MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014623	GC	3	6	4920445	4920450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_014623	CCT	2	6	4920451	4920456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_014623	T	7	7	4920460	4920466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_014623	GCC	2	6	4920758	4920763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_014623	CGG	2	6	4922316	4922321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_014623	GCT	2	6	4922363	4922368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_014623	CT	3	6	4922367	4922372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_014623	TAG	2	6	4922375	4922380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_014623	T	6	6	4922394	4922399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_014623	TAC	2	6	4922405	4922410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_014623	GTC	2	6	4922419	4922424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_014623	T	6	6	4922897	4922902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_014623	CTG	3	9	4927424	4927432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_014623	CCG	2	6	4928583	4928588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_014623	CG	3	6	4928605	4928610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_014623	GTG	2	6	4931536	4931541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014623	TCAG	2	8	4931593	4931600	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10018	NC_014623	GCGG	2	8	4931636	4931643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_014623	GGA	2	6	4933275	4933280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_014623	G	7	7	4933321	4933327	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014623	GAC	2	6	4933345	4933350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_014623	AAGC	2	8	4933388	4933395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10023	NC_014623	GCC	2	6	4933431	4933436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_014623	CGA	2	6	4933504	4933509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_014623	TGG	2	6	4933522	4933527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_014623	AAG	2	6	4933547	4933552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_014623	G	7	7	4935538	4935544	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_014623	CGC	2	6	4935565	4935570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10029	NC_014623	AGC	2	6	4935578	4935583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_014623	TCG	2	6	4935592	4935597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_014623	CAG	2	6	4935694	4935699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_014623	ATC	2	6	4935703	4935708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_014623	AGC	2	6	4935726	4935731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_014623	TCG	2	6	4935740	4935745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_014623	GAAAG	2	10	4935844	4935853	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_014623	A	6	6	4937331	4937336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_014623	CTG	2	6	4937368	4937373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_014623	CCT	2	6	4939570	4939575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_014623	T	6	6	4939602	4939607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_014623	CTG	2	6	4939635	4939640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_014623	TCG	2	6	4939690	4939695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_014623	CGA	2	6	4942882	4942887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_014623	GCAG	2	8	4944779	4944786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_014623	G	6	6	4945712	4945717	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_014623	TAC	2	6	4945729	4945734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_014623	TCA	2	6	4945751	4945756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_014623	CCG	2	6	4948054	4948059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_014623	ACC	2	6	4948133	4948138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_014623	GCA	2	6	4953670	4953675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_014623	CT	3	6	4953694	4953699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_014623	GC	3	6	4954672	4954677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_014623	GC	3	6	4954685	4954690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_014623	ACA	2	6	4956349	4956354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_014623	AGG	2	6	4956366	4956371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_014623	AGG	2	6	4956853	4956858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_014623	CGT	2	6	4959145	4959150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_014623	GTGG	2	8	4959189	4959196	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_014623	GAA	2	6	4959206	4959211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_014623	CG	3	6	4961138	4961143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_014623	CCG	2	6	4961155	4961160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_014623	G	7	7	4961160	4961166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_014623	TGT	2	6	4964057	4964062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_014623	GAC	2	6	4964143	4964148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_014623	CTGGTG	2	12	4964170	4964181	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10065	NC_014623	GGCGG	2	10	4965016	4965025	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10066	NC_014623	CTTC	2	8	4965629	4965636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_014623	TGG	2	6	4965690	4965695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_014623	GCG	2	6	4965709	4965714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_014623	GGA	2	6	4965732	4965737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014623	TCC	2	6	4965773	4965778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_014623	GA	3	6	4965949	4965954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_014623	CTC	2	6	4966606	4966611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_014623	TGA	2	6	4966614	4966619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_014623	CAC	2	6	4966627	4966632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10075	NC_014623	ACG	2	6	4966661	4966666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_014623	GCC	2	6	4966736	4966741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10077	NC_014623	CGG	2	6	4966779	4966784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_014623	GACG	2	8	4966798	4966805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_014623	GCCTCG	2	12	4966820	4966831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_014623	GAA	2	6	4966852	4966857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_014623	GAA	2	6	4966870	4966875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_014623	CAGGT	2	10	4968204	4968213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10083	NC_014623	CCA	2	6	4968697	4968702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_014623	ACG	2	6	4970706	4970711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_014623	GAA	2	6	4970713	4970718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_014623	GCC	2	6	4970738	4970743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10087	NC_014623	AGG	2	6	4970808	4970813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_014623	CAG	2	6	4970829	4970834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_014623	GGT	2	6	4971033	4971038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_014623	CAC	2	6	4971048	4971053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10091	NC_014623	GGC	3	9	4971054	4971062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_014623	GC	3	6	4971061	4971066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_014623	GC	3	6	4971127	4971132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_014623	TGC	2	6	4971134	4971139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10096	NC_014623	CGA	2	6	4971154	4971159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_014623	GCC	2	6	4971162	4971167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_014623	GCAG	2	8	4971197	4971204	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10099	NC_014623	CTCCG	2	10	4971606	4971615	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10100	NC_014623	AGGG	2	8	4971651	4971658	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_014623	GA	3	6	4971660	4971665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_014623	CGA	2	6	4971674	4971679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10104	NC_014623	CTGG	2	8	4973777	4973784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10105	NC_014623	C	6	6	4973787	4973792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10106	NC_014623	CACCCT	2	12	4973795	4973806	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_014623	CCA	2	6	4973821	4973826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_014623	CCT	2	6	4973849	4973854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_014623	GC	3	6	4973928	4973933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_014623	CTC	2	6	4973934	4973939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_014623	CT	3	6	4973955	4973960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10112	NC_014623	GGCCAC	2	12	4976213	4976224	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_014623	GCT	2	6	4976267	4976272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_014623	TTC	2	6	4982904	4982909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_014623	CCT	2	6	4982910	4982915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_014623	AAG	2	6	4982961	4982966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_014623	T	6	6	4982992	4982997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_014623	ATG	2	6	4983015	4983020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_014623	CTT	2	6	4983032	4983037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_014623	TGA	2	6	4983039	4983044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_014623	GGA	2	6	4983049	4983054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014623	AGG	2	6	4983079	4983084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014623	TCC	2	6	4984026	4984031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10124	NC_014623	AGG	2	6	4984041	4984046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_014623	CCTC	2	8	4984076	4984083	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10126	NC_014623	AAC	2	6	4984085	4984090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10128	NC_014623	GTTCG	2	10	4986811	4986820	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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10251	NC_014623	GCGGG	2	10	5101670	5101679	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10252	NC_014623	CGG	2	6	5101689	5101694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10254	NC_014623	GAT	2	6	5101710	5101715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10385	NC_014623	CA	3	6	5186958	5186963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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