MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014623	CG	3	6	5946343	5946348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11502	NC_014623	AGC	2	6	5962338	5962343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_014623	C	6	6	5962347	5962352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11504	NC_014623	CGG	2	6	5962362	5962367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_014623	GA	3	6	5962410	5962415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_014623	TGACC	2	10	5962440	5962449	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11507	NC_014623	CG	3	6	5973923	5973928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_014623	TG	3	6	5976341	5976346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_014623	CAG	2	6	5977811	5977816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_014623	CG	4	8	5977840	5977847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11511	NC_014623	GGCCG	2	10	5978295	5978304	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11512	NC_014623	TGC	2	6	5978376	5978381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_014623	TCT	2	6	5979973	5979978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_014623	C	9	9	5982560	5982568	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11515	NC_014623	TC	4	8	5983976	5983983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_014623	CGGGCG	2	12	5984028	5984039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_014623	GGC	2	6	5987541	5987546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_014623	GCCC	2	8	5987594	5987601	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11519	NC_014623	CT	3	6	5987607	5987612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11520	NC_014623	GTC	2	6	5989141	5989146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_014623	AGG	3	9	5989157	5989165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_014623	CAC	2	6	5989195	5989200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11523	NC_014623	CGG	2	6	5989703	5989708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_014623	GCCC	2	8	5994532	5994539	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11525	NC_014623	GCC	2	6	5994542	5994547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_014623	GGT	2	6	5994557	5994562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_014623	CCTG	2	8	5995105	5995112	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_014623	AATG	2	8	5995117	5995124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_014623	TTG	2	6	5995143	5995148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_014623	TCC	2	6	5995244	5995249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11531	NC_014623	GTCATT	2	12	5995255	5995266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11532	NC_014623	GGC	2	6	5995319	5995324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_014623	TTC	2	6	5995467	5995472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_014623	G	6	6	5995531	5995536	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_014623	TTTG	2	8	5995546	5995553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_014623	CCT	2	6	5995566	5995571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_014623	GGCC	2	8	5996664	5996671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11538	NC_014623	CGC	2	6	5996690	5996695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_014623	CTC	3	9	5996720	5996728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_014623	GCCC	2	8	5997743	5997750	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11541	NC_014623	TC	3	6	6003203	6003208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11542	NC_014623	CTC	3	9	6003206	6003214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11543	NC_014623	CCT	2	6	6003263	6003268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11544	NC_014623	CAA	2	6	6003293	6003298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_014623	CGG	2	6	6003303	6003308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_014623	TCG	2	6	6003312	6003317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_014623	TGAAA	2	10	6004922	6004931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_014623	C	6	6	6004968	6004973	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11549	NC_014623	GAG	2	6	6008136	6008141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_014623	GTTC	2	8	6008163	6008170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11551	NC_014623	AGG	2	6	6008175	6008180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_014623	GGA	2	6	6008187	6008192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_014623	CCCTC	2	10	6008196	6008205	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11554	NC_014623	CCTTG	2	10	6016363	6016372	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11555	NC_014623	CGGCG	2	10	6021435	6021444	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11556	NC_014623	GGT	2	6	6021447	6021452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_014623	GT	3	6	6021566	6021571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_014623	GAA	2	6	6021627	6021632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_014623	CTT	2	6	6021725	6021730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_014623	CCG	2	6	6021749	6021754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11561	NC_014623	GCCT	3	12	6021782	6021793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11562	NC_014623	CGGG	2	8	6021796	6021803	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_014623	GCCG	2	8	6021840	6021847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_014623	C	8	8	6021864	6021871	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11565	NC_014623	CG	4	8	6021894	6021901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_014623	C	6	6	6024049	6024054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11567	NC_014623	GCT	2	6	6024067	6024072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_014623	GCG	2	6	6024090	6024095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_014623	CCCG	2	8	6025022	6025029	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11570	NC_014623	CG	3	6	6025028	6025033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_014623	TCC	2	6	6026055	6026060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_014623	GGA	2	6	6026235	6026240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_014623	CGGCG	2	10	6027424	6027433	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11574	NC_014623	TCT	2	6	6030133	6030138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11577	NC_014623	CTC	2	6	6032776	6032781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11578	NC_014623	TCCC	2	8	6032788	6032795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11579	NC_014623	CCT	2	6	6033649	6033654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11580	NC_014623	C	6	6	6033671	6033676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11581	NC_014623	GCA	2	6	6033678	6033683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11583	NC_014623	TTG	2	6	6034994	6034999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11586	NC_014623	CG	3	6	6035093	6035098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11587	NC_014623	TTGG	2	8	6035134	6035141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11591	NC_014623	C	8	8	6038576	6038583	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11592	NC_014623	C	7	7	6042139	6042145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11593	NC_014623	CTG	2	6	6042150	6042155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11595	NC_014623	CCTCC	2	10	6042250	6042259	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11596	NC_014623	GCG	2	6	6042287	6042292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_014623	TCC	2	6	6047510	6047515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11598	NC_014623	GTT	2	6	6047595	6047600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_014623	AGT	2	6	6047654	6047659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_014623	GCCC	2	8	6047698	6047705	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11601	NC_014623	TTC	2	6	6047763	6047768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_014623	CT	3	6	6047778	6047783	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_014623	CAC	2	6	6052421	6052426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11604	NC_014623	GCC	2	6	6052464	6052469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11605	NC_014623	C	6	6	6052492	6052497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11606	NC_014623	CGG	2	6	6052501	6052506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_014623	CT	3	6	6053301	6053306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11608	NC_014623	CAGA	2	8	6053320	6053327	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11609	NC_014623	GCT	2	6	6054366	6054371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_014623	TCTT	2	8	6055919	6055926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11611	NC_014623	CTCG	2	8	6055948	6055955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11612	NC_014623	GCT	2	6	6055957	6055962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_014623	CCG	3	9	6055980	6055988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11614	NC_014623	TGC	2	6	6058115	6058120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_014623	GAGC	2	8	6060200	6060207	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_014623	AAC	2	6	6060300	6060305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_014623	CAG	2	6	6060330	6060335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_014623	CAT	2	6	6060372	6060377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_014623	CAC	2	6	6060389	6060394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11620	NC_014623	CTG	2	6	6060464	6060469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11621	NC_014623	CCT	2	6	6061933	6061938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11622	NC_014623	CGC	2	6	6061944	6061949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11623	NC_014623	GC	4	8	6061971	6061978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11624	NC_014623	TA	3	6	6062007	6062012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_014623	GGGT	2	8	6062026	6062033	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_014623	C	6	6	6063268	6063273	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11627	NC_014623	ACT	2	6	6063302	6063307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11628	NC_014623	GGAGTG	2	12	6063365	6063376	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_014623	TAA	2	6	6063439	6063444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11630	NC_014623	CGAC	2	8	6064720	6064727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11631	NC_014623	AGGG	2	8	6064794	6064801	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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11655	NC_014623	TTGC	2	8	6073255	6073262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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