MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_014623	GAGGG	2	10	5255306	5255315	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_014623	CGC	2	6	5255329	5255334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10503	NC_014623	CGCC	2	8	5256612	5256619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10504	NC_014623	GGCG	2	8	5256625	5256632	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10505	NC_014623	GCC	2	6	5256648	5256653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_014623	CGG	2	6	5259089	5259094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_014623	GCC	2	6	5259111	5259116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_014623	AGA	3	9	5259128	5259136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_014623	CCT	2	6	5262471	5262476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_014623	G	6	6	5262482	5262487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_014623	GCCCTG	2	12	5264008	5264019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10512	NC_014623	GCC	2	6	5264074	5264079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_014623	C	6	6	5264086	5264091	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10514	NC_014623	TTC	2	6	5264104	5264109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_014623	TGGG	2	8	5264178	5264185	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_014623	CG	3	6	5264197	5264202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10517	NC_014623	CCG	2	6	5264211	5264216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_014623	TCAA	2	8	5266341	5266348	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10519	NC_014623	GAT	2	6	5266391	5266396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_014623	CTTC	2	8	5267195	5267202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10521	NC_014623	CGT	2	6	5270991	5270996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_014623	GGC	2	6	5271005	5271010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_014623	C	6	6	5271709	5271714	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10524	NC_014623	CG	3	6	5273221	5273226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10525	NC_014623	CTC	2	6	5273338	5273343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_014623	CG	4	8	5275495	5275502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_014623	GCG	2	6	5277290	5277295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_014623	G	6	6	5279845	5279850	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_014623	GGA	2	6	5282907	5282912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_014623	G	6	6	5282916	5282921	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_014623	GAG	2	6	5282929	5282934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_014623	CCT	2	6	5285537	5285542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10533	NC_014623	CGG	2	6	5285551	5285556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_014623	GCG	2	6	5285617	5285622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_014623	TTG	2	6	5285636	5285641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_014623	TGG	2	6	5285693	5285698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_014623	CGGA	2	8	5285710	5285717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10538	NC_014623	TC	3	6	5285726	5285731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_014623	TGAG	2	8	5285752	5285759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_014623	CCG	2	6	5285780	5285785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10541	NC_014623	AAAC	2	8	5288389	5288396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10542	NC_014623	G	6	6	5288438	5288443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_014623	CAG	2	6	5290195	5290200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_014623	GT	3	6	5290248	5290253	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_014623	AAG	2	6	5290269	5290274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_014623	GTT	2	6	5292083	5292088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_014623	TTGCC	2	10	5292129	5292138	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10548	NC_014623	CCGC	2	8	5292204	5292211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10549	NC_014623	TCCGG	2	10	5292252	5292261	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10550	NC_014623	GGA	2	6	5292273	5292278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_014623	CCT	3	9	5295356	5295364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_014623	CTC	2	6	5295425	5295430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10553	NC_014623	G	6	6	5295443	5295448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_014623	AGC	2	6	5295481	5295486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_014623	CG	3	6	5295635	5295640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10556	NC_014623	CTTCTG	2	12	5295641	5295652	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_014623	TCT	3	9	5295734	5295742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_014623	GGC	2	6	5295746	5295751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_014623	GAG	2	6	5296106	5296111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_014623	CTT	2	6	5296122	5296127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_014623	GCT	2	6	5296915	5296920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_014623	GA	3	6	5296954	5296959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_014623	G	6	6	5299838	5299843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_014623	CGAC	2	8	5299849	5299856	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_014623	TCCC	2	8	5299866	5299873	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10566	NC_014623	GGA	2	6	5299875	5299880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_014623	CTC	2	6	5300697	5300702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_014623	AG	3	6	5301598	5301603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_014623	GGC	2	6	5301607	5301612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_014623	C	8	8	5301618	5301625	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10571	NC_014623	GGA	2	6	5303703	5303708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_014623	ACG	2	6	5303734	5303739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10574	NC_014623	CTC	2	6	5303755	5303760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10575	NC_014623	GCC	2	6	5303774	5303779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10578	NC_014623	ACAA	2	8	5305321	5305328	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10579	NC_014623	TCA	2	6	5305356	5305361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10580	NC_014623	C	6	6	5306739	5306744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10581	NC_014623	CG	3	6	5308495	5308500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10582	NC_014623	TGG	2	6	5308555	5308560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_014623	GACA	2	8	5310061	5310068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10584	NC_014623	CCCCT	2	10	5314316	5314325	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10585	NC_014623	A	6	6	5314379	5314384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10587	NC_014623	C	6	6	5315331	5315336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10588	NC_014623	GCG	2	6	5315343	5315348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10593	NC_014623	G	6	6	5324831	5324836	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_014623	GGC	2	6	5324862	5324867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_014623	GA	3	6	5324879	5324884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_014623	CGG	2	6	5326060	5326065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_014623	G	8	8	5326064	5326071	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_014623	GAG	2	6	5326877	5326882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_014623	GGA	2	6	5327038	5327043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_014623	GT	3	6	5327517	5327522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_014623	GCTC	2	8	5327608	5327615	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10602	NC_014623	GC	3	6	5327624	5327629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10603	NC_014623	CTT	2	6	5327646	5327651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_014623	GT	3	6	5327671	5327676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_014623	TGC	2	6	5327698	5327703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10607	NC_014623	CAGT	2	8	5330445	5330452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_014623	TTG	2	6	5330483	5330488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_014623	TCTG	2	8	5330513	5330520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10610	NC_014623	C	6	6	5330544	5330549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10611	NC_014623	CGT	2	6	5335012	5335017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_014623	G	6	6	5335042	5335047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_014623	GCC	2	6	5335062	5335067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10614	NC_014623	T	7	7	5335070	5335076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_014623	CCT	2	6	5338557	5338562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10616	NC_014623	G	7	7	5341103	5341109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_014623	C	6	6	5341475	5341480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10618	NC_014623	TGC	2	6	5341950	5341955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10619	NC_014623	GCAA	2	8	5342011	5342018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10620	NC_014623	AGCT	2	8	5342090	5342097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10621	NC_014623	TGCC	2	8	5342118	5342125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10622	NC_014623	GT	3	6	5344167	5344172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_014623	CCCAC	2	10	5344179	5344188	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
10624	NC_014623	TCC	2	6	5344203	5344208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10625	NC_014623	CCT	2	6	5350022	5350027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10626	NC_014623	GAAG	2	8	5350044	5350051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_014623	CGAGG	2	10	5350084	5350093	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10628	NC_014623	C	6	6	5350107	5350112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10629	NC_014623	TC	3	6	5352882	5352887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10630	NC_014623	CCG	2	6	5352913	5352918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10632	NC_014623	GCC	2	6	5353022	5353027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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