MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6192 chromosome

Total Repeats: 3922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014484	TCC	2	6	2214759	2214764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_014484	CTT	3	9	2214793	2214801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014484	CTC	2	6	2214814	2214819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_014484	CCT	2	6	2214822	2214827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_014484	TCA	2	6	2214842	2214847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_014484	GTC	2	6	2214904	2214909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014484	TCC	2	6	2215357	2215362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_014484	CCA	2	6	2215375	2215380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_014484	TA	3	6	2215422	2215427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014484	CCA	2	6	2215430	2215435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3511	NC_014484	TCC	2	6	2215452	2215457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_014484	ATCG	2	8	2215497	2215504	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_014484	ACC	2	6	2215526	2215531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3514	NC_014484	CCAT	2	8	2215808	2215815	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_014484	CCT	2	6	2215838	2215843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_014484	GTG	2	6	2215860	2215865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014484	CT	3	6	2216483	2216488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3518	NC_014484	CTC	3	9	2216535	2216543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_014484	CAC	2	6	2216576	2216581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_014484	CCTCC	2	10	2216639	2216648	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3521	NC_014484	GCT	2	6	2216660	2216665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_014484	CTCA	2	8	2216667	2216674	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_014484	CCCA	2	8	2216675	2216682	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3524	NC_014484	CCA	2	6	2216708	2216713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_014484	CCT	2	6	2217934	2217939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_014484	CT	3	6	2217938	2217943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_014484	ACG	2	6	2228598	2228603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014484	TCC	2	6	2228609	2228614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_014484	C	7	7	2228628	2228634	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3530	NC_014484	CCAC	2	8	2228650	2228657	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3531	NC_014484	CAC	2	6	2228660	2228665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_014484	C	6	6	2228668	2228673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3533	NC_014484	CCTCC	2	10	2228678	2228687	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3534	NC_014484	TCC	2	6	2228691	2228696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_014484	ACC	2	6	2228697	2228702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_014484	C	6	6	2228713	2228718	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3537	NC_014484	CCCT	2	8	2228742	2228749	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3538	NC_014484	CTC	2	6	2228756	2228761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_014484	CCT	2	6	2228775	2228780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_014484	CCA	2	6	2228781	2228786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_014484	CTCAC	2	10	2228792	2228801	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3542	NC_014484	CCT	3	9	2228814	2228822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_014484	TCC	2	6	2229055	2229060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_014484	C	7	7	2229062	2229068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3545	NC_014484	CAT	2	6	2229080	2229085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_014484	CTC	2	6	2229092	2229097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3547	NC_014484	ACC	2	6	2229100	2229105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_014484	CCT	2	6	2229112	2229117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_014484	CCT	2	6	2229124	2229129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_014484	C	6	6	2229130	2229135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3551	NC_014484	C	9	9	2229146	2229154	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3552	NC_014484	ACC	3	9	2229155	2229163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_014484	GCA	2	6	2229168	2229173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_014484	CTC	2	6	2230457	2230462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_014484	CTCC	2	8	2230510	2230517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3556	NC_014484	AGG	2	6	2230518	2230523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014484	TCCCTC	2	12	2230529	2230540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_014484	TC	3	6	2230591	2230596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_014484	CTA	2	6	2230663	2230668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_014484	GCA	2	6	2230747	2230752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_014484	ACC	2	6	2230778	2230783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_014484	GAA	2	6	2230787	2230792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014484	TGCA	2	8	2230826	2230833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_014484	CTA	2	6	2230837	2230842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_014484	CAG	2	6	2230907	2230912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_014484	ACTCTC	2	12	2230996	2231007	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_014484	GA	3	6	2231015	2231020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014484	AAG	2	6	2231048	2231053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014484	TCC	2	6	2231065	2231070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_014484	C	6	6	2231101	2231106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3571	NC_014484	CAA	2	6	2231169	2231174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_014484	AGG	2	6	2234626	2234631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014484	CCT	2	6	2243519	2243524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_014484	TCT	2	6	2243551	2243556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_014484	CTT	2	6	2243605	2243610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_014484	TCCA	2	8	2243619	2243626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_014484	GAG	2	6	2243627	2243632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_014484	CCT	2	6	2244532	2244537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_014484	A	7	7	2246349	2246355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014484	GAG	2	6	2246373	2246378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014484	A	7	7	2246399	2246405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014484	TTA	2	6	2246444	2246449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014484	AGG	2	6	2246461	2246466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014484	CT	3	6	2246495	2246500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_014484	T	6	6	2246500	2246505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014484	GA	3	6	2246520	2246525	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014484	AGGG	2	8	2246535	2246542	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014484	AGA	2	6	2247276	2247281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014484	GAA	2	6	2248305	2248310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014484	CTT	2	6	2248320	2248325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_014484	TCA	2	6	2248333	2248338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_014484	TA	3	6	2249810	2249815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014484	CTC	2	6	2249816	2249821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_014484	CT	3	6	2249875	2249880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3595	NC_014484	T	7	7	2249880	2249886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014484	AGGG	2	8	2249929	2249936	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014484	CCGG	2	8	2249968	2249975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_014484	GA	3	6	2250014	2250019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014484	AG	3	6	2250032	2250037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_014484	CAT	2	6	2250049	2250054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014484	CTT	2	6	2250072	2250077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014484	TGG	2	6	2250101	2250106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014484	CCT	2	6	2250116	2250121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_014484	CAA	2	6	2250129	2250134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_014484	GAT	2	6	2250135	2250140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014484	CG	3	6	2250145	2250150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_014484	TCTCT	2	10	2250155	2250164	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3608	NC_014484	GAG	2	6	2250173	2250178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014484	GCCCT	2	10	2250223	2250232	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3610	NC_014484	CTC	2	6	2250256	2250261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_014484	GCT	2	6	2250285	2250290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_014484	TGGA	2	8	2253943	2253950	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_014484	GGA	2	6	2254800	2254805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014484	GTG	2	6	2256042	2256047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014484	CCGG	2	8	2256064	2256071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_014484	GT	3	6	2256076	2256081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014484	CCT	2	6	2257384	2257389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_014484	CTC	2	6	2257402	2257407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3619	NC_014484	GCCCG	2	10	2257421	2257430	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3620	NC_014484	TCT	2	6	2257568	2257573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_014484	GGC	2	6	2257620	2257625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_014484	GCC	2	6	2257632	2257637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_014484	AGCCC	2	10	2257651	2257660	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3624	NC_014484	CTC	2	6	2259705	2259710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3625	NC_014484	GAA	2	6	2259749	2259754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014484	T	7	7	2259792	2259798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014484	A	6	6	2259811	2259816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_014484	ATT	2	6	2259823	2259828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_014484	ACTTT	2	10	2259853	2259862	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3630	NC_014484	GAGC	2	8	2259906	2259913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3631	NC_014484	CA	3	6	2261949	2261954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3632	NC_014484	CA	3	6	2261964	2261969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_014484	AC	3	6	2261989	2261994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3760	NC_014484	TCCC	2	8	2355694	2355701	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3761	NC_014484	A	6	6	2355759	2355764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3769	NC_014484	GTAC	2	8	2357097	2357104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3885	NC_014484	GA	3	6	2456502	2456507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3886	NC_014484	GAG	2	6	2456514	2456519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3889	NC_014484	GAGG	2	8	2456806	2456813	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3890	NC_014484	CCT	2	6	2456963	2456968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3894	NC_014484	ACA	2	6	2457516	2457521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3895	NC_014484	AGG	2	6	2457533	2457538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3896	NC_014484	ACCA	2	8	2457545	2457552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3897	NC_014484	CCT	2	6	2460720	2460725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3898	NC_014484	TCCTC	2	10	2460793	2460802	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3899	NC_014484	CACC	2	8	2460807	2460814	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3900	NC_014484	TCC	2	6	2460829	2460834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3901	NC_014484	C	7	7	2460852	2460858	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3902	NC_014484	C	6	6	2460881	2460886	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3903	NC_014484	C	6	6	2460925	2460930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3904	NC_014484	CTC	2	6	2460945	2460950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3905	NC_014484	CCCT	2	8	2460985	2460992	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3906	NC_014484	CTC	2	6	2461011	2461016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3907	NC_014484	CAC	2	6	2461035	2461040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3908	NC_014484	AG	3	6	2463507	2463512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3909	NC_014484	AGA	2	6	2465507	2465512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3910	NC_014484	CAC	2	6	2466593	2466598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3911	NC_014484	CGG	2	6	2466655	2466660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3912	NC_014484	CTC	2	6	2469098	2469103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3913	NC_014484	AAG	3	9	2471062	2471070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3914	NC_014484	TCC	2	6	2472377	2472382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3915	NC_014484	TGG	2	6	2472402	2472407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3916	NC_014484	T	6	6	2472423	2472428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3917	NC_014484	ATG	2	6	2472491	2472496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3918	NC_014484	A	6	6	2472500	2472505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3919	NC_014484	A	6	6	2472511	2472516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3920	NC_014484	TTTA	2	8	2472587	2472594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3921	NC_014484	AATAA	2	10	2472611	2472620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3922	NC_014484	TCGT	2	8	2472637	2472644	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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