MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta smaragdinae DSM 11293 chromosome

Total Repeats: 7742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014364	CAAG	2	8	2731731	2731738	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_014364	GTCA	2	8	2731798	2731805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4503	NC_014364	AAC	2	6	2731819	2731824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014364	TTC	2	6	2731864	2731869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_014364	GA	3	6	2731923	2731928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014364	TCGA	2	8	2732033	2732040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4507	NC_014364	TCC	2	6	2732055	2732060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_014364	GTTC	2	8	2732092	2732099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4509	NC_014364	ATG	2	6	2732129	2732134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014364	TG	3	6	2732199	2732204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014364	GTA	2	6	2732205	2732210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_014364	GAT	2	6	2732289	2732294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_014364	GA	3	6	2732318	2732323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_014364	AAC	2	6	2732326	2732331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014364	ACT	2	6	2732430	2732435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_014364	TC	3	6	2732456	2732461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_014364	T	6	6	2732466	2732471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014364	TCCTT	2	10	2732486	2732495	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4519	NC_014364	ATA	2	6	2732519	2732524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014364	AAAGA	2	10	2732533	2732542	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_014364	AAG	2	6	2732828	2732833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_014364	A	7	7	2732891	2732897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014364	CAA	2	6	2733006	2733011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_014364	TAC	2	6	2733023	2733028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_014364	TATT	2	8	2733044	2733051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_014364	A	8	8	2733103	2733110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_014364	T	7	7	2733140	2733146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_014364	TCTTT	2	10	2733151	2733160	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4529	NC_014364	TC	3	6	2733190	2733195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_014364	TC	4	8	2733326	2733333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_014364	ATT	2	6	2733351	2733356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014364	CTC	2	6	2733384	2733389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_014364	ATA	2	6	2733410	2733415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014364	TTA	2	6	2733438	2733443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014364	TAA	2	6	2733501	2733506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014364	AACA	2	8	2733539	2733546	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_014364	AGA	2	6	2733560	2733565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014364	AGC	2	6	2734592	2734597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_014364	GAA	2	6	2734714	2734719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014364	TCA	2	6	2734749	2734754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_014364	AAT	2	6	2734845	2734850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_014364	TGA	2	6	2734877	2734882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014364	ATT	2	6	2734998	2735003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014364	T	7	7	2735090	2735096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014364	GGAAA	2	10	2735858	2735867	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014364	AG	3	6	2735898	2735903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_014364	TGC	2	6	2735904	2735909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014364	T	6	6	2737218	2737223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014364	ATA	2	6	2737303	2737308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014364	TGC	2	6	2737314	2737319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_014364	TCT	2	6	2737342	2737347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_014364	CTC	2	6	2739856	2739861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_014364	TCC	2	6	2744208	2744213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4554	NC_014364	GATT	2	8	2744234	2744241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014364	TTA	2	6	2748792	2748797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014364	AT	3	6	2756416	2756421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_014364	ATAG	2	8	2756436	2756443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_014364	AT	3	6	2756474	2756479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_014364	ATTAAT	2	12	2756481	2756492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014364	ATA	2	6	2756497	2756502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014364	AAAG	2	8	2756517	2756524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014364	AT	3	6	2757224	2757229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_014364	TTAAT	2	10	2757239	2757248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014364	AAT	2	6	2758281	2758286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_014364	GCT	2	6	2758414	2758419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_014364	CTG	2	6	2758422	2758427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_014364	ACA	2	6	2759440	2759445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_014364	TTTA	2	8	2759450	2759457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_014364	ATA	2	6	2759539	2759544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014364	CAT	2	6	2759545	2759550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_014364	TTG	2	6	2759648	2759653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_014364	TCC	2	6	2761525	2761530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_014364	TATG	2	8	2761531	2761538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014364	ATA	2	6	2761570	2761575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_014364	ATT	2	6	2761582	2761587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014364	AAAT	2	8	2761597	2761604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_014364	AT	3	6	2761612	2761617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_014364	TA	3	6	2761622	2761627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014364	ATT	2	6	2761628	2761633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014364	TAC	2	6	2761670	2761675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_014364	CAT	2	6	2761677	2761682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_014364	GAA	2	6	2761765	2761770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_014364	ATC	2	6	2763766	2763771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_014364	TAG	2	6	2763778	2763783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_014364	GGA	2	6	2765879	2765884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_014364	ACC	2	6	2765894	2765899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_014364	A	7	7	2767124	2767130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_014364	A	6	6	2768702	2768707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_014364	TTC	2	6	2768737	2768742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_014364	CTT	2	6	2768813	2768818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_014364	ATC	2	6	2768850	2768855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_014364	GAG	2	6	2768875	2768880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014364	T	7	7	2769934	2769940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014364	CAC	2	6	2769945	2769950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_014364	TAG	2	6	2770803	2770808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014364	GAG	2	6	2770876	2770881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_014364	T	6	6	2771647	2771652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014364	T	6	6	2772857	2772862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014364	GATG	2	8	2774872	2774879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014364	ACC	2	6	2774899	2774904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_014364	TTC	2	6	2774928	2774933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_014364	T	7	7	2774937	2774943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014364	A	6	6	2774945	2774950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_014364	CGG	2	6	2775050	2775055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_014364	T	6	6	2775081	2775086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014364	AGG	2	6	2775129	2775134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014364	AGT	2	6	2776017	2776022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_014364	AGG	2	6	2776095	2776100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014364	CTC	2	6	2776110	2776115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_014364	GAAG	2	8	2776128	2776135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014364	AGA	2	6	2776146	2776151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014364	TTC	2	6	2776164	2776169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_014364	AGG	2	6	2776231	2776236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014364	T	6	6	2777133	2777138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014364	T	7	7	2777170	2777176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014364	GGT	2	6	2777184	2777189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014364	CTTT	2	8	2784849	2784856	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4618	NC_014364	CTC	2	6	2788520	2788525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4619	NC_014364	ATC	2	6	2788533	2788538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_014364	ATT	2	6	2788542	2788547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014364	AAG	2	6	2788560	2788565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014364	TA	3	6	2788611	2788616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_014364	AT	3	6	2788626	2788631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_014364	T	6	6	2788648	2788653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_014364	TATGC	2	10	2788660	2788669	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4626	NC_014364	AGG	2	6	2788683	2788688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014364	CCA	2	6	2793430	2793435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4628	NC_014364	AGT	2	6	2793447	2793452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_014364	CTG	2	6	2798427	2798432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_014364	ACC	2	6	2800191	2800196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_014364	AAGA	2	8	2800666	2800673	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_014364	GTCG	2	8	2800676	2800683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_014364	CAA	2	6	2800685	2800690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4899	NC_014364	TTG	2	6	2918868	2918873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4900	NC_014364	ATGG	2	8	2918912	2918919	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4901	NC_014364	TCA	2	6	2918970	2918975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4902	NC_014364	AGA	2	6	2918992	2918997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4931	NC_014364	GAG	2	6	2946136	2946141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4998	NC_014364	TGG	2	6	2991589	2991594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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