MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014623	GCT	2	6	3714852	3714857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_014623	GCT	2	6	3714881	3714886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_014623	TGG	2	6	3714891	3714896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_014623	G	8	8	3714920	3714927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_014623	CGG	2	6	3714981	3714986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_014623	G	6	6	3714996	3715001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_014623	GC	3	6	3722858	3722863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8008	NC_014623	TGT	2	6	3722897	3722902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_014623	ATG	2	6	3722904	3722909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_014623	GT	3	6	3722959	3722964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_014623	ATTCA	2	10	3723042	3723051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8012	NC_014623	T	6	6	3723067	3723072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_014623	GTTTG	2	10	3723127	3723136	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_014623	TCCA	2	8	3723171	3723178	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_014623	TCC	2	6	3723179	3723184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_014623	AGC	2	6	3724182	3724187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_014623	CGGA	2	8	3727710	3727717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8018	NC_014623	AT	3	6	3727725	3727730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_014623	GCA	2	6	3728251	3728256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_014623	GC	3	6	3728297	3728302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_014623	ATCC	2	8	3728310	3728317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_014623	GAC	2	6	3728344	3728349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_014623	TGATG	2	10	3728388	3728397	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_014623	GGA	2	6	3728455	3728460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_014623	TCG	2	6	3728465	3728470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_014623	GGT	2	6	3728482	3728487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_014623	CAT	2	6	3728509	3728514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_014623	GCA	2	6	3728749	3728754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_014623	T	7	7	3729388	3729394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_014623	GA	3	6	3729426	3729431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_014623	GTC	3	9	3732444	3732452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_014623	GC	3	6	3732506	3732511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_014623	TGC	2	6	3735500	3735505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_014623	C	6	6	3735517	3735522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8035	NC_014623	CGT	2	6	3735589	3735594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_014623	GA	3	6	3735643	3735648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_014623	GGGA	2	8	3735649	3735656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_014623	GTA	2	6	3736528	3736533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_014623	CGA	2	6	3736535	3736540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_014623	G	6	6	3736580	3736585	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_014623	GGGGCG	2	12	3738000	3738011	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
8042	NC_014623	GCG	2	6	3738049	3738054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_014623	AG	3	6	3738067	3738072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_014623	CGA	2	6	3738166	3738171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_014623	GCC	2	6	3738179	3738184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_014623	CG	3	6	3738223	3738228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_014623	TCG	2	6	3738231	3738236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_014623	GCACGC	2	12	3738244	3738255	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_014623	GTC	2	6	3738260	3738265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_014623	GCA	2	6	3738271	3738276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_014623	GCT	2	6	3738295	3738300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_014623	GCA	3	9	3738319	3738327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_014623	CCAC	2	8	3738343	3738350	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8054	NC_014623	CTG	2	6	3738404	3738409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_014623	CAG	2	6	3738446	3738451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_014623	CGGGC	2	10	3738467	3738476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8057	NC_014623	GCG	2	6	3738490	3738495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_014623	CTGG	2	8	3738497	3738504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_014623	CT	3	6	3738524	3738529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8060	NC_014623	GC	3	6	3738578	3738583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8061	NC_014623	TCCAGC	2	12	3738588	3738599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_014623	CTC	2	6	3738659	3738664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_014623	CGC	2	6	3738690	3738695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_014623	GCG	2	6	3738745	3738750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_014623	CGG	2	6	3738763	3738768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_014623	GGCGC	2	10	3738771	3738780	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8067	NC_014623	GC	3	6	3738796	3738801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_014623	GCGG	2	8	3738834	3738841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_014623	CTGGC	2	10	3738875	3738884	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8070	NC_014623	CTG	2	6	3738926	3738931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_014623	CCG	2	6	3738940	3738945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8074	NC_014623	GCA	2	6	3739030	3739035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_014623	CG	3	6	3739040	3739045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_014623	TCGC	2	8	3739059	3739066	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_014623	GCT	3	9	3739078	3739086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_014623	TCG	2	6	3739107	3739112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_014623	GTC	2	6	3739128	3739133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_014623	GC	3	6	3739168	3739173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_014623	GCC	2	6	3739903	3739908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_014623	GCA	2	6	3739962	3739967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_014623	GACG	2	8	3739994	3740001	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8084	NC_014623	GGA	2	6	3740009	3740014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_014623	CGT	2	6	3740034	3740039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8087	NC_014623	GT	3	6	3740072	3740077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_014623	GTA	2	6	3740115	3740120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_014623	GTA	2	6	3740147	3740152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8091	NC_014623	CAG	2	6	3740225	3740230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_014623	GAAG	2	8	3740234	3740241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_014623	CGC	2	6	3740244	3740249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_014623	CGG	2	6	3740345	3740350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_014623	CAC	2	6	3740415	3740420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_014623	GCT	2	6	3740441	3740446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8098	NC_014623	CATC	2	8	3742018	3742025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_014623	GCG	2	6	3742058	3742063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_014623	GAG	2	6	3742104	3742109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_014623	GA	3	6	3742113	3742118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_014623	CAG	2	6	3742148	3742153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8106	NC_014623	CCTT	2	8	3744845	3744852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8107	NC_014623	CAT	2	6	3744874	3744879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8109	NC_014623	TTCC	2	8	3745536	3745543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_014623	ATG	2	6	3745557	3745562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_014623	GAA	2	6	3745574	3745579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_014623	AAC	2	6	3748029	3748034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_014623	GTG	2	6	3748079	3748084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_014623	GGC	2	6	3748109	3748114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_014623	CGG	2	6	3748185	3748190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_014623	CCTT	2	8	3748203	3748210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8117	NC_014623	GGA	2	6	3748252	3748257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_014623	CTC	2	6	3748278	3748283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_014623	CG	3	6	3748344	3748349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_014623	GCA	2	6	3749129	3749134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8122	NC_014623	GGT	2	6	3749216	3749221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_014623	TGA	2	6	3749236	3749241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_014623	CGG	2	6	3749317	3749322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_014623	CGT	2	6	3749333	3749338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_014623	GGA	2	6	3749349	3749354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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