MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Segniliparus rotundus DSM 44985 chromosome

Total Repeats: 7138

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014168	CAGG	2	8	2001238	2001245	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_014168	GCC	2	6	2002310	2002315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_014168	CGC	2	6	2002329	2002334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_014168	GCG	2	6	2002382	2002387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_014168	TG	3	6	2002402	2002407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_014168	TC	3	6	2003291	2003296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_014168	GC	3	6	2003354	2003359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4508	NC_014168	GCG	3	9	2004956	2004964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_014168	GA	3	6	2006389	2006394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014168	GCTT	2	8	2009912	2009919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_014168	CCT	2	6	2009925	2009930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_014168	CAGCC	2	10	2009943	2009952	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4513	NC_014168	GTC	2	6	2009974	2009979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_014168	CGG	2	6	2010970	2010975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014168	A	6	6	2010991	2010996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014168	ACG	2	6	2011023	2011028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_014168	GCA	2	6	2011029	2011034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_014168	ACG	2	6	2017940	2017945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_014168	GAAG	2	8	2017999	2018006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014168	TCA	2	6	2018536	2018541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_014168	GC	3	6	2018942	2018947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_014168	CG	4	8	2018969	2018976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_014168	CAC	2	6	2018994	2018999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4524	NC_014168	GCT	2	6	2019014	2019019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_014168	GCGG	2	8	2019028	2019035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_014168	CGG	2	6	2019051	2019056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_014168	CAC	2	6	2019134	2019139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_014168	CT	3	6	2019154	2019159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_014168	GGA	3	9	2019160	2019168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_014168	CG	3	6	2019220	2019225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_014168	CCG	2	6	2019239	2019244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_014168	GAAG	2	8	2019246	2019253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_014168	GTCG	2	8	2019267	2019274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_014168	CACG	2	8	2021587	2021594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4535	NC_014168	ATCG	2	8	2021598	2021605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4536	NC_014168	GCT	2	6	2021676	2021681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_014168	GCG	2	6	2021702	2021707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_014168	CAG	2	6	2022124	2022129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_014168	AG	3	6	2022128	2022133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014168	CG	4	8	2023135	2023142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_014168	TCC	2	6	2024020	2024025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4542	NC_014168	GCG	2	6	2026403	2026408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_014168	CGT	2	6	2026425	2026430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_014168	GCA	2	6	2030545	2030550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_014168	GC	3	6	2030564	2030569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_014168	CAT	2	6	2034756	2034761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_014168	GC	3	6	2034838	2034843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_014168	GCC	2	6	2034922	2034927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_014168	CTG	2	6	2034928	2034933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_014168	GTT	2	6	2037905	2037910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014168	TGT	2	6	2040327	2040332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014168	GCA	2	6	2040398	2040403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_014168	CA	3	6	2040432	2040437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_014168	CGT	2	6	2040477	2040482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_014168	AAG	2	6	2040544	2040549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014168	CGG	2	6	2040580	2040585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_014168	CG	3	6	2040586	2040591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_014168	CGG	2	6	2040618	2040623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_014168	GCG	2	6	2041416	2041421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_014168	GA	3	6	2041426	2041431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014168	GCA	2	6	2041453	2041458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_014168	CGCCGG	2	12	2041463	2041474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_014168	GC	3	6	2041483	2041488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_014168	CGCA	2	8	2041557	2041564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_014168	AG	3	6	2041567	2041572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_014168	TAC	2	6	2046111	2046116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_014168	A	6	6	2046140	2046145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_014168	TCA	2	6	2046152	2046157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_014168	GATATT	2	12	2046173	2046184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014168	TGG	2	6	2048045	2048050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_014168	CGC	2	6	2048949	2048954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_014168	CGC	2	6	2049682	2049687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_014168	GCG	2	6	2049691	2049696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_014168	GGGCG	2	10	2049730	2049739	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4575	NC_014168	GGC	2	6	2049740	2049745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_014168	GTT	2	6	2049771	2049776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_014168	GAGC	2	8	2049850	2049857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_014168	CGCC	2	8	2050208	2050215	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4579	NC_014168	GGGC	2	8	2050226	2050233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4580	NC_014168	T	6	6	2050253	2050258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014168	GAA	2	6	2051919	2051924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014168	GGC	2	6	2051929	2051934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_014168	GCC	2	6	2051947	2051952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_014168	CTT	2	6	2051956	2051961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_014168	GCTC	2	8	2051969	2051976	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_014168	CTC	2	6	2052287	2052292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_014168	AC	3	6	2052329	2052334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_014168	ACC	2	6	2052370	2052375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_014168	TG	3	6	2052380	2052385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_014168	TTC	2	6	2052501	2052506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_014168	A	6	6	2052508	2052513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_014168	AC	4	8	2055164	2055171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4593	NC_014168	GAA	2	6	2055183	2055188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014168	CAC	2	6	2055497	2055502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4595	NC_014168	CG	3	6	2055503	2055508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_014168	ACATC	2	10	2055545	2055554	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4597	NC_014168	ATG	2	6	2055565	2055570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014168	ACA	2	6	2055574	2055579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_014168	CA	3	6	2055578	2055583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_014168	GCG	2	6	2055586	2055591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_014168	CGA	2	6	2055597	2055602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_014168	TGA	2	6	2057065	2057070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014168	GCTC	2	8	2057088	2057095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4604	NC_014168	GCC	2	6	2058688	2058693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4605	NC_014168	CTG	2	6	2060321	2060326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_014168	CG	3	6	2060383	2060388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_014168	GCG	2	6	2060446	2060451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_014168	GC	3	6	2060463	2060468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4609	NC_014168	TCC	2	6	2060472	2060477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_014168	G	6	6	2060527	2060532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014168	GCT	2	6	2064555	2064560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_014168	CGG	2	6	2064614	2064619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_014168	TG	4	8	2066123	2066130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014168	CTG	2	6	2074390	2074395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_014168	AG	3	6	2074421	2074426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014168	TCGC	2	8	2074972	2074979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_014168	GC	3	6	2075097	2075102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_014168	GCA	2	6	2075133	2075138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_014168	CTC	2	6	2077783	2077788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4620	NC_014168	ACTC	2	8	2077841	2077848	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_014168	GGC	2	6	2077866	2077871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_014168	GGA	2	6	2077903	2077908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_014168	CG	3	6	2079505	2079510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_014168	GCC	3	9	2082010	2082018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_014168	TCC	2	6	2082019	2082024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_014168	GC	4	8	2082090	2082097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4627	NC_014168	GGC	2	6	2083676	2083681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_014168	CTT	2	6	2084189	2084194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_014168	CGT	2	6	2084199	2084204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_014168	CCG	2	6	2084237	2084242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4631	NC_014168	CG	3	6	2085071	2085076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_014168	CGGG	2	8	2085096	2085103	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_014168	AGA	2	6	2087056	2087061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_014168	GCT	2	6	2087064	2087069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4636	NC_014168	T	7	7	2087304	2087310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_014168	AC	3	6	2087312	2087317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4638	NC_014168	AC	4	8	2087333	2087340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4639	NC_014168	ATG	2	6	2090863	2090868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_014168	CGGCA	2	10	2090907	2090916	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4641	NC_014168	TGCCCC	2	12	2091049	2091060	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4642	NC_014168	TGCG	2	8	2091079	2091086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4643	NC_014168	TGT	2	6	2091188	2091193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4650	NC_014168	CCCG	2	8	2091608	2091615	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4651	NC_014168	TTG	2	6	2095905	2095910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4668	NC_014168	GCT	2	6	2107644	2107649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4675	NC_014168	CGC	2	6	2115358	2115363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4684	NC_014168	TCG	2	6	2121577	2121582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4754	NC_014168	CT	3	6	2139425	2139430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4757	NC_014168	GC	3	6	2139501	2139506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4761	NC_014168	GC	3	6	2140013	2140018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4895	NC_014168	CCG	2	6	2183368	2183373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4896	NC_014168	GCA	2	6	2183380	2183385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4897	NC_014168	AGC	2	6	2183387	2183392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4898	NC_014168	TCC	2	6	2184841	2184846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4899	NC_014168	GTG	2	6	2184856	2184861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4900	NC_014168	CAT	2	6	2184883	2184888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4902	NC_014168	CGGC	2	8	2184992	2184999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4903	NC_014168	GGGAA	2	10	2185000	2185009	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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4925	NC_014168	CCG	2	6	2216487	2216492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4926	NC_014168	TTG	2	6	2216566	2216571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4934	NC_014168	AAG	2	6	2226833	2226838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4937	NC_014168	GCG	2	6	2228161	2228166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4945	NC_014168	GCT	2	6	2233982	2233987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4951	NC_014168	TCT	2	6	2238644	2238649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4970	NC_014168	GC	3	6	2246312	2246317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4974	NC_014168	GCG	2	6	2247342	2247347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4977	NC_014168	GCGGG	2	10	2249001	2249010	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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4981	NC_014168	CAG	2	6	2251652	2251657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4983	NC_014168	GCCA	2	8	2251686	2251693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4984	NC_014168	CT	3	6	2253297	2253302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4985	NC_014168	TGT	2	6	2253307	2253312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4993	NC_014168	TG	3	6	2262190	2262195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4994	NC_014168	GCGT	2	8	2262267	2262274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4995	NC_014168	GGGA	2	8	2262308	2262315	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_014168	GC	3	6	2262347	2262352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4997	NC_014168	GC	3	6	2262394	2262399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5000	NC_014168	CCGCG	2	10	2263164	2263173	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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