MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014623	GAGCC	2	10	3035510	3035519	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6502	NC_014623	GCT	2	6	3035569	3035574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_014623	CCT	2	6	3035584	3035589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_014623	CCCAG	2	10	3035592	3035601	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6505	NC_014623	TTG	2	6	3035623	3035628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_014623	GGC	2	6	3035646	3035651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_014623	CCG	2	6	3035671	3035676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_014623	ATG	2	6	3035720	3035725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_014623	AGG	2	6	3035741	3035746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_014623	CAT	2	6	3035752	3035757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_014623	TGG	2	6	3036696	3036701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_014623	CGT	2	6	3036708	3036713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_014623	G	6	6	3038380	3038385	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_014623	CTCG	3	12	3038413	3038424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6515	NC_014623	G	6	6	3038443	3038448	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_014623	GCGTC	2	10	3038488	3038497	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6517	NC_014623	CG	3	6	3038508	3038513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6518	NC_014623	GA	3	6	3038614	3038619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_014623	CCT	2	6	3038636	3038641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_014623	G	6	6	3038661	3038666	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_014623	CCG	2	6	3038721	3038726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_014623	CTG	2	6	3038886	3038891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_014623	GGT	2	6	3038914	3038919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_014623	GC	3	6	3039011	3039016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6525	NC_014623	CAGC	2	8	3039046	3039053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_014623	TGCG	2	8	3040825	3040832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6527	NC_014623	CTGCA	2	10	3040839	3040848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6528	NC_014623	GC	3	6	3041551	3041556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6529	NC_014623	CTC	2	6	3041627	3041632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_014623	CGG	2	6	3041661	3041666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_014623	CCG	2	6	3041718	3041723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6532	NC_014623	CGT	2	6	3041746	3041751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_014623	GC	3	6	3041765	3041770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_014623	AG	3	6	3041777	3041782	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_014623	CT	3	6	3041794	3041799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6536	NC_014623	AGA	2	6	3041807	3041812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_014623	CCA	2	6	3041818	3041823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_014623	ATCG	2	8	3041837	3041844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6539	NC_014623	AGG	2	6	3043765	3043770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_014623	T	6	6	3043806	3043811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_014623	CTT	2	6	3043821	3043826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_014623	ATG	2	6	3043827	3043832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_014623	GCG	3	9	3044065	3044073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_014623	CCG	2	6	3044095	3044100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_014623	ACC	2	6	3044115	3044120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_014623	GAT	2	6	3044148	3044153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_014623	GCG	2	6	3044167	3044172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_014623	GAC	2	6	3045248	3045253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_014623	GGC	3	9	3045556	3045564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_014623	GCT	2	6	3047128	3047133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_014623	GGC	2	6	3047176	3047181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_014623	GAG	2	6	3047215	3047220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_014623	GCC	2	6	3047235	3047240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_014623	GCC	2	6	3047302	3047307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6555	NC_014623	C	6	6	3047306	3047311	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6556	NC_014623	GCA	2	6	3047327	3047332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_014623	GAC	2	6	3047379	3047384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_014623	CAG	2	6	3047413	3047418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_014623	CAA	2	6	3052046	3052051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_014623	TGC	2	6	3052056	3052061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_014623	GCT	2	6	3052107	3052112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_014623	TGG	2	6	3052132	3052137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_014623	GA	3	6	3052168	3052173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_014623	CCT	2	6	3053084	3053089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_014623	CT	3	6	3053776	3053781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_014623	CAG	2	6	3053789	3053794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_014623	CCG	2	6	3053849	3053854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6568	NC_014623	TCC	2	6	3053871	3053876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6569	NC_014623	CTC	2	6	3053882	3053887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6570	NC_014623	GAC	2	6	3054026	3054031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_014623	CTC	2	6	3054039	3054044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_014623	AG	4	8	3054164	3054171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_014623	CT	4	8	3054272	3054279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_014623	AG	3	6	3054305	3054310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_014623	GGC	2	6	3054318	3054323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6577	NC_014623	CGG	2	6	3054889	3054894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_014623	GCTGG	2	10	3054910	3054919	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6579	NC_014623	ATT	2	6	3059547	3059552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_014623	TC	3	6	3059591	3059596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6581	NC_014623	G	6	6	3059603	3059608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_014623	CG	3	6	3060262	3060267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6583	NC_014623	AGG	2	6	3060291	3060296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_014623	G	6	6	3060313	3060318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_014623	GGC	2	6	3061096	3061101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_014623	CAG	2	6	3061114	3061119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_014623	GTG	2	6	3061180	3061185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_014623	TTCC	2	8	3061301	3061308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_014623	CAG	2	6	3061334	3061339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_014623	CCG	2	6	3061351	3061356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6591	NC_014623	CT	3	6	3061377	3061382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_014623	GCC	2	6	3061418	3061423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_014623	CCA	2	6	3061460	3061465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6594	NC_014623	TCC	2	6	3061479	3061484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_014623	G	9	9	3061494	3061502	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_014623	CCT	2	6	3061503	3061508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6597	NC_014623	TGG	2	6	3061680	3061685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_014623	CCG	2	6	3061686	3061691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_014623	AGC	2	6	3061706	3061711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_014623	CTG	2	6	3061757	3061762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_014623	TCC	2	6	3066347	3066352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6602	NC_014623	TCG	2	6	3066426	3066431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_014623	GGGC	2	8	3067348	3067355	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_014623	G	6	6	3067369	3067374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_014623	TCA	2	6	3067404	3067409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_014623	CG	3	6	3067415	3067420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6607	NC_014623	CTG	2	6	3067817	3067822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_014623	GGA	2	6	3067846	3067851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_014623	AGG	2	6	3070271	3070276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_014623	AGGC	2	8	3070281	3070288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6611	NC_014623	GTATT	2	10	3070571	3070580	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_014623	GTC	2	6	3070612	3070617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_014623	TA	3	6	3070640	3070645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_014623	CGG	2	6	3070700	3070705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_014623	CG	3	6	3075307	3075312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_014623	CCT	2	6	3075366	3075371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_014623	ATGCG	2	10	3075382	3075391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6618	NC_014623	AAC	2	6	3075964	3075969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_014623	TCC	2	6	3076035	3076040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_014623	GAGC	2	8	3076054	3076061	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6621	NC_014623	CGCA	2	8	3076085	3076092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6622	NC_014623	AAC	2	6	3076100	3076105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_014623	GAA	2	6	3076933	3076938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_014623	TCCT	2	8	3084431	3084438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6625	NC_014623	GT	3	6	3086692	3086697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_014623	AGG	2	6	3086710	3086715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_014623	AGT	2	6	3086722	3086727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_014623	ACT	2	6	3088478	3088483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_014623	GCC	2	6	3088875	3088880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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