MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014364	T	7	7	2380915	2380921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014364	CAA	2	6	2380922	2380927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_014364	TA	3	6	2380946	2380951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014364	TCT	2	6	2380963	2380968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_014364	ATT	3	9	2381024	2381032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014364	TAAA	2	8	2381039	2381046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014364	AAT	2	6	2389463	2389468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014364	TCA	2	6	2389492	2389497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_014364	CAAAA	2	10	2393870	2393879	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4010	NC_014364	A	6	6	2393876	2393881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014364	T	6	6	2393910	2393915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014364	AGA	2	6	2393918	2393923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014364	A	6	6	2393923	2393928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014364	TAA	2	6	2394128	2394133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014364	CCA	2	6	2394183	2394188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_014364	TACCT	2	10	2394205	2394214	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4017	NC_014364	TTC	2	6	2394285	2394290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_014364	TC	3	6	2394315	2394320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_014364	GCT	2	6	2394354	2394359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_014364	A	6	6	2394371	2394376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014364	CTT	2	6	2394448	2394453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_014364	GGT	2	6	2394458	2394463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014364	GAC	2	6	2394464	2394469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_014364	CGC	2	6	2394515	2394520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_014364	GGGT	2	8	2394546	2394553	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014364	TTA	2	6	2395695	2395700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014364	ACCT	2	8	2396546	2396553	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4028	NC_014364	TGA	2	6	2396563	2396568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014364	A	6	6	2396590	2396595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014364	AGA	2	6	2403170	2403175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_014364	CAA	2	6	2410260	2410265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_014364	ACC	2	6	2411475	2411480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_014364	CGT	2	6	2411491	2411496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_014364	ATAAAA	2	12	2411497	2411508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014364	CGTA	2	8	2411511	2411518	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4036	NC_014364	GAG	2	6	2411531	2411536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_014364	GCG	2	6	2413226	2413231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_014364	GCC	2	6	2413241	2413246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_014364	TCC	2	6	2421615	2421620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_014364	ATCA	2	8	2421636	2421643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4041	NC_014364	AAG	2	6	2421645	2421650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014364	CA	3	6	2421686	2421691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_014364	TGG	2	6	2421742	2421747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014364	T	6	6	2421748	2421753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014364	A	6	6	2421766	2421771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014364	TGC	3	9	2423976	2423984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_014364	AAC	2	6	2428539	2428544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_014364	CGA	2	6	2431304	2431309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_014364	CGT	2	6	2431317	2431322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_014364	TTA	2	6	2441236	2441241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014364	A	7	7	2444126	2444132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014364	TGT	2	6	2444175	2444180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014364	CTT	2	6	2444283	2444288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_014364	CTC	3	9	2444292	2444300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_014364	T	6	6	2444337	2444342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014364	T	6	6	2444352	2444357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014364	A	6	6	2447139	2447144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014364	GGT	2	6	2447162	2447167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014364	CTT	2	6	2449917	2449922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_014364	TCC	2	6	2457637	2457642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_014364	ATCG	2	8	2458105	2458112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4062	NC_014364	T	6	6	2458164	2458169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014364	TGT	2	6	2458205	2458210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014364	AGG	2	6	2458260	2458265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014364	TTCT	2	8	2463883	2463890	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4066	NC_014364	AT	3	6	2464531	2464536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_014364	T	6	6	2464542	2464547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014364	CAT	2	6	2464652	2464657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_014364	CGGA	2	8	2464661	2464668	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4070	NC_014364	CAA	2	6	2467743	2467748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_014364	GGA	2	6	2470167	2470172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014364	AAC	2	6	2472885	2472890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_014364	T	6	6	2473785	2473790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014364	GTG	2	6	2474486	2474491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014364	AGT	2	6	2475701	2475706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_014364	TAAT	2	8	2479313	2479320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_014364	CA	3	6	2481772	2481777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_014364	TCT	2	6	2485206	2485211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_014364	TTC	2	6	2485272	2485277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_014364	TCC	2	6	2491973	2491978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_014364	CAT	2	6	2491993	2491998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_014364	TATT	2	8	2492011	2492018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014364	GGA	2	6	2492099	2492104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014364	ATTTT	2	10	2492127	2492136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_014364	A	6	6	2492142	2492147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_014364	TTC	2	6	2492162	2492167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_014364	A	6	6	2492171	2492176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014364	T	7	7	2492190	2492196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_014364	CTAT	2	8	2493877	2493884	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_014364	A	6	6	2493894	2493899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014364	CAG	2	6	2493914	2493919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_014364	AAG	2	6	2494468	2494473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_014364	GGA	2	6	2494540	2494545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014364	AGA	2	6	2494925	2494930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014364	GCAGAA	2	12	2494950	2494961	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4096	NC_014364	GCA	2	6	2495036	2495041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_014364	A	7	7	2495041	2495047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014364	T	6	6	2495055	2495060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014364	TC	3	6	2497173	2497178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_014364	TCT	2	6	2498439	2498444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_014364	CT	3	6	2498443	2498448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_014364	GAA	2	6	2500044	2500049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014364	CAC	2	6	2500540	2500545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_014364	GAG	2	6	2502389	2502394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014364	TA	3	6	2503442	2503447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014364	TAT	2	6	2507389	2507394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014364	CCT	2	6	2508726	2508731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_014364	ATA	2	6	2508765	2508770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014364	ATA	2	6	2508778	2508783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014364	ATG	2	6	2508843	2508848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014364	CAG	2	6	2508878	2508883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_014364	CCTGC	2	10	2508906	2508915	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4113	NC_014364	ACT	2	6	2509644	2509649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_014364	TAG	2	6	2509718	2509723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014364	TAC	2	6	2509849	2509854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_014364	ATT	2	6	2510056	2510061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014364	AT	3	6	2510094	2510099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014364	GTT	2	6	2510122	2510127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014364	T	6	6	2510193	2510198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014364	TTATA	2	10	2511445	2511454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014364	T	6	6	2511462	2511467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014364	ACCA	2	8	2511468	2511475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_014364	CCA	2	6	2511480	2511485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_014364	ATAC	2	8	2511559	2511566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4125	NC_014364	CCA	2	6	2511640	2511645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_014364	ACG	2	6	2511652	2511657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_014364	T	6	6	2511677	2511682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014364	T	6	6	2511701	2511706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014364	CCT	2	6	2517824	2517829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_014364	GTCA	2	8	2517854	2517861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4131	NC_014364	GGA	2	6	2517905	2517910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014364	CTT	2	6	2521940	2521945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_014364	GCGCT	2	10	2525103	2525112	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4134	NC_014364	AT	3	6	2525121	2525126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_014364	GAA	2	6	2525138	2525143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4246	NC_014364	TGT	2	6	2574740	2574745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4253	NC_014364	CAT	2	6	2577124	2577129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4257	NC_014364	AAC	2	6	2577210	2577215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_014364	TCC	2	6	2577462	2577467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4259	NC_014364	CAG	2	6	2577527	2577532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4261	NC_014364	TCT	2	6	2577673	2577678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_014364	GA	3	6	2577695	2577700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_014364	AAG	2	6	2577846	2577851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4266	NC_014364	CTT	2	6	2577870	2577875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4267	NC_014364	AAAAT	2	10	2577878	2577887	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4271	NC_014364	TAATT	2	10	2578846	2578855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4285	NC_014364	ATAC	2	8	2589754	2589761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4381	NC_014364	CGATA	2	10	2698821	2698830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4382	NC_014364	TTA	2	6	2698914	2698919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4384	NC_014364	TC	3	6	2699348	2699353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4385	NC_014364	CGG	2	6	2699393	2699398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4389	NC_014364	CCGG	2	8	2701289	2701296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4390	NC_014364	TTTC	2	8	2701340	2701347	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4391	NC_014364	TCA	2	6	2701876	2701881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4392	NC_014364	CT	3	6	2701945	2701950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4393	NC_014364	GAATG	2	10	2701961	2701970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_014364	TTG	2	6	2701991	2701996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4395	NC_014364	TAT	2	6	2702022	2702027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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