MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014364	CATA	2	8	2110249	2110256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_014364	AT	3	6	2110296	2110301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014364	TCA	2	6	2110862	2110867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_014364	AAT	2	6	2110902	2110907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014364	TA	3	6	2110935	2110940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014364	AAT	2	6	2110941	2110946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_014364	CAA	2	6	2110971	2110976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_014364	CT	4	8	2111047	2111054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_014364	CAT	2	6	2111061	2111066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_014364	CTT	2	6	2111090	2111095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_014364	TCGC	2	8	2111104	2111111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_014364	A	6	6	2111187	2111192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014364	TCAC	2	8	2111224	2111231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_014364	CTTCT	2	10	2111438	2111447	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3515	NC_014364	A	6	6	2111454	2111459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014364	TCC	2	6	2111494	2111499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_014364	A	7	7	2111550	2111556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014364	A	7	7	2111590	2111596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_014364	CTTC	2	8	2111628	2111635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_014364	ACG	2	6	2115107	2115112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_014364	GCG	2	6	2115213	2115218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_014364	GAG	2	6	2115247	2115252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_014364	CCCGGA	2	12	2115287	2115298	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_014364	TCAGGT	2	12	2116646	2116657	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3525	NC_014364	G	6	6	2116669	2116674	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_014364	CCG	2	6	2116682	2116687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_014364	CTT	2	6	2116691	2116696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014364	CTTC	2	8	2116709	2116716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_014364	A	6	6	2116755	2116760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014364	CAA	2	6	2116777	2116782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_014364	GCC	2	6	2116787	2116792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_014364	ATC	2	6	2116855	2116860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_014364	A	6	6	2117405	2117410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014364	CTT	2	6	2118088	2118093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_014364	TAA	2	6	2118113	2118118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014364	TGAA	2	8	2118132	2118139	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014364	A	7	7	2118150	2118156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014364	GTTC	2	8	2118215	2118222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_014364	ATA	2	6	2118233	2118238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014364	AT	3	6	2118276	2118281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014364	ATA	2	6	2118303	2118308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_014364	AT	3	6	2118379	2118384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014364	TA	4	8	2118431	2118438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014364	TA	4	8	2118473	2118480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014364	GT	3	6	2118481	2118486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014364	TTCT	2	8	2118502	2118509	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_014364	CTG	2	6	2118520	2118525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_014364	CTTT	2	8	2118949	2118956	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_014364	TAT	2	6	2118962	2118967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_014364	A	6	6	2119015	2119020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_014364	GA	3	6	2119025	2119030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014364	GAA	2	6	2119837	2119842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_014364	CT	4	8	2121042	2121049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_014364	AATC	2	8	2121071	2121078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3555	NC_014364	CTTT	2	8	2121092	2121099	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_014364	GAAT	2	8	2121188	2121195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014364	GTT	2	6	2121222	2121227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014364	TTC	2	6	2121264	2121269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_014364	AGA	2	6	2121290	2121295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014364	TTAT	2	8	2121363	2121370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014364	ACT	2	6	2121407	2121412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_014364	AAT	2	6	2127754	2127759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014364	TCCC	2	8	2127769	2127776	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3564	NC_014364	TAA	2	6	2127818	2127823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014364	TA	3	6	2127863	2127868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_014364	GCT	2	6	2127884	2127889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_014364	GTT	2	6	2128322	2128327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014364	ATA	2	6	2128336	2128341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014364	ACA	2	6	2128366	2128371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_014364	GA	3	6	2128412	2128417	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014364	ATG	2	6	2128481	2128486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014364	AGT	2	6	2128563	2128568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014364	A	6	6	2128599	2128604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014364	CGTT	2	8	2129206	2129213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_014364	GTGA	2	8	2129222	2129229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014364	CA	4	8	2129375	2129382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_014364	GCT	3	9	2129401	2129409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_014364	CAT	2	6	2129415	2129420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_014364	GAG	2	6	2129436	2129441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014364	CGG	2	6	2129855	2129860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_014364	AG	3	6	2129869	2129874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014364	ACGTT	2	10	2129966	2129975	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3583	NC_014364	TAA	2	6	2130096	2130101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_014364	GGA	2	6	2133104	2133109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_014364	TGT	2	6	2135832	2135837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_014364	A	6	6	2135850	2135855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014364	TAT	2	6	2135866	2135871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014364	TAT	2	6	2135904	2135909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014364	T	6	6	2135919	2135924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014364	A	8	8	2135925	2135932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014364	GGAT	2	8	2135944	2135951	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014364	AGA	2	6	2135952	2135957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014364	T	7	7	2136739	2136745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014364	TTC	2	6	2136770	2136775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_014364	T	8	8	2136786	2136793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014364	CGGA	2	8	2136834	2136841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_014364	AAG	2	6	2136863	2136868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014364	GGC	2	6	2136875	2136880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014364	TCG	2	6	2136929	2136934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_014364	T	7	7	2136937	2136943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_014364	AGAGG	2	10	2136962	2136971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014364	GA	3	6	2136974	2136979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014364	AGGA	2	8	2142879	2142886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014364	CTTT	2	8	2143322	2143329	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_014364	CGG	2	6	2143331	2143336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_014364	AAG	2	6	2143370	2143375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014364	CT	4	8	2153654	2153661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_014364	ATC	2	6	2153662	2153667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_014364	TGC	2	6	2153675	2153680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_014364	GT	3	6	2153698	2153703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_014364	TGG	2	6	2153705	2153710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_014364	A	7	7	2153838	2153844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_014364	CAT	2	6	2153847	2153852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_014364	CTT	2	6	2153880	2153885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_014364	CAT	2	6	2153906	2153911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_014364	A	7	7	2153924	2153930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014364	GTT	2	6	2154348	2154353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014364	CG	3	6	2154363	2154368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_014364	GCG	2	6	2154425	2154430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_014364	TAA	2	6	2154466	2154471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014364	ATT	2	6	2154481	2154486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014364	TAC	2	6	2154810	2154815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_014364	TGC	2	6	2154866	2154871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_014364	CAT	2	6	2154878	2154883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_014364	GTAT	2	8	2154907	2154914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_014364	TTG	2	6	2154946	2154951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014364	TAT	2	6	2154980	2154985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_014364	GAA	2	6	2155001	2155006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_014364	GGCAG	2	10	2157344	2157353	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3630	NC_014364	AT	3	6	2157417	2157422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_014364	ACAAA	2	10	2157529	2157538	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3632	NC_014364	CGT	2	6	2157686	2157691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_014364	AGG	2	6	2157720	2157725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3759	NC_014364	ACA	2	6	2270497	2270502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3760	NC_014364	AAG	2	6	2270524	2270529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3761	NC_014364	AAC	2	6	2271546	2271551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3762	NC_014364	CAAG	2	8	2271563	2271570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3765	NC_014364	T	6	6	2273466	2273471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3883	NC_014364	TGG	2	6	2345570	2345575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3885	NC_014364	AAAG	2	8	2345613	2345620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3886	NC_014364	T	8	8	2346981	2346988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3887	NC_014364	TGT	2	6	2347076	2347081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3888	NC_014364	AAAC	2	8	2347173	2347180	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3889	NC_014364	AGGA	2	8	2347185	2347192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3890	NC_014364	TTG	2	6	2348185	2348190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3891	NC_014364	T	7	7	2348241	2348247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3892	NC_014364	TTC	2	6	2348272	2348277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3894	NC_014364	AAG	2	6	2348365	2348370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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