MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Starkeya novella DSM 506 chromosome

Total Repeats: 12180

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014217	ATC	2	6	245081	245086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014217	GAGG	2	8	245132	245139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014217	TCCT	2	8	245168	245175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
504	NC_014217	GAG	2	6	245182	245187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014217	GGC	2	6	245197	245202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014217	GTCG	2	8	245219	245226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
507	NC_014217	GCGA	2	8	247153	247160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
508	NC_014217	GGCC	2	8	247213	247220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_014217	CGGC	2	8	247223	247230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
510	NC_014217	CGG	2	6	247265	247270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014217	AAC	2	6	247282	247287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014217	GCCC	2	8	247322	247329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
513	NC_014217	GAAG	2	8	247362	247369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014217	GCG	2	6	249667	249672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014217	GAG	2	6	249688	249693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014217	AAC	2	6	250147	250152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014217	CGC	2	6	250374	250379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_014217	GAT	2	6	250389	250394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014217	TCCT	2	8	252708	252715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_014217	GC	3	6	252814	252819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_014217	CGA	2	6	254114	254119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014217	CCGCC	2	10	254121	254130	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
523	NC_014217	GGT	2	6	254346	254351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014217	ATC	2	6	255796	255801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_014217	GCG	2	6	257089	257094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014217	TGCTCC	2	12	257096	257107	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
527	NC_014217	AGCG	2	8	258013	258020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
528	NC_014217	CGG	2	6	259045	259050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014217	CGG	2	6	259101	259106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_014217	GTC	2	6	259637	259642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014217	GCC	2	6	261091	261096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_014217	TCA	2	6	261143	261148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014217	AAGTC	2	10	261195	261204	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
534	NC_014217	GCT	2	6	262289	262294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_014217	GCC	2	6	262333	262338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_014217	CG	3	6	262340	262345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
537	NC_014217	GCC	2	6	262358	262363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_014217	CG	4	8	262366	262373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_014217	TGT	2	6	262376	262381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014217	CGCC	2	8	262387	262394	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
541	NC_014217	CTCTT	2	10	262403	262412	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
542	NC_014217	GGC	2	6	262432	262437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014217	CGCGG	2	10	262441	262450	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
544	NC_014217	CGG	2	6	262460	262465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014217	TCC	2	6	262697	262702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_014217	GCC	2	6	262710	262715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_014217	ATC	2	6	262742	262747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014217	GCG	2	6	262802	262807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014217	GAT	2	6	262885	262890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014217	CGT	2	6	263598	263603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014217	TTTG	2	8	263639	263646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014217	CCGG	2	8	263668	263675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_014217	TGC	2	6	263737	263742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014217	GAC	2	6	263757	263762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014217	GAC	2	6	263774	263779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_014217	CCG	2	6	265179	265184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_014217	GC	3	6	265222	265227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
558	NC_014217	CCT	2	6	266620	266625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014217	CG	4	8	269118	269125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_014217	CG	3	6	269155	269160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_014217	GCCT	2	8	269187	269194	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_014217	CGG	2	6	269976	269981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014217	CGG	2	6	270026	270031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014217	GGA	2	6	270038	270043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014217	CAT	2	6	271518	271523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014217	GCC	2	6	271538	271543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_014217	CG	3	6	271544	271549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_014217	CGG	2	6	271589	271594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_014217	GCCG	2	8	271609	271616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_014217	GAT	2	6	271626	271631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014217	CCG	2	6	271728	271733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014217	GCGCG	2	10	271776	271785	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
573	NC_014217	CGGG	2	8	271831	271838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
574	NC_014217	CGGC	2	8	271897	271904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
575	NC_014217	TCC	2	6	271994	271999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_014217	CAGC	2	8	272005	272012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_014217	CGATCC	2	12	272032	272043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
578	NC_014217	CGG	2	6	272050	272055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014217	TCG	2	6	276785	276790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_014217	CGC	2	6	276791	276796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_014217	GCC	2	6	278045	278050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_014217	GC	3	6	278066	278071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_014217	CCCG	2	8	278089	278096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
584	NC_014217	CCGGC	2	10	279574	279583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
585	NC_014217	GC	4	8	279633	279640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
586	NC_014217	GCG	2	6	279706	279711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014217	GC	3	6	279713	279718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_014217	GTCC	2	8	279735	279742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_014217	CGT	2	6	280287	280292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_014217	AG	3	6	280311	280316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014217	CCAC	2	8	280343	280350	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
592	NC_014217	CTT	2	6	280436	280441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_014217	GCC	2	6	280537	280542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_014217	CGG	2	6	280545	280550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014217	GGT	2	6	280564	280569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014217	AGC	2	6	281689	281694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014217	GC	3	6	281693	281698	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_014217	TGG	2	6	281738	281743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014217	GCC	2	6	281746	281751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_014217	AGG	2	6	281851	281856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014217	GC	3	6	281866	281871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
602	NC_014217	AGGATG	2	12	281912	281923	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014217	TTG	2	6	281926	281931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014217	TG	3	6	281930	281935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014217	GCT	2	6	281945	281950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014217	CCG	4	12	281963	281974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_014217	GC	3	6	281982	281987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_014217	CG	3	6	282035	282040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
609	NC_014217	GGC	2	6	284518	284523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_014217	TCG	2	6	284556	284561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_014217	TTG	2	6	284606	284611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014217	CTG	2	6	284831	284836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014217	CGTC	2	8	284972	284979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
614	NC_014217	GCC	2	6	285002	285007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_014217	TGC	2	6	285021	285026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_014217	CTG	2	6	287349	287354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_014217	CGG	2	6	288347	288352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014217	GCC	2	6	288360	288365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_014217	GCCG	2	8	288433	288440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_014217	GCG	2	6	291002	291007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014217	CGC	2	6	300072	300077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_014217	G	6	6	300090	300095	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014217	GAC	2	6	300490	300495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014217	C	6	6	300511	300516	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
625	NC_014217	TGCC	2	8	300532	300539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_014217	AT	3	6	300575	300580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014217	TC	3	6	300609	300614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
628	NC_014217	CCCGA	2	10	301141	301150	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
629	NC_014217	CCGG	2	8	301223	301230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_014217	ACCT	2	8	301319	301326	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_014217	TCCC	2	8	301357	301364	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
632	NC_014217	GTC	2	6	301376	301381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014217	GTCG	2	8	303388	303395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
634	NC_014217	CG	3	6	303401	303406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_014217	GCA	2	6	303449	303454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_014217	ACGA	2	8	303551	303558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_014217	CGG	2	6	303581	303586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_014217	GAC	2	6	304477	304482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_014217	CGG	2	6	304499	304504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014217	TGC	2	6	304518	304523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_014217	CGG	2	6	304562	304567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_014217	CGG	2	6	304706	304711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_014217	GGC	2	6	304725	304730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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650	NC_014217	GA	3	6	304901	304906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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666	NC_014217	CG	4	8	308944	308951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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673	NC_014217	CGG	2	6	314211	314216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_014217	GGCG	2	8	314221	314228	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
675	NC_014217	CCGT	2	8	314232	314239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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682	NC_014217	GGC	2	6	319663	319668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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692	NC_014217	GACA	2	8	323331	323338	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
693	NC_014217	GCC	2	6	323922	323927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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755	NC_014217	CCG	2	6	337479	337484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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767	NC_014217	CGC	2	6	339811	339816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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770	NC_014217	CG	3	6	341535	341540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
771	NC_014217	GCGT	2	8	342745	342752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
772	NC_014217	TGA	2	6	342768	342773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
773	NC_014217	T	7	7	342823	342829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_014217	TAA	2	6	342834	342839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_014217	CCG	2	6	402500	402505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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941	NC_014217	CCG	3	9	420273	420281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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944	NC_014217	CG	3	6	420353	420358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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952	NC_014217	GCG	2	6	425080	425085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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