MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014364	CT	3	6	3013412	3013417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_014364	GCC	2	6	3013422	3013427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_014364	ATC	2	6	3013431	3013436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_014364	GGA	2	6	3013499	3013504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014364	AGG	2	6	3013639	3013644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014364	TTC	2	6	3015320	3015325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_014364	TAA	2	6	3015329	3015334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_014364	AT	3	6	3015337	3015342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014364	ACT	2	6	3015435	3015440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_014364	TTG	2	6	3015465	3015470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014364	AGT	2	6	3015497	3015502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_014364	TGA	2	6	3015511	3015516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014364	GCTTTC	2	12	3016648	3016659	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_014364	CTT	2	6	3016670	3016675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_014364	TTA	2	6	3018248	3018253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014364	AT	3	6	3018266	3018271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014364	CATAA	2	10	3018284	3018293	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5018	NC_014364	GTC	2	6	3018302	3018307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_014364	TTC	2	6	3018331	3018336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_014364	TAA	2	6	3018362	3018367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014364	ACA	2	6	3018376	3018381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_014364	TA	3	6	3018452	3018457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_014364	ACT	2	6	3018473	3018478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_014364	CAA	2	6	3018488	3018493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_014364	A	7	7	3018492	3018498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014364	CT	4	8	3018503	3018510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_014364	T	7	7	3018535	3018541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014364	GTCG	2	8	3018560	3018567	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_014364	TGA	2	6	3018589	3018594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014364	CTG	2	6	3018655	3018660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_014364	ACA	2	6	3018678	3018683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_014364	CAT	2	6	3018688	3018693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_014364	CTG	2	6	3018787	3018792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_014364	AAT	2	6	3018820	3018825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_014364	AAT	2	6	3018831	3018836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_014364	TTTTGT	2	12	3018850	3018861	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_014364	CAT	2	6	3019049	3019054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_014364	GGTAGT	2	12	3019115	3019126	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014364	AAT	2	6	3019130	3019135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_014364	GAA	2	6	3019164	3019169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014364	AATC	2	8	3020395	3020402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_014364	CTTT	2	8	3020416	3020423	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_014364	CAC	2	6	3020473	3020478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_014364	CGA	2	6	3020499	3020504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_014364	CTT	2	6	3020515	3020520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_014364	ATTC	2	8	3020537	3020544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_014364	AGA	2	6	3020562	3020567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014364	TCT	2	6	3020644	3020649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_014364	CAC	2	6	3020753	3020758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_014364	ATA	2	6	3020850	3020855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_014364	CAA	2	6	3020874	3020879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_014364	GTT	2	6	3020989	3020994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014364	ATC	2	6	3021803	3021808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_014364	T	6	6	3021825	3021830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_014364	AAG	2	6	3021875	3021880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_014364	CTC	2	6	3021884	3021889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_014364	ATCCA	2	10	3021891	3021900	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5058	NC_014364	TGG	2	6	3021938	3021943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014364	ATT	3	9	3021962	3021970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014364	TACA	2	8	3022857	3022864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_014364	CGAAGG	2	12	3022928	3022939	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5062	NC_014364	ATC	2	6	3022960	3022965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_014364	A	6	6	3023007	3023012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_014364	ATT	2	6	3023065	3023070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014364	TTTA	2	8	3023071	3023078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_014364	ATTA	2	8	3023100	3023107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014364	TTC	2	6	3023145	3023150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_014364	AT	4	8	3023170	3023177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_014364	ATA	2	6	3023792	3023797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_014364	T	7	7	3023831	3023837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014364	GCA	2	6	3023890	3023895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_014364	CTCA	2	8	3023962	3023969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_014364	AG	3	6	3024010	3024015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_014364	TCT	2	6	3024491	3024496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_014364	CTT	2	6	3024570	3024575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_014364	GAC	2	6	3024576	3024581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_014364	TAT	2	6	3024599	3024604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014364	AT	3	6	3024603	3024608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014364	CT	3	6	3024612	3024617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_014364	ATT	2	6	3024658	3024663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014364	ATA	2	6	3025614	3025619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_014364	ATT	2	6	3025633	3025638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_014364	A	8	8	3025658	3025665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_014364	GGT	2	6	3025701	3025706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_014364	AC	3	6	3029134	3029139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5086	NC_014364	CAT	2	6	3029144	3029149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_014364	A	6	6	3031397	3031402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014364	C	6	6	3031408	3031413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5089	NC_014364	ATC	2	6	3037516	3037521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_014364	T	6	6	3037529	3037534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_014364	CTC	2	6	3039366	3039371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_014364	AAT	2	6	3040164	3040169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014364	GTT	2	6	3041369	3041374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014364	GAA	2	6	3045820	3045825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014364	CTG	2	6	3045871	3045876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_014364	GTG	2	6	3045886	3045891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_014364	TCT	2	6	3046019	3046024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_014364	CAC	3	9	3046047	3046055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_014364	ACT	2	6	3046066	3046071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5100	NC_014364	AGG	2	6	3062462	3062467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014364	AGC	2	6	3063382	3063387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_014364	AGG	2	6	3064282	3064287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014364	A	6	6	3071560	3071565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_014364	TGG	2	6	3071636	3071641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_014364	CCGAT	2	10	3071659	3071668	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5106	NC_014364	TCC	2	6	3072003	3072008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_014364	AAC	2	6	3075293	3075298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_014364	TCC	2	6	3076028	3076033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_014364	TCT	2	6	3076055	3076060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_014364	CGGA	2	8	3076061	3076068	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5111	NC_014364	AG	3	6	3076134	3076139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014364	CAT	2	6	3078167	3078172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_014364	TGG	2	6	3078573	3078578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_014364	TC	3	6	3078600	3078605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_014364	A	6	6	3078729	3078734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_014364	TC	3	6	3078739	3078744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_014364	C	6	6	3078753	3078758	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5118	NC_014364	TCC	2	6	3078959	3078964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_014364	ACT	2	6	3078979	3078984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_014364	CCT	2	6	3081003	3081008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_014364	AAAAC	2	10	3081012	3081021	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5122	NC_014364	T	6	6	3081782	3081787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014364	TTC	2	6	3081853	3081858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_014364	AGGA	2	8	3087619	3087626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014364	AGG	2	6	3087704	3087709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014364	CGG	2	6	3089720	3089725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_014364	GCC	2	6	3089731	3089736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_014364	T	7	7	3089739	3089745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014364	AGC	2	6	3091463	3091468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014364	T	7	7	3094097	3094103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014364	CCTA	2	8	3094114	3094121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5139	NC_014364	T	6	6	3104257	3104262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5155	NC_014364	A	8	8	3117225	3117232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5253	NC_014364	T	6	6	3176550	3176555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_014364	TG	3	6	3176570	3176575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_014364	TA	3	6	3192767	3192772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5266	NC_014364	GTAC	2	8	3192799	3192806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5267	NC_014364	AAG	2	6	3194514	3194519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5287	NC_014364	GAAGG	2	10	3202219	3202228	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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5304	NC_014364	TCC	2	6	3223447	3223452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5309	NC_014364	AT	3	6	3223609	3223614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5323	NC_014364	A	7	7	3226905	3226911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5334	NC_014364	ATTTT	2	10	3232279	3232288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5348	NC_014364	A	7	7	3237446	3237452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5353	NC_014364	GCAG	2	8	3238180	3238187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5354	NC_014364	AGTA	2	8	3238191	3238198	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5355	NC_014364	GCAT	2	8	3238215	3238222	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5359	NC_014364	TCC	2	6	3239191	3239196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5384	NC_014364	ATTT	2	8	3250131	3250138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_014364	GAT	2	6	3250153	3250158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5389	NC_014364	ACC	2	6	3250457	3250462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5390	NC_014364	GTA	2	6	3250469	3250474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_014364	A	6	6	3253722	3253727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5393	NC_014364	AAT	2	6	3255271	3255276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5395	NC_014364	TGA	2	6	3258397	3258402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5403	NC_014364	CCT	2	6	3272130	3272135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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