MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014364	C	6	6	3321736	3321741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5502	NC_014364	TC	3	6	3321820	3321825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_014364	TGAA	2	8	3321829	3321836	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_014364	CGC	2	6	3321842	3321847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_014364	A	7	7	3321863	3321869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_014364	A	7	7	3321871	3321877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_014364	GTTT	2	8	3323350	3323357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_014364	TA	3	6	3323366	3323371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_014364	TCAA	2	8	3324057	3324064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_014364	ATA	2	6	3324080	3324085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_014364	ATT	2	6	3324089	3324094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014364	TTA	2	6	3324095	3324100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014364	CAA	2	6	3324156	3324161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_014364	AAC	2	6	3324202	3324207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_014364	TC	3	6	3324213	3324218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_014364	AAC	2	6	3324277	3324282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_014364	ATA	2	6	3324323	3324328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_014364	CGT	2	6	3324438	3324443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_014364	ACG	2	6	3324445	3324450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_014364	A	7	7	3324568	3324574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014364	A	6	6	3324699	3324704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_014364	CTG	2	6	3324835	3324840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_014364	GAA	2	6	3324854	3324859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_014364	ACT	2	6	3324886	3324891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_014364	GGA	2	6	3324894	3324899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_014364	ATA	2	6	3326104	3326109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014364	TAAT	2	8	3326122	3326129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_014364	GTTT	2	8	3326135	3326142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_014364	AGT	2	6	3326336	3326341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_014364	C	6	6	3326908	3326913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5531	NC_014364	TTC	2	6	3337756	3337761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_014364	ACC	2	6	3337790	3337795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_014364	AGC	2	6	3337818	3337823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_014364	TAC	2	6	3337839	3337844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_014364	GTG	2	6	3337856	3337861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_014364	AG	4	8	3337946	3337953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_014364	CAC	2	6	3337972	3337977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_014364	TCA	2	6	3338075	3338080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_014364	CCT	2	6	3339423	3339428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_014364	AAT	2	6	3339458	3339463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_014364	A	6	6	3339473	3339478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_014364	GTG	2	6	3341098	3341103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_014364	TTAT	2	8	3341134	3341141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_014364	CAC	2	6	3342294	3342299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_014364	ACT	2	6	3342310	3342315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_014364	AAG	2	6	3342321	3342326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_014364	TCA	2	6	3342386	3342391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_014364	GGA	2	6	3342409	3342414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_014364	TCGA	2	8	3343903	3343910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5550	NC_014364	TCC	2	6	3349495	3349500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_014364	A	7	7	3353261	3353267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014364	ATC	2	6	3353337	3353342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_014364	AAAGA	2	10	3353420	3353429	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_014364	TTG	2	6	3353470	3353475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014364	A	6	6	3353485	3353490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_014364	AG	3	6	3354289	3354294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_014364	GCA	2	6	3354295	3354300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_014364	AG	3	6	3355608	3355613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_014364	GTG	2	6	3357558	3357563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_014364	CTTG	2	8	3357606	3357613	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_014364	ACT	2	6	3357688	3357693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_014364	T	7	7	3357695	3357701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_014364	CAC	2	6	3357814	3357819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_014364	A	6	6	3357839	3357844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_014364	ACTA	2	8	3357878	3357885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_014364	TAC	2	6	3357893	3357898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5569	NC_014364	AGG	2	6	3363780	3363785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_014364	GTT	2	6	3364651	3364656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5572	NC_014364	GTG	2	6	3364765	3364770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_014364	TCT	2	6	3364792	3364797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5575	NC_014364	TAA	2	6	3364865	3364870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_014364	CAC	2	6	3364877	3364882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_014364	CCAG	2	8	3364958	3364965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5579	NC_014364	TCT	2	6	3367329	3367334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_014364	T	6	6	3367336	3367341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_014364	A	6	6	3367387	3367392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_014364	GAG	2	6	3367393	3367398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_014364	CCT	2	6	3372279	3372284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_014364	CTA	2	6	3372297	3372302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_014364	TAC	2	6	3373482	3373487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_014364	GGC	2	6	3373558	3373563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5588	NC_014364	T	7	7	3373688	3373694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_014364	GCA	2	6	3373718	3373723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5593	NC_014364	CTT	2	6	3373849	3373854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_014364	T	6	6	3373853	3373858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_014364	TC	4	8	3376015	3376022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_014364	CTT	2	6	3377045	3377050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_014364	TAA	3	9	3382027	3382035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5599	NC_014364	CGT	2	6	3382073	3382078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_014364	TTG	2	6	3383249	3383254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_014364	TCA	2	6	3383282	3383287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_014364	CTA	2	6	3398263	3398268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_014364	CAC	2	6	3402301	3402306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_014364	A	7	7	3402324	3402330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_014364	AT	3	6	3402602	3402607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_014364	CTG	2	6	3402617	3402622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_014364	AAG	2	6	3402624	3402629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_014364	TC	3	6	3404255	3404260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_014364	TA	3	6	3404281	3404286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_014364	GAT	2	6	3404352	3404357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_014364	ATT	2	6	3406047	3406052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_014364	TTA	2	6	3407054	3407059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_014364	TAT	2	6	3409401	3409406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_014364	A	6	6	3409431	3409436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_014364	CTG	2	6	3409442	3409447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_014364	AAG	2	6	3409455	3409460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_014364	CCT	2	6	3410398	3410403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_014364	AAAT	2	8	3411375	3411382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_014364	AAT	2	6	3412489	3412494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_014364	CA	3	6	3413365	3413370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5622	NC_014364	ATC	2	6	3413412	3413417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_014364	ATC	2	6	3413420	3413425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_014364	TCA	2	6	3414433	3414438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_014364	TGT	2	6	3414523	3414528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_014364	GGA	2	6	3414544	3414549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_014364	AG	3	6	3417041	3417046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_014364	CT	4	8	3420759	3420766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_014364	CAT	2	6	3421545	3421550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5630	NC_014364	GGA	2	6	3421600	3421605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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