MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 7138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014168	C	6	6	1242473	1242478	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3002	NC_014168	ACA	2	6	1242494	1242499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_014168	CGC	2	6	1247079	1247084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_014168	GC	3	6	1247083	1247088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_014168	TGTCG	2	10	1249844	1249853	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3006	NC_014168	GCC	2	6	1249960	1249965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_014168	GGC	2	6	1249977	1249982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_014168	GAT	2	6	1249986	1249991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014168	GGAT	2	8	1250001	1250008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014168	GAGC	2	8	1250012	1250019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_014168	GCC	2	6	1250057	1250062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3012	NC_014168	GCTG	2	8	1250067	1250074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_014168	CCA	2	6	1250087	1250092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_014168	GCG	2	6	1250138	1250143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_014168	GAT	2	6	1250165	1250170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014168	CCGCG	2	10	1250198	1250207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3017	NC_014168	GCG	2	6	1250221	1250226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_014168	GC	3	6	1250259	1250264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_014168	CGG	3	9	1250298	1250306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_014168	CCGC	2	8	1250731	1250738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3021	NC_014168	CGG	2	6	1250874	1250879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_014168	CTG	2	6	1250941	1250946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_014168	ACA	2	6	1253943	1253948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_014168	CAG	2	6	1253949	1253954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014168	CTG	2	6	1253997	1254002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_014168	GCC	2	6	1254889	1254894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_014168	CG	3	6	1255494	1255499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_014168	GCG	2	6	1255544	1255549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_014168	TGC	2	6	1255566	1255571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_014168	GCT	2	6	1256157	1256162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_014168	CGG	2	6	1256167	1256172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_014168	GCC	2	6	1256187	1256192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_014168	CGG	2	6	1256203	1256208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014168	T	6	6	1256250	1256255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014168	GAC	2	6	1256280	1256285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_014168	ACC	2	6	1256398	1256403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3037	NC_014168	GC	3	6	1256422	1256427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_014168	GCG	2	6	1256701	1256706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_014168	CTG	2	6	1261463	1261468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_014168	CTC	2	6	1261481	1261486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3041	NC_014168	CCACG	2	10	1263158	1263167	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3042	NC_014168	GCA	2	6	1263188	1263193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_014168	TTA	2	6	1263209	1263214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014168	CCT	2	6	1263581	1263586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_014168	AC	3	6	1263610	1263615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_014168	ATT	2	6	1263985	1263990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014168	GCC	2	6	1264055	1264060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_014168	GTT	2	6	1265039	1265044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014168	CGT	2	6	1265050	1265055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014168	ACT	2	6	1265068	1265073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_014168	GCG	2	6	1265116	1265121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014168	CGC	2	6	1265933	1265938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_014168	AAGC	2	8	1265940	1265947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_014168	GTCG	2	8	1265965	1265972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_014168	CAG	2	6	1265987	1265992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_014168	CAG	2	6	1266017	1266022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_014168	GC	3	6	1271309	1271314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3058	NC_014168	CGA	2	6	1271386	1271391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_014168	GCG	2	6	1271410	1271415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_014168	TCG	2	6	1271564	1271569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014168	CGG	2	6	1271581	1271586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_014168	GCG	2	6	1271604	1271609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_014168	GC	3	6	1271657	1271662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_014168	CTC	2	6	1271669	1271674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_014168	CGGG	2	8	1271742	1271749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_014168	GCCC	2	8	1271764	1271771	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3067	NC_014168	GCG	2	6	1271793	1271798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014168	GGCGC	2	10	1275211	1275220	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3069	NC_014168	GC	4	8	1275217	1275224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_014168	TTG	2	6	1275229	1275234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014168	CGC	2	6	1275480	1275485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_014168	G	6	6	1275556	1275561	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014168	GGC	3	9	1275566	1275574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_014168	GCC	2	6	1278664	1278669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_014168	CGC	2	6	1281653	1281658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_014168	GCA	2	6	1281692	1281697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014168	CGG	2	6	1281706	1281711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_014168	CGG	2	6	1281714	1281719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_014168	CGC	2	6	1281722	1281727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_014168	GCA	2	6	1281764	1281769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014168	TGG	2	6	1281772	1281777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014168	GTG	2	6	1281786	1281791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014168	GCG	2	6	1281816	1281821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_014168	TGA	2	6	1281848	1281853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014168	GCAG	2	8	1281884	1281891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3086	NC_014168	AAC	2	6	1283065	1283070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_014168	CGG	3	9	1283205	1283213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_014168	CAA	2	6	1283228	1283233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_014168	TTCC	2	8	1283708	1283715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_014168	CGG	2	6	1283779	1283784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_014168	CCG	3	9	1283812	1283820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_014168	GCG	2	6	1283830	1283835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_014168	TCGG	2	8	1286113	1286120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3094	NC_014168	TGCGTT	2	12	1286136	1286147	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3095	NC_014168	GC	3	6	1286175	1286180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3096	NC_014168	CTT	2	6	1286201	1286206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014168	GGCGA	2	10	1286269	1286278	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3098	NC_014168	GCA	2	6	1286315	1286320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_014168	GCA	2	6	1286346	1286351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_014168	TGC	2	6	1286420	1286425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_014168	GA	3	6	1286468	1286473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014168	CGTC	2	8	1286547	1286554	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_014168	TACT	2	8	1286577	1286584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_014168	TCG	2	6	1286629	1286634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3105	NC_014168	GAG	2	6	1286641	1286646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014168	GCG	2	6	1291131	1291136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_014168	TG	3	6	1291137	1291142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014168	TCG	2	6	1291150	1291155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_014168	CG	3	6	1291191	1291196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_014168	GCTC	2	8	1291231	1291238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3111	NC_014168	GA	3	6	1291287	1291292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014168	CGC	2	6	1292250	1292255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_014168	GCG	2	6	1293095	1293100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_014168	GCC	2	6	1293123	1293128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_014168	AGA	2	6	1293169	1293174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014168	ATT	2	6	1293188	1293193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014168	GCA	2	6	1293207	1293212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3118	NC_014168	GTG	2	6	1293284	1293289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014168	CGC	2	6	1293309	1293314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_014168	CGC	2	6	1293369	1293374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_014168	GCC	2	6	1293436	1293441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_014168	CCGC	2	8	1293442	1293449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3123	NC_014168	ATG	2	6	1294047	1294052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014168	CAA	2	6	1294062	1294067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_014168	CCGAG	2	10	1294085	1294094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3126	NC_014168	GA	3	6	1294109	1294114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014168	GAG	2	6	1294145	1294150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014168	GC	3	6	1296518	1296523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_014168	CAG	2	6	1297392	1297397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_014168	CAG	2	6	1297949	1297954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_014168	CTT	2	6	1297960	1297965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_014168	CTG	2	6	1297972	1297977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3254	NC_014168	GA	4	8	1358004	1358011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_014168	AGC	2	6	1358021	1358026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3256	NC_014168	A	6	6	1361065	1361070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_014168	TAT	2	6	1361086	1361091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_014168	ATG	2	6	1361131	1361136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_014168	GC	3	6	1361998	1362003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_014168	CA	3	6	1365886	1365891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3262	NC_014168	CTCC	2	8	1367472	1367479	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3383	NC_014168	TGCG	2	8	1413748	1413755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3388	NC_014168	CAC	2	6	1415651	1415656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3393	NC_014168	CG	3	6	1421914	1421919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3394	NC_014168	CCGA	2	8	1421956	1421963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3395	NC_014168	GGC	2	6	1421991	1421996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3396	NC_014168	GCG	2	6	1422013	1422018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3397	NC_014168	TGC	3	9	1422024	1422032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3398	NC_014168	CGAGA	2	10	1422043	1422052	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3399	NC_014168	AGGGC	2	10	1422053	1422062	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3400	NC_014168	GAC	2	6	1422094	1422099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3402	NC_014168	CAC	2	6	1422281	1422286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3403	NC_014168	A	7	7	1422346	1422352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3425	NC_014168	TCCG	2	8	1433295	1433302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3426	NC_014168	GAG	2	6	1433313	1433318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3431	NC_014168	CCG	2	6	1440442	1440447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3434	NC_014168	CGG	2	6	1441014	1441019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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