MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014364	GAT	2	6	523990	523995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014364	TAC	2	6	524020	524025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_014364	TC	3	6	524085	524090	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_014364	TG	3	6	524273	524278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014364	AAAG	2	8	524313	524320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014364	GGT	2	6	524336	524341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014364	AAG	2	6	524368	524373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014364	GTTTC	2	10	524391	524400	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_014364	T	6	6	524426	524431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014364	TTG	2	6	524447	524452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014364	TC	3	6	524516	524521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_014364	ATTTC	2	10	524545	524554	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_014364	AAGGT	2	10	524578	524587	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014364	TA	3	6	524595	524600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014364	TAGTA	2	10	524696	524705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014364	TTC	2	6	524716	524721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014364	TTC	2	6	524797	524802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014364	A	6	6	524827	524832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014364	AGGA	2	8	524866	524873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014364	AAT	2	6	525723	525728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014364	A	8	8	525743	525750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014364	TTG	2	6	525915	525920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014364	AT	4	8	525937	525944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014364	T	6	6	525979	525984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014364	ATT	2	6	526007	526012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014364	GCA	2	6	526071	526076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014364	A	6	6	526233	526238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014364	ATT	2	6	526265	526270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014364	A	6	6	526282	526287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014364	T	6	6	526326	526331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014364	CTTGA	2	10	526346	526355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_014364	GAAG	2	8	528190	528197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014364	GAG	2	6	531256	531261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014364	TGG	2	6	532512	532517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014364	CCT	2	6	534750	534755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1036	NC_014364	TAG	2	6	534772	534777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014364	ATG	2	6	535559	535564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014364	CCTT	2	8	539196	539203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_014364	GGAA	2	8	539260	539267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014364	CTT	2	6	541729	541734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014364	A	6	6	541739	541744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014364	CCACC	2	10	542448	542457	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1043	NC_014364	CCT	2	6	544699	544704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_014364	ATA	2	6	544741	544746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014364	ATC	2	6	544762	544767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014364	AT	3	6	544812	544817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014364	TAT	2	6	544851	544856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014364	ATG	2	6	544882	544887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014364	ATTT	2	8	544889	544896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014364	TATT	2	8	544899	544906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014364	GAG	2	6	544989	544994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014364	CAG	2	6	545007	545012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014364	CT	3	6	545048	545053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_014364	TAC	2	6	545061	545066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014364	GA	3	6	545091	545096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014364	CTTC	2	8	545128	545135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_014364	TCC	2	6	547579	547584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_014364	TGA	2	6	547612	547617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014364	AGG	2	6	547647	547652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014364	GCC	2	6	548979	548984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_014364	GGC	2	6	549002	549007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014364	GAA	2	6	550246	550251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014364	ATCT	2	8	550264	550271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_014364	T	6	6	550288	550293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014364	TCT	2	6	552407	552412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014364	TA	3	6	552431	552436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014364	AAG	2	6	552448	552453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014364	T	7	7	555653	555659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014364	CGAA	2	8	555677	555684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_014364	AAAAG	2	10	557496	557505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014364	AGG	2	6	557524	557529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014364	A	6	6	559024	559029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014364	TTTTAG	2	12	559059	559070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014364	GCA	2	6	559188	559193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014364	CAT	2	6	559237	559242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014364	TTG	2	6	559339	559344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014364	TGA	2	6	559364	559369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014364	T	6	6	559393	559398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014364	ATTT	2	8	559403	559410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014364	TGCG	2	8	560364	560371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_014364	ACA	2	6	560425	560430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014364	CAG	2	6	560560	560565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014364	GAT	2	6	560672	560677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014364	TTG	2	6	566140	566145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014364	TC	3	6	569520	569525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_014364	AGG	2	6	571333	571338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014364	TTG	2	6	571356	571361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014364	CT	3	6	571377	571382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_014364	TCATA	2	10	571395	571404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_014364	T	6	6	571475	571480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014364	ATA	2	6	571482	571487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014364	TA	3	6	571486	571491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014364	CCT	2	6	580956	580961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_014364	GGAG	2	8	580986	580993	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014364	TCT	2	6	581033	581038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_014364	CCG	2	6	581113	581118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_014364	TCCC	2	8	581133	581140	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1098	NC_014364	GAA	2	6	581143	581148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014364	AG	3	6	581192	581197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014364	CT	3	6	581217	581222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_014364	GGT	2	6	581223	581228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014364	AGA	2	6	581246	581251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014364	GTA	2	6	584737	584742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014364	ATG	2	6	586692	586697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014364	ATTCTT	2	12	587494	587505	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1106	NC_014364	AGG	2	6	590807	590812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014364	AGG	2	6	591998	592003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014364	CGTA	2	8	592045	592052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_014364	AGG	2	6	592071	592076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014364	GTG	2	6	593176	593181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014364	CAC	2	6	593194	593199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_014364	GAA	2	6	593216	593221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014364	GAGC	2	8	595126	595133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_014364	AGG	2	6	595924	595929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014364	TGG	2	6	601619	601624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014364	TG	4	8	601629	601636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014364	GGA	2	6	602533	602538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014364	GTT	2	6	605734	605739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014364	TAT	2	6	606924	606929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014364	ACA	2	6	611631	611636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014364	ATT	2	6	611651	611656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014364	AAGAG	2	10	611905	611914	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014364	TTG	2	6	611956	611961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014364	GAT	2	6	614902	614907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014364	TA	3	6	615448	615453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014364	TCCT	2	8	618183	618190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_014364	TCC	2	6	619186	619191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1128	NC_014364	TCC	2	6	620612	620617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_014364	GTT	2	6	620618	620623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014364	ACAA	2	8	620638	620645	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_014364	A	6	6	620667	620672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014364	ACA	2	6	621130	621135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014364	ATAA	2	8	621152	621159	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014364	TG	3	6	621176	621181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014364	T	6	6	621206	621211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014364	TCA	2	6	621297	621302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_014364	TGA	2	6	621424	621429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_014364	ACC	2	6	621444	621449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_014364	CGA	2	6	621466	621471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1141	NC_014364	CGG	2	6	621513	621518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1142	NC_014364	AAT	2	6	621548	621553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_014364	GGA	2	6	625454	625459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1145	NC_014364	GTT	2	6	626042	626047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1151	NC_014364	T	7	7	627167	627173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1152	NC_014364	ATA	2	6	627185	627190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1157	NC_014364	TCG	2	6	629735	629740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1161	NC_014364	T	6	6	629785	629790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_014364	G	6	6	629838	629843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_014364	ACA	2	6	629849	629854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1165	NC_014364	TTG	2	6	629862	629867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_014364	CGT	2	6	629910	629915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1173	NC_014364	TCC	2	6	630272	630277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1174	NC_014364	TCT	2	6	630315	630320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1179	NC_014364	GATG	3	12	632997	633008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1180	NC_014364	ATGC	2	8	633032	633039	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1182	NC_014364	GAG	2	6	633184	633189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1188	NC_014364	GTTTT	2	10	639526	639535	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1193	NC_014364	TGCT	2	8	643342	643349	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1197	NC_014364	CCT	2	6	644063	644068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1412	NC_014364	ATA	2	6	729341	729346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_014364	TGCA	2	8	729355	729362	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1415	NC_014364	CTA	2	6	729670	729675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1417	NC_014364	GCT	2	6	729686	729691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1419	NC_014364	TGAT	2	8	729822	729829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1422	NC_014364	CAAT	2	8	729876	729883	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1430	NC_014364	TACAA	2	10	732303	732312	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1432	NC_014364	AT	3	6	732371	732376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_014364	CAGG	2	8	732451	732458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1444	NC_014364	TG	3	6	738397	738402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_014364	TGC	2	6	738426	738431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_014364	TGA	2	6	746956	746961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_014364	TAG	2	6	746996	747001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1458	NC_014364	TGG	2	6	749492	749497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1471	NC_014364	ATA	2	6	760766	760771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1472	NC_014364	ATA	2	6	760777	760782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1473	NC_014364	AGG	2	6	760786	760791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1483	NC_014364	ATTT	2	8	773692	773699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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