MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014364	TA	3	6	3617351	3617356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014364	ATT	2	6	3617362	3617367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_014364	ATC	2	6	3617425	3617430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_014364	TAT	2	6	3617518	3617523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_014364	AAG	2	6	3617599	3617604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014364	GTC	3	9	3617626	3617634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014364	GGAA	2	8	3617711	3617718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_014364	GTAG	2	8	3617785	3617792	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_014364	TCC	2	6	3619167	3619172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_014364	CGA	2	6	3619187	3619192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_014364	TC	3	6	3619214	3619219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_014364	TTC	2	6	3619224	3619229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_014364	TCA	2	6	3619760	3619765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014364	CGT	2	6	3619837	3619842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_014364	CGG	2	6	3619844	3619849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014364	CGG	2	6	3619865	3619870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_014364	CCT	2	6	3621210	3621215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_014364	CGA	2	6	3621252	3621257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014364	A	6	6	3622255	3622260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014364	CCT	2	6	3622261	3622266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_014364	T	6	6	3622316	3622321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014364	TGG	2	6	3622338	3622343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_014364	ATGC	2	8	3622345	3622352	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6024	NC_014364	CAT	2	6	3622514	3622519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014364	AAT	2	6	3623242	3623247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014364	ATACA	2	10	3623256	3623265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6027	NC_014364	TTA	2	6	3623297	3623302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014364	CTC	2	6	3623513	3623518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_014364	AGC	2	6	3623568	3623573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_014364	AC	3	6	3623622	3623627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_014364	TGG	2	6	3623639	3623644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014364	GAAG	2	8	3623675	3623682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014364	GAA	2	6	3623739	3623744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_014364	AGC	2	6	3623799	3623804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_014364	ATG	2	6	3623833	3623838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014364	GGA	2	6	3623856	3623861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014364	ATA	2	6	3623868	3623873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_014364	AGG	2	6	3623936	3623941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_014364	AAACC	2	10	3624516	3624525	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6040	NC_014364	AAT	2	6	3624553	3624558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014364	GGTA	2	8	3624637	3624644	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_014364	T	6	6	3624649	3624654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014364	GCC	2	6	3624699	3624704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_014364	GGC	2	6	3624724	3624729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014364	ATT	2	6	3624737	3624742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014364	T	6	6	3624741	3624746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014364	TCG	2	6	3626237	3626242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_014364	AATA	2	8	3628065	3628072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014364	T	7	7	3628082	3628088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_014364	AATT	2	8	3628104	3628111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014364	A	6	6	3628181	3628186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014364	GCT	2	6	3628229	3628234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014364	T	7	7	3628234	3628240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014364	TTA	2	6	3628270	3628275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_014364	TG	3	6	3629964	3629969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_014364	TC	3	6	3629991	3629996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_014364	CA	3	6	3630023	3630028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_014364	TATT	2	8	3630067	3630074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014364	A	7	7	3630118	3630124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014364	C	8	8	3630169	3630176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6061	NC_014364	TGAT	2	8	3630202	3630209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_014364	GAA	2	6	3631342	3631347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014364	AAC	2	6	3634291	3634296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_014364	TACA	2	8	3635815	3635822	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_014364	GCG	2	6	3636999	3637004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_014364	TAT	2	6	3638331	3638336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014364	CAG	2	6	3638846	3638851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_014364	C	7	7	3639774	3639780	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6069	NC_014364	TTA	2	6	3639786	3639791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_014364	A	6	6	3639807	3639812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014364	AAT	2	6	3639827	3639832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_014364	AT	3	6	3639870	3639875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_014364	ATT	2	6	3639880	3639885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_014364	GGA	2	6	3639944	3639949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_014364	AGC	2	6	3641082	3641087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_014364	CTA	2	6	3641114	3641119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_014364	GAA	2	6	3641176	3641181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_014364	GAG	2	6	3642129	3642134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014364	GCTAA	2	10	3642139	3642148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6080	NC_014364	CTG	2	6	3642163	3642168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014364	AAT	2	6	3642181	3642186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014364	GAT	2	6	3642189	3642194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014364	GTG	2	6	3642240	3642245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014364	GTAT	2	8	3642249	3642256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014364	TAT	2	6	3642280	3642285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014364	TACAG	2	10	3642319	3642328	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6087	NC_014364	CTC	2	6	3642450	3642455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_014364	ATCAG	2	10	3642486	3642495	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6089	NC_014364	TC	3	6	3642526	3642531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_014364	T	8	8	3642538	3642545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014364	T	6	6	3642687	3642692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014364	T	6	6	3642714	3642719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014364	GAAAA	2	10	3644455	3644464	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014364	TGA	2	6	3646679	3646684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014364	TTC	2	6	3646721	3646726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_014364	TAT	2	6	3646852	3646857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_014364	GCA	2	6	3647969	3647974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014364	GCA	2	6	3648090	3648095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014364	GCC	2	6	3648177	3648182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_014364	TCG	2	6	3648288	3648293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_014364	GAT	2	6	3648347	3648352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_014364	CTTGAC	2	12	3648353	3648364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_014364	TGA	2	6	3648422	3648427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_014364	TACC	2	8	3648460	3648467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_014364	CTG	2	6	3648501	3648506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014364	G	6	6	3648601	3648606	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_014364	ATT	2	6	3648627	3648632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014364	ATCG	2	8	3648642	3648649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6109	NC_014364	TCT	2	6	3648711	3648716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_014364	AGA	2	6	3648742	3648747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014364	TCC	2	6	3648834	3648839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_014364	ACT	2	6	3648858	3648863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_014364	CCA	2	6	3648890	3648895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_014364	ATC	2	6	3648904	3648909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_014364	CAG	2	6	3648927	3648932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_014364	AGC	2	6	3649051	3649056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_014364	T	6	6	3649066	3649071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_014364	GAA	2	6	3649237	3649242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_014364	TCAA	2	8	3649254	3649261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_014364	ATT	2	6	3649292	3649297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014364	CTG	2	6	3649339	3649344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014364	TCA	2	6	3649432	3649437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014364	A	7	7	3650409	3650415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_014364	TAT	2	6	3650419	3650424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_014364	A	6	6	3653589	3653594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_014364	ATT	2	6	3653612	3653617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_014364	T	7	7	3653629	3653635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_014364	TCA	2	6	3653672	3653677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_014364	AT	3	6	3653709	3653714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_014364	GCT	2	6	3653715	3653720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_014364	ATA	2	6	3653721	3653726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6254	NC_014364	T	6	6	3723091	3723096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_014364	TAAA	2	8	3723117	3723124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6256	NC_014364	TTA	2	6	3723135	3723140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_014364	AAT	2	6	3723168	3723173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NC_014364	TAAT	2	8	3723187	3723194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_014364	T	7	7	3723199	3723205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_014364	ATT	2	6	3723210	3723215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6261	NC_014364	ATC	2	6	3723259	3723264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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