCC	2	6	6930504	6930509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_014623	CG	3	6	6930578	6930583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13064	NC_014623	TGA	2	6	6930595	6930600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_014623	CGA	2	6	6930685	6930690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_014623	TCC	2	6	6930707	6930712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13067	NC_014623	CGG	2	6	6930724	6930729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_014623	GC	4	8	6931117	6931124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_014623	GCCC	2	8	6931149	6931156	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13070	NC_014623	CGG	2	6	6934485	6934490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_014623	GCG	2	6	6937462	6937467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_014623	GAG	2	6	6937477	6937482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_014623	AGCG	2	8	6937568	6937575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13074	NC_014623	CTC	2	6	6938040	6938045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_014623	AGGAG	2	10	6938058	6938067	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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13078	NC_014623	CGG	2	6	6939733	6939738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_014623	CTCC	2	8	6941448	6941455	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13080	NC_014623	GTC	2	6	6942458	6942463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_014623	CT	3	6	6942525	6942530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13082	NC_014623	GCG	2	6	6942565	6942570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_014623	ACGC	2	8	6942602	6942609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13084	NC_014623	CGG	2	6	6942730	6942735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_014623	TCG	2	6	6942959	6942964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_014623	TCCG	2	8	6942967	6942974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13087	NC_014623	GC	3	6	6943617	6943622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13088	NC_014623	G	6	6	6943631	6943636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_014623	CGT	2	6	6943657	6943662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13091	NC_014623	TCC	2	6	6943714	6943719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13092	NC_014623	GCAA	2	8	6943739	6943746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13093	NC_014623	CTCC	2	8	6943759	6943766	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13094	NC_014623	GC	3	6	6943807	6943812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_014623	CCAT	2	8	6943876	6943883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13096	NC_014623	C	7	7	6943886	6943892	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13097	NC_014623	AGCCC	2	10	6946985	6946994	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13098	NC_014623	CGCAAG	2	12	6947021	6947032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_014623	CAC	2	6	6947765	6947770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_014623	CCG	2	6	6948671	6948676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_014623	CCG	2	6	6952138	6952143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_014623	GCC	2	6	6952162	6952167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13103	NC_014623	CAG	2	6	6952170	6952175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_014623	GCC	2	6	6953438	6953443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_014623	GCT	2	6	6953454	6953459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13107	NC_014623	AGG	2	6	6953485	6953490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_014623	C	7	7	6953959	6953965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13109	NC_014623	GCC	2	6	6953969	6953974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13110	NC_014623	GGCG	2	8	6953988	6953995	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_014623	GGCGC	2	10	6954106	6954115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13112	NC_014623	CCG	2	6	6954185	6954190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13113	NC_014623	CAG	2	6	6954214	6954219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_014623	TCC	2	6	6954232	6954237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13115	NC_014623	GCT	2	6	6954246	6954251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_014623	TCA	2	6	6954295	6954300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_014623	GC	3	6	6954881	6954886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_014623	TGC	2	6	6955830	6955835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_014623	CGG	2	6	6955879	6955884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_014623	GC	3	6	6955919	6955924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13121	NC_014623	AGG	2	6	6955994	6955999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_014623	CGA	2	6	6956001	6956006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_014623	G	6	6	6956008	6956013	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_014623	GCAC	2	8	6956044	6956051	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_014623	CTC	2	6	6956097	6956102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13126	NC_014623	CT	3	6	6956124	6956129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13127	NC_014623	CTC	2	6	6956180	6956185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_014623	GGA	2	6	6956223	6956228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_014623	GAA	2	6	6956248	6956253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13130	NC_014623	GCC	2	6	6956265	6956270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13131	NC_014623	GCC	2	6	6956276	6956281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13132	NC_014623	G	6	6	6956293	6956298	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13133	NC_014623	TGCA	2	8	6957812	6957819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13134	NC_014623	CCCCT	2	10	6957833	6957842	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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