MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 6723

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014220	CTTA	2	8	1338024	1338031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_014220	TAT	2	6	1338118	1338123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_014220	GAG	2	6	1338130	1338135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014220	AAT	2	6	1340297	1340302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014220	ATA	2	6	1340383	1340388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014220	TGC	2	6	1340424	1340429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014220	CG	3	6	1340442	1340447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3508	NC_014220	GC	3	6	1340466	1340471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_014220	ATT	2	6	1341558	1341563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014220	TAT	2	6	1342173	1342178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014220	CGC	2	6	1342353	1342358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3512	NC_014220	CAC	2	6	1342362	1342367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_014220	AAG	2	6	1342378	1342383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_014220	AAT	2	6	1342451	1342456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_014220	ATT	2	6	1342514	1342519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_014220	A	6	6	1342530	1342535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014220	GTG	2	6	1342563	1342568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_014220	C	6	6	1344420	1344425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3519	NC_014220	CT	3	6	1344449	1344454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_014220	TGA	2	6	1346302	1346307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014220	CAA	2	6	1346324	1346329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_014220	ACC	2	6	1346373	1346378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_014220	CGC	2	6	1346488	1346493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_014220	GCA	2	6	1346513	1346518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_014220	AAC	2	6	1346536	1346541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_014220	C	6	6	1346576	1346581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3527	NC_014220	GCC	2	6	1346640	1346645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_014220	GAC	2	6	1346665	1346670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_014220	CTTC	2	8	1346714	1346721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_014220	G	6	6	1346794	1346799	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014220	GTC	2	6	1346894	1346899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_014220	CAC	2	6	1346902	1346907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_014220	TGA	2	6	1346943	1346948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_014220	GGGC	2	8	1347099	1347106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_014220	GGA	2	6	1347160	1347165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_014220	GC	3	6	1347171	1347176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_014220	TCC	2	6	1347182	1347187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_014220	TCC	2	6	1347233	1347238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_014220	C	6	6	1347237	1347242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3540	NC_014220	CGA	2	6	1347315	1347320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_014220	CTT	2	6	1347327	1347332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_014220	CCG	2	6	1347382	1347387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_014220	CCTCC	2	10	1347414	1347423	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3544	NC_014220	CTT	2	6	1347450	1347455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_014220	GCC	2	6	1347474	1347479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_014220	CTT	2	6	1347489	1347494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_014220	CTTC	2	8	1347501	1347508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_014220	GA	3	6	1347526	1347531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_014220	CGC	2	6	1347561	1347566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_014220	CAGAG	2	10	1347597	1347606	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3551	NC_014220	AAGGC	2	10	1347608	1347617	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3552	NC_014220	CAA	2	6	1347631	1347636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_014220	TCT	2	6	1347637	1347642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_014220	TCC	2	6	1347669	1347674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_014220	GAAG	2	8	1347688	1347695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014220	GCC	2	6	1347719	1347724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_014220	CTG	2	6	1347740	1347745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_014220	CAG	2	6	1348035	1348040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_014220	TTAA	2	8	1348135	1348142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014220	C	6	6	1348157	1348162	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3561	NC_014220	CCTCC	2	10	1349026	1349035	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3562	NC_014220	TGA	2	6	1349086	1349091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014220	TTCG	2	8	1349142	1349149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_014220	GT	3	6	1349155	1349160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014220	TCC	2	6	1349200	1349205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3566	NC_014220	GTC	3	9	1349221	1349229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_014220	CTA	2	6	1349266	1349271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_014220	GGTA	2	8	1349294	1349301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014220	TCC	2	6	1352089	1352094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_014220	GTT	2	6	1352103	1352108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014220	CT	3	6	1352203	1352208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_014220	ATA	2	6	1352975	1352980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014220	ATT	2	6	1352997	1353002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014220	TTCTC	2	10	1353005	1353014	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3575	NC_014220	TC	4	8	1353011	1353018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_014220	ATT	2	6	1353021	1353026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_014220	T	6	6	1353031	1353036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_014220	T	6	6	1353046	1353051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_014220	TTG	2	6	1353125	1353130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014220	CAT	2	6	1354002	1354007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_014220	CGC	2	6	1354048	1354053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_014220	CCA	2	6	1354152	1354157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_014220	CTT	2	6	1354199	1354204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_014220	CAA	2	6	1354322	1354327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_014220	CTTT	2	8	1354334	1354341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3586	NC_014220	TTA	2	6	1354413	1354418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014220	CAA	2	6	1354426	1354431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_014220	TTCG	2	8	1354461	1354468	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_014220	CCT	2	6	1354537	1354542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_014220	GGA	2	6	1354601	1354606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014220	TA	3	6	1354628	1354633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014220	GAA	2	6	1354685	1354690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014220	ACG	2	6	1354768	1354773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_014220	CCG	2	6	1354840	1354845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_014220	TGC	2	6	1354861	1354866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_014220	CAG	2	6	1356668	1356673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_014220	CAT	2	6	1356687	1356692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_014220	TCT	2	6	1356908	1356913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014220	CTT	2	6	1356934	1356939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_014220	ATC	2	6	1360179	1360184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014220	AGC	2	6	1360351	1360356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014220	TCAA	2	8	1361758	1361765	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_014220	T	6	6	1362533	1362538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014220	CTT	2	6	1362586	1362591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_014220	AT	3	6	1362640	1362645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014220	CTG	2	6	1362656	1362661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_014220	CCT	2	6	1363056	1363061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_014220	AAT	2	6	1363069	1363074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014220	TC	3	6	1363564	1363569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_014220	C	7	7	1364258	1364264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3611	NC_014220	GCT	2	6	1364323	1364328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_014220	CCA	2	6	1364410	1364415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_014220	T	6	6	1370090	1370095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014220	TTC	2	6	1370115	1370120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_014220	GCA	2	6	1370148	1370153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_014220	AAG	2	6	1370186	1370191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_014220	ATG	2	6	1370255	1370260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014220	GAT	2	6	1370273	1370278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_014220	ACCCC	2	10	1370323	1370332	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3620	NC_014220	AAAAC	2	10	1370333	1370342	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3621	NC_014220	CG	3	6	1370354	1370359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_014220	TTGTA	2	10	1370393	1370402	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_014220	AAAT	2	8	1370420	1370427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014220	CTA	2	6	1371254	1371259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_014220	TCAAT	2	10	1372357	1372366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3626	NC_014220	CGCCA	2	10	1372405	1372414	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3627	NC_014220	GCC	2	6	1372445	1372450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_014220	GCT	2	6	1372469	1372474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014220	C	6	6	1373877	1373882	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3630	NC_014220	CTC	2	6	1375491	1375496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3632	NC_014220	CCTT	2	8	1375611	1375618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3889	NC_014220	TA	3	6	1451054	1451059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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