MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014364	T	6	6	339172	339177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014364	G	6	6	340474	340479	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014364	ATG	2	6	341881	341886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014364	CTC	2	6	345219	345224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_014364	TAC	2	6	345275	345280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014364	T	6	6	346629	346634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014364	ACT	2	6	346644	346649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014364	GTG	2	6	346653	346658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014364	AAT	2	6	347565	347570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014364	TA	3	6	350795	350800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014364	AGG	2	6	350827	350832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014364	ATGAA	2	10	351402	351411	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014364	A	8	8	351490	351497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014364	GGA	2	6	351498	351503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014364	TTC	2	6	352643	352648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014364	AGG	2	6	356415	356420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014364	ATG	2	6	359089	359094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014364	TGG	2	6	359141	359146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014364	CTG	2	6	359170	359175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014364	AGC	2	6	359235	359240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014364	A	6	6	359324	359329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014364	TTA	2	6	361565	361570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014364	TC	3	6	361577	361582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_014364	GA	3	6	361599	361604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014364	TA	3	6	361606	361611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014364	ATA	2	6	361614	361619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014364	CAA	2	6	366074	366079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_014364	GAA	2	6	367512	367517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014364	A	6	6	367516	367521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014364	T	6	6	367549	367554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014364	GGAAG	2	10	369458	369467	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014364	CAC	2	6	369479	369484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_014364	A	7	7	369511	369517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014364	TCC	2	6	374202	374207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_014364	CT	3	6	374304	374309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_014364	GGA	2	6	374314	374319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014364	GCG	2	6	375229	375234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014364	AGA	2	6	377313	377318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014364	GTT	2	6	377326	377331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014364	GCG	2	6	377340	377345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_014364	AGG	2	6	377423	377428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014364	TCC	2	6	380532	380537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_014364	A	6	6	380572	380577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014364	GAA	2	6	380585	380590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014364	TTG	2	6	380594	380599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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547	NC_014364	TCT	3	9	380607	380615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014364	AG	4	8	380627	380634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014364	AGG	2	6	380636	380641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014364	CTA	2	6	382991	382996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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552	NC_014364	T	6	6	383011	383016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014364	AGG	2	6	383061	383066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014364	TGG	2	6	384666	384671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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560	NC_014364	TGG	2	6	386879	386884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014364	TTC	2	6	386905	386910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014364	ACC	2	6	386991	386996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_014364	TC	3	6	387154	387159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_014364	TAA	2	6	387171	387176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014364	T	6	6	387181	387186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014364	AGG	2	6	388291	388296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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569	NC_014364	AGA	2	6	393373	393378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014364	AT	3	6	393395	393400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014364	ACC	2	6	393438	393443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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576	NC_014364	GAG	2	6	397528	397533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_014364	GCCGC	2	10	398008	398017	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
580	NC_014364	GCG	3	9	398033	398041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_014364	GCC	2	6	398081	398086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
583	NC_014364	C	6	6	398101	398106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
584	NC_014364	AT	3	6	398127	398132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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586	NC_014364	A	8	8	398178	398185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_014364	AGG	2	6	398281	398286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014364	GGGTCC	2	12	398297	398308	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_014364	CCT	2	6	399518	399523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_014364	AT	3	6	399552	399557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014364	GATA	2	8	399559	399566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014364	AAT	2	6	399626	399631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_014364	AAT	2	6	401273	401278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014364	ATTAA	2	10	401290	401299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014364	ATCG	2	8	402246	402253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_014364	ATG	2	6	402383	402388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014364	GCA	2	6	402499	402504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014364	ATC	2	6	402530	402535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014364	GCA	2	6	402593	402598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_014364	ACG	2	6	402620	402625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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607	NC_014364	TCGA	2	8	402751	402758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_014364	GA	3	6	402770	402775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_014364	GAT	2	6	402941	402946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014364	TCT	2	6	402971	402976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_014364	GT	3	6	403027	403032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014364	GTAA	2	8	403053	403060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014364	T	6	6	403156	403161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014364	GTAGC	2	10	403216	403225	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
616	NC_014364	TTG	2	6	403321	403326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014364	GGA	2	6	403342	403347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014364	TGTA	2	8	403349	403356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014364	TCT	2	6	403412	403417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_014364	AAAG	2	8	403468	403475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014364	CAC	2	6	403501	403506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_014364	AGTA	2	8	403520	403527	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014364	CAT	2	6	403640	403645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014364	TTG	2	6	403719	403724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014364	AAT	2	6	403730	403735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014364	GTAT	2	8	403736	403743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014364	GAA	2	6	403789	403794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014364	GA	3	6	403795	403800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014364	TAT	2	6	403804	403809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014364	TA	3	6	403812	403817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014364	TA	3	6	405003	405008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014364	GTTG	2	8	405113	405120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014364	AGC	2	6	405123	405128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014364	ATGTT	2	10	405168	405177	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014364	TGAAAA	2	12	406506	406517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014364	ATGTT	2	10	406600	406609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014364	GCAG	2	8	408319	408326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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639	NC_014364	ATT	2	6	408421	408426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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