MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 6044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014251	ATG	2	6	303915	303920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014251	ATT	2	6	303934	303939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014251	A	6	6	303976	303981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014251	TAA	2	6	304085	304090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014251	ATTT	2	8	304120	304127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014251	A	6	6	304154	304159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014251	T	7	7	304213	304219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014251	GGGA	2	8	304237	304244	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014251	GAAG	2	8	304260	304267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014251	GTT	2	6	304300	304305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014251	TA	3	6	304366	304371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014251	TGAC	2	8	304374	304381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_014251	AGC	2	6	304420	304425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014251	AGAGG	2	10	306645	306654	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014251	AAT	2	6	308025	308030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014251	TTC	2	6	308050	308055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014251	T	6	6	308062	308067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014251	CTA	2	6	308090	308095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014251	T	6	6	308118	308123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014251	T	6	6	308126	308131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014251	ATAG	2	8	312681	312688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014251	TGA	2	6	312724	312729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014251	A	6	6	314226	314231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014251	TGA	2	6	315805	315810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014251	TTG	2	6	315849	315854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014251	GAA	2	6	317977	317982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014251	TTTC	2	8	317988	317995	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_014251	T	6	6	317997	318002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014251	T	6	6	318040	318045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014251	AAT	2	6	318061	318066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014251	GTC	2	6	319391	319396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014251	GTG	2	6	319397	319402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014251	CCG	2	6	319597	319602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_014251	GAT	2	6	319620	319625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014251	TGG	2	6	319687	319692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_014251	CTG	2	6	319693	319698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_014251	AAG	2	6	321594	321599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014251	A	6	6	322918	322923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014251	T	6	6	322953	322958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014251	A	6	6	327007	327012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014251	TAA	2	6	327016	327021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014251	A	7	7	327026	327032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014251	A	6	6	327067	327072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014251	AT	5	10	327076	327085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014251	TTCTAT	2	12	327102	327113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1046	NC_014251	TAA	2	6	327177	327182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014251	A	7	7	327989	327995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014251	TAG	2	6	327996	328001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014251	A	6	6	328012	328017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014251	AAT	2	6	328022	328027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014251	ATT	2	6	328088	328093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014251	TG	3	6	328161	328166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_014251	TAAT	2	8	328232	328239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014251	AAC	2	6	328242	328247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014251	A	7	7	330549	330555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_014251	AGC	2	6	332841	332846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014251	ATTCA	2	10	332880	332889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_014251	TA	3	6	332920	332925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014251	TCCCAT	2	12	332951	332962	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_014251	GTTT	2	8	334231	334238	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014251	GA	3	6	334243	334248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_014251	TAAAAT	2	12	335328	335339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014251	TGA	2	6	335356	335361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014251	TAT	2	6	335383	335388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_014251	TTATC	2	10	335402	335411	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1067	NC_014251	TA	3	6	335463	335468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014251	TAA	2	6	335476	335481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014251	AAT	2	6	335483	335488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014251	TAA	2	6	336381	336386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014251	AAG	2	6	336467	336472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_014251	TATCA	2	10	338647	338656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_014251	TGA	2	6	338659	338664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_014251	T	6	6	339001	339006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014251	T	6	6	341153	341158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014251	A	6	6	341462	341467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014251	TCA	2	6	342589	342594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_014251	AAC	2	6	345701	345706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014251	CTTT	2	8	345724	345731	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1090	NC_014251	ATC	2	6	345747	345752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_014251	TG	3	6	347608	347613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014251	CAG	2	6	347620	347625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1096	NC_014251	TTA	2	6	348377	348382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_014251	GTT	2	6	348788	348793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014251	ACT	2	6	348809	348814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014251	TCT	2	6	349039	349044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_014251	TA	3	6	349067	349072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014251	GAT	2	6	349210	349215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014251	GTT	2	6	349646	349651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014251	ATAAA	2	10	349694	349703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014251	TTTG	2	8	349720	349727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014251	GTG	2	6	349731	349736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014251	T	6	6	349771	349776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014251	TAACC	2	10	349792	349801	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1112	NC_014251	TAA	2	6	349819	349824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014251	A	6	6	349846	349851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014251	AGG	2	6	350824	350829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014251	TG	3	6	351800	351805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014251	ATTC	2	8	353513	353520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1117	NC_014251	T	7	7	353578	353584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014251	AAAT	2	8	353671	353678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014251	ATAA	2	8	353714	353721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014251	A	6	6	353720	353725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014251	GAA	2	6	354945	354950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014251	GTTT	2	8	354957	354964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014251	TGTA	2	8	354993	355000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014251	T	6	6	355910	355915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014251	ATA	2	6	355973	355978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014251	TAT	2	6	356017	356022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014251	ATG	2	6	356065	356070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014251	GGTAT	2	10	356076	356085	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014251	T	8	8	356120	356127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014251	AAT	2	6	356155	356160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014251	AT	3	6	356184	356189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014251	AGG	2	6	356211	356216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1134	NC_014251	ACAA	2	8	356487	356494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_014251	TGA	2	6	356521	356526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014251	AT	3	6	356549	356554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014251	A	6	6	358523	358528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_014251	CAG	2	6	358597	358602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1416	NC_014251	AG	3	6	417472	417477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_014251	T	6	6	421219	421224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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