MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 6044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014251	CCG	2	6	2086629	2086634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_014251	CT	3	6	2086685	2086690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_014251	TTC	2	6	2086712	2086717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_014251	TCGC	2	8	2086790	2086797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_014251	CTA	2	6	2086800	2086805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_014251	TCC	2	6	2086866	2086871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_014251	ATC	2	6	2086938	2086943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014251	CTTA	2	8	2086945	2086952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_014251	TCG	2	6	2086970	2086975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014251	TCG	2	6	2086989	2086994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_014251	TTA	2	6	2087027	2087032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_014251	TTA	2	6	2087070	2087075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_014251	TAC	2	6	2087077	2087082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_014251	TC	3	6	2087154	2087159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_014251	CCT	2	6	2087192	2087197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_014251	TCCTTA	2	12	2087276	2087287	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_014251	AGG	2	6	2087291	2087296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_014251	ATC	2	6	2087347	2087352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014251	GGC	2	6	2087365	2087370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_014251	GTG	2	6	2087417	2087422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014251	GT	3	6	2087432	2087437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014251	GT	3	6	2087601	2087606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_014251	ATG	2	6	2087626	2087631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_014251	TCC	2	6	2087652	2087657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_014251	TTA	2	6	2087661	2087666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014251	ATG	2	6	2087696	2087701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014251	CACGA	2	10	2087751	2087760	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6028	NC_014251	GAC	2	6	2087764	2087769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_014251	CAC	2	6	2087777	2087782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_014251	TTC	2	6	2087852	2087857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_014251	AG	3	6	2088091	2088096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014251	TCC	2	6	2088116	2088121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6033	NC_014251	AT	3	6	2088122	2088127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_014251	CTA	2	6	2088199	2088204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_014251	GCT	2	6	2088305	2088310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_014251	TTC	2	6	2088379	2088384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_014251	ACA	2	6	2088389	2088394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_014251	CTT	2	6	2088415	2088420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014251	CTG	2	6	2088474	2088479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_014251	TCG	2	6	2088549	2088554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_014251	CCA	2	6	2088573	2088578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_014251	CAGG	2	8	2088700	2088707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_014251	AAGC	2	8	2088748	2088755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6044	NC_014251	TCC	2	6	2088756	2088761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.