MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 6044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014251	TTA	2	6	1368643	1368648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014251	TTAA	2	8	1368679	1368686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014251	A	6	6	1368744	1368749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014251	CATT	2	8	1368791	1368798	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_014251	TTAA	2	8	1372262	1372269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014251	A	6	6	1372319	1372324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014251	TTTC	2	8	1372332	1372339	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_014251	CTG	2	6	1372352	1372357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_014251	CAA	2	6	1372363	1372368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_014251	TGA	2	6	1373797	1373802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014251	A	7	7	1373857	1373863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014251	TC	4	8	1373897	1373904	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_014251	GAC	2	6	1373927	1373932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_014251	TA	3	6	1373990	1373995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014251	AAGAAA	2	12	1373998	1374009	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014251	AGTT	2	8	1374093	1374100	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014251	TAA	2	6	1375444	1375449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014251	TCTTT	2	10	1375530	1375539	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4019	NC_014251	GCT	2	6	1375603	1375608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_014251	GAGCT	2	10	1376316	1376325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4021	NC_014251	ACAA	2	8	1377208	1377215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_014251	A	7	7	1377240	1377246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014251	ATA	2	6	1377255	1377260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014251	A	7	7	1377311	1377317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014251	T	7	7	1378699	1378705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014251	A	6	6	1378732	1378737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014251	AAC	2	6	1378775	1378780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_014251	T	6	6	1378789	1378794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014251	CCTCT	2	10	1381168	1381177	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4030	NC_014251	ACTAT	2	10	1381197	1381206	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4031	NC_014251	CAAA	2	8	1381210	1381217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4032	NC_014251	TGAA	2	8	1384860	1384867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_014251	A	6	6	1384866	1384871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014251	T	7	7	1384898	1384904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014251	T	8	8	1384907	1384914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014251	CTTTTT	2	12	1385749	1385760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4037	NC_014251	T	6	6	1385791	1385796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014251	GAAATA	2	12	1385797	1385808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_014251	GGA	2	6	1385812	1385817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014251	AAT	2	6	1387931	1387936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014251	GGA	2	6	1388027	1388032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014251	TA	3	6	1388167	1388172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014251	AGC	2	6	1388221	1388226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_014251	AGCT	2	8	1388231	1388238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_014251	A	7	7	1388277	1388283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014251	CAT	2	6	1388320	1388325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_014251	AATT	2	8	1388869	1388876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014251	T	6	6	1388941	1388946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014251	T	7	7	1388959	1388965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014251	TCC	2	6	1392527	1392532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_014251	CCT	2	6	1393500	1393505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_014251	A	6	6	1393522	1393527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014251	A	6	6	1393529	1393534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014251	TG	3	6	1393559	1393564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014251	TTTC	2	8	1397229	1397236	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4056	NC_014251	T	6	6	1397241	1397246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014251	TAAAAA	2	12	1397284	1397295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014251	ATT	2	6	1397319	1397324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014251	TAT	2	6	1397582	1397587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014251	TTTC	2	8	1397629	1397636	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_014251	TCC	2	6	1400369	1400374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_014251	AAG	2	6	1400387	1400392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014251	TAT	2	6	1402232	1402237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014251	ATA	2	6	1402273	1402278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014251	TAA	2	6	1406199	1406204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_014251	A	6	6	1406203	1406208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_014251	GATT	2	8	1406218	1406225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014251	TCC	2	6	1407987	1407992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4069	NC_014251	AAAGA	2	10	1408015	1408024	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014251	ACA	2	6	1408057	1408062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_014251	AG	3	6	1408065	1408070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014251	TC	3	6	1408130	1408135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4073	NC_014251	TTA	2	6	1408161	1408166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014251	A	7	7	1408183	1408189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014251	TCC	2	6	1409036	1409041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_014251	TTAC	2	8	1409061	1409068	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_014251	T	6	6	1409282	1409287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014251	TTTA	2	8	1409292	1409299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014251	TTC	2	6	1409913	1409918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_014251	CCT	2	6	1411929	1411934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_014251	ACTA	2	8	1412181	1412188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4082	NC_014251	ATT	2	6	1412265	1412270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014251	CAA	2	6	1412274	1412279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_014251	ACA	2	6	1412304	1412309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_014251	CT	3	6	1415203	1415208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NC_014251	ATT	2	6	1415212	1415217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_014251	GAA	2	6	1415226	1415231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_014251	A	6	6	1415230	1415235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_014251	CCAA	2	8	1415838	1415845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_014251	A	6	6	1415875	1415880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014251	AGGT	2	8	1415993	1416000	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_014251	AAGC	2	8	1416455	1416462	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4093	NC_014251	TGG	2	6	1416463	1416468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014251	TGG	2	6	1416484	1416489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014251	ATC	2	6	1416521	1416526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_014251	GTC	2	6	1416536	1416541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_014251	TGC	2	6	1416550	1416555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_014251	CTTGGT	2	12	1416566	1416577	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4099	NC_014251	GAAAA	2	10	1417125	1417134	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014251	TCA	2	6	1417171	1417176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_014251	TA	3	6	1417315	1417320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014251	CTT	2	6	1417352	1417357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_014251	TA	4	8	1417360	1417367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014251	CTT	2	6	1417403	1417408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_014251	T	6	6	1417407	1417412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014251	CTTTTT	2	12	1417429	1417440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4107	NC_014251	TTA	2	6	1417499	1417504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014251	TTC	2	6	1417510	1417515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_014251	TCA	2	6	1418310	1418315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_014251	CT	3	6	1418399	1418404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_014251	CT	3	6	1419420	1419425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4112	NC_014251	TAT	2	6	1419444	1419449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014251	CTT	2	6	1421948	1421953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_014251	CCTA	2	8	1421958	1421965	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_014251	A	7	7	1422014	1422020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014251	T	7	7	1423489	1423495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014251	CTA	2	6	1423499	1423504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_014251	A	7	7	1423512	1423518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014251	GAA	2	6	1423521	1423526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014251	T	6	6	1426320	1426325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014251	ACT	2	6	1426326	1426331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_014251	TCTAT	2	10	1426332	1426341	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4123	NC_014251	A	7	7	1426343	1426349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014251	TCT	2	6	1426374	1426379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_014251	ACC	2	6	1426493	1426498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_014251	AAG	2	6	1429781	1429786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014251	CTT	2	6	1429797	1429802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_014251	A	6	6	1434137	1434142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014251	T	7	7	1434166	1434172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_014251	TTC	2	6	1434878	1434883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_014251	TAA	2	6	1434891	1434896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014251	AT	3	6	1435127	1435132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_014251	TCC	2	6	1435134	1435139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4135	NC_014251	A	7	7	1435187	1435193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4400	NC_014251	ATTTG	2	10	1533439	1533448	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_014251	AAAC	2	8	1533470	1533477	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4500	NC_014251	CTTTT	2	10	1573977	1573986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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