MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014364	TG	3	6	1668591	1668596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014364	GT	3	6	1668597	1668602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014364	GGAT	2	8	1675359	1675366	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014364	GAT	2	6	1675375	1675380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014364	AG	3	6	1676657	1676662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014364	AG	3	6	1676675	1676680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014364	GGA	2	6	1679482	1679487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014364	GGA	2	6	1682824	1682829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014364	GAG	2	6	1684262	1684267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014364	AAT	2	6	1687901	1687906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_014364	GCT	2	6	1698573	1698578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_014364	GAG	2	6	1698595	1698600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_014364	ATT	2	6	1698605	1698610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014364	GA	3	6	1700027	1700032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014364	TCCC	2	8	1710130	1710137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3016	NC_014364	TCGAT	2	10	1715469	1715478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_014364	TGA	2	6	1715489	1715494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014364	AGA	2	6	1715496	1715501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014364	T	7	7	1718021	1718027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014364	ACG	2	6	1718271	1718276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_014364	TCCC	2	8	1718293	1718300	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3022	NC_014364	AGG	2	6	1718363	1718368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014364	TTTG	2	8	1720611	1720618	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014364	GAA	2	6	1721654	1721659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014364	CGG	2	6	1721664	1721669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_014364	GTG	2	6	1726660	1726665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014364	T	6	6	1729548	1729553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014364	GCG	2	6	1729564	1729569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_014364	T	6	6	1729626	1729631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014364	GA	3	6	1729670	1729675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014364	ATTA	2	8	1735498	1735505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014364	TTGTT	2	10	1735520	1735529	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014364	GATT	2	8	1736332	1736339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014364	TAT	2	6	1736383	1736388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014364	AT	3	6	1736425	1736430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014364	GAA	2	6	1741799	1741804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014364	GTG	2	6	1741825	1741830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014364	CTC	2	6	1741839	1741844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3040	NC_014364	A	7	7	1743612	1743618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014364	TTGCC	2	10	1743654	1743663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3042	NC_014364	AC	3	6	1744179	1744184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_014364	TTA	2	6	1744188	1744193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014364	A	7	7	1744245	1744251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014364	CAT	2	6	1744344	1744349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_014364	TAT	2	6	1749726	1749731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014364	GGA	2	6	1749750	1749755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014364	TGCTG	2	10	1749774	1749783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3049	NC_014364	GA	3	6	1749797	1749802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_014364	CTTT	2	8	1752562	1752569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3051	NC_014364	CGG	2	6	1752595	1752600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3053	NC_014364	CTT	2	6	1753705	1753710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_014364	TGT	2	6	1753723	1753728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_014364	ATC	2	6	1753808	1753813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_014364	T	8	8	1753849	1753856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014364	CAA	2	6	1753862	1753867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_014364	T	7	7	1756512	1756518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014364	CCT	2	6	1756520	1756525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3061	NC_014364	TGAG	2	8	1756609	1756616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014364	AG	3	6	1758984	1758989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014364	CTTTT	2	10	1759014	1759023	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3064	NC_014364	AT	4	8	1759027	1759034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014364	CAT	2	6	1761412	1761417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_014364	AAT	2	6	1761422	1761427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014364	GTGAG	2	10	1761487	1761496	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014364	GCAG	2	8	1763019	1763026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_014364	T	6	6	1771059	1771064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3073	NC_014364	TGG	2	6	1773738	1773743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_014364	TGT	2	6	1779873	1779878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014364	TA	3	6	1779907	1779912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014364	TTTTG	2	10	1779926	1779935	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014364	TGT	2	6	1779976	1779981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_014364	ATG	2	6	1780021	1780026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_014364	AT	3	6	1780028	1780033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_014364	TAG	2	6	1782027	1782032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014364	TGTA	2	8	1782058	1782065	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014364	GCA	2	6	1782078	1782083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3097	NC_014364	GAG	2	6	1782189	1782194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_014364	CTG	2	6	1782204	1782209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_014364	T	7	7	1782216	1782222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014364	T	6	6	1782250	1782255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_014364	T	7	7	1782300	1782306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014364	TAT	2	6	1782311	1782316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014364	TA	3	6	1782336	1782341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_014364	A	6	6	1782351	1782356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014364	ATG	2	6	1782425	1782430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_014364	CGT	2	6	1787242	1787247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_014364	ATA	2	6	1787252	1787257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014364	G	6	6	1787272	1787277	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014364	TTA	2	6	1787331	1787336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3114	NC_014364	TA	3	6	1789361	1789366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014364	TAT	2	6	1789392	1789397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3118	NC_014364	T	6	6	1797139	1797144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014364	CTCC	2	8	1797145	1797152	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3120	NC_014364	AGG	2	6	1797166	1797171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014364	TTC	2	6	1799061	1799066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_014364	T	8	8	1799069	1799076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014364	AAC	2	6	1799079	1799084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_014364	AG	3	6	1799133	1799138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014364	GAGG	2	8	1799166	1799173	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014364	TAT	2	6	1803949	1803954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014364	T	6	6	1803966	1803971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014364	TGT	2	6	1804483	1804488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014364	T	6	6	1804530	1804535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014364	ACA	2	6	1804538	1804543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_014364	TCC	2	6	1806694	1806699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_014364	ACA	2	6	1806763	1806768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_014364	ATA	2	6	1806775	1806780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_014364	GTCAA	2	10	1808504	1808513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3135	NC_014364	ATT	2	6	1808555	1808560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_014364	AT	3	6	1808641	1808646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3174	NC_014364	TCC	2	6	1844779	1844784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3232	NC_014364	AACCG	2	10	1873001	1873010	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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3234	NC_014364	CCG	3	9	1873157	1873165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3252	NC_014364	ATT	2	6	1879129	1879134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_014364	CCT	2	6	1880280	1880285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_014364	ATGT	2	8	1880289	1880296	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_014364	GAA	2	6	1880323	1880328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_014364	A	6	6	1880417	1880422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_014364	TTC	2	6	1880467	1880472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3258	NC_014364	T	7	7	1880502	1880508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_014364	ATG	2	6	1883645	1883650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_014364	AAG	2	6	1888867	1888872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_014364	AGAAA	2	10	1888887	1888896	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_014364	TG	3	6	1889810	1889815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_014364	TAA	2	6	1889854	1889859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_014364	AGAT	2	8	1899940	1899947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3402	NC_014364	GA	3	6	2014614	2014619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3435	NC_014364	GAAA	2	8	2037934	2037941	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3436	NC_014364	GCTG	2	8	2039396	2039403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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