MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR84

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014157	AG	3	6	1059	1064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014157	CCG	2	6	1188	1193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014157	CT	3	6	1194	1199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014157	GGA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014157	ACGGC	2	10	1259	1268	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014157	CGG	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014157	AGG	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014157	GCG	2	6	1646	1651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014157	CGGG	2	8	1703	1710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014157	CGC	2	6	1728	1733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014157	TC	3	6	1756	1761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014157	TTC	2	6	1772	1777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014157	AAG	2	6	1860	1865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014157	GGGC	2	8	1882	1889	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014157	TGG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014157	GCA	2	6	2023	2028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014157	GCA	2	6	2039	2044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014157	TCT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014157	GCA	2	6	2073	2078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014157	TCT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014157	GCA	2	6	2090	2095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014157	CGA	2	6	2171	2176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014157	GGT	2	6	2212	2217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014157	CT	3	6	2253	2258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014157	CGG	2	6	2311	2316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014157	GCT	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014157	CG	4	8	2479	2486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014157	GC	3	6	2532	2537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014157	GATT	2	8	2539	2546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014157	CTG	2	6	2584	2589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014157	GC	3	6	2622	2627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014157	GC	4	8	2641	2648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014157	A	6	6	3832	3837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014157	TTG	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014157	TGG	2	6	4386	4391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014157	GA	3	6	4535	4540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014157	TCC	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014157	G	7	7	4659	4665	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014157	C	6	6	4669	4674	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_014157	ATC	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014157	C	8	8	4896	4903	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_014157	TGAC	2	8	4920	4927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014157	AGA	2	6	4954	4959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014157	GAGCC	2	10	5072	5081	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_014157	CGC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014157	CGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014157	TCT	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014157	CAG	2	6	5182	5187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014157	GCGA	2	8	5228	5235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014157	GCT	2	6	5268	5273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014157	ACG	2	6	5331	5336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014157	AGA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014157	GA	3	6	6108	6113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014157	GA	3	6	6126	6131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014157	GA	3	6	6144	6149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014157	GCT	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014157	TTG	2	6	7235	7240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014157	CT	3	6	7551	7556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014157	ATG	2	6	7563	7568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014157	TCCA	2	8	7587	7594	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014157	GCCA	2	8	7892	7899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014157	CGA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014157	TGCT	2	8	8350	8357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014157	TAG	2	6	8415	8420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014157	TGG	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014157	AGC	2	6	8642	8647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014157	TCA	2	6	8765	8770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014157	CTT	2	6	9526	9531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014157	TCC	3	9	10045	10053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_014157	GC	3	6	10093	10098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014157	CT	3	6	10143	10148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014157	TGCCTT	2	12	10214	10225	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014157	GCT	2	6	11680	11685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014157	CTCTT	2	10	11840	11849	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014157	TCT	2	6	11931	11936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014157	G	6	6	11970	11975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014157	TTC	2	6	11991	11996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014157	TTTC	2	8	12119	12126	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014157	TCG	2	6	12169	12174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014157	TTG	2	6	12252	12257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014157	GTT	2	6	12271	12276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014157	GCT	2	6	12372	12377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014157	CTC	2	6	13565	13570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014157	CGG	2	6	13685	13690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014157	C	6	6	13701	13706	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
86	NC_014157	GCA	2	6	13724	13729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014157	CCG	2	6	15139	15144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014157	CA	3	6	15163	15168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014157	GCT	2	6	15224	15229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014157	TTC	2	6	15233	15238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014157	CT	3	6	15247	15252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014157	CTG	2	6	15256	15261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014157	GCAC	2	8	15963	15970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014157	TC	3	6	15972	15977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014157	TC	4	8	15984	15991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014157	GAA	2	6	16014	16019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014157	TCT	2	6	16067	16072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014157	CCGG	2	8	16073	16080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014157	CT	3	6	16081	16086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014157	C	6	6	16114	16119	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_014157	GTC	2	6	16147	16152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014157	CAA	2	6	16169	16174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014157	TCT	2	6	16196	16201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014157	CT	3	6	16227	16232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014157	ATCGG	2	10	16245	16254	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014157	GGCA	2	8	16289	16296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014157	AGC	2	6	16592	16597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014157	GCCATA	2	12	16658	16669	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014157	GTCA	2	8	16676	16683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014157	CGG	2	6	16700	16705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014157	GCG	2	6	16706	16711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014157	T	6	6	16774	16779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014157	GGCA	2	8	16794	16801	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014157	C	6	6	16803	16808	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_014157	CAC	2	6	16927	16932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_014157	GCC	2	6	16939	16944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014157	TCG	2	6	16977	16982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014157	GCGA	2	8	16986	16993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014157	TGG	2	6	17013	17018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014157	CCT	2	6	17023	17028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014157	TCCT	2	8	17036	17043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014157	GGC	2	6	17044	17049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014157	CCCG	2	8	17060	17067	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_014157	ACA	2	6	17175	17180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014157	CTC	2	6	17342	17347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014157	CGGT	2	8	17389	17396	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014157	ATC	2	6	17408	17413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014157	GCC	2	6	17480	17485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014157	CGCTG	2	10	17500	17509	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_014157	TCG	2	6	17525	17530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014157	GTG	2	6	17534	17539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014157	CCA	2	6	17548	17553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014157	G	6	6	17670	17675	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014157	GGT	2	6	17677	17682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014157	GAAT	2	8	17692	17699	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014157	GACT	2	8	17922	17929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014157	GACT	2	8	17936	17943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014157	CTT	2	6	18057	18062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014157	TCC	2	6	18098	18103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014157	C	6	6	18153	18158	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_014157	GCCT	2	8	18174	18181	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_014157	T	6	6	18216	18221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014157	T	6	6	18233	18238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014157	T	6	6	18250	18255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014157	TTTG	2	8	18267	18274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014157	TGG	2	6	18432	18437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014157	G	6	6	18436	18441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014157	T	6	6	18447	18452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014157	CAC	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_014157	AGG	2	6	22121	22126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014157	TGC	2	6	22179	22184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014157	TGC	2	6	22196	22201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014157	TGC	2	6	22213	22218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014157	TGC	2	6	22230	22235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014157	GTTG	2	8	22245	22252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014157	AAG	2	6	22294	22299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_014157	GCC	2	6	22468	22473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_014157	TGCTG	2	10	22474	22483	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
160	NC_014157	CTG	2	6	22488	22493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014157	CTG	2	6	22503	22508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_014157	CTG	2	6	22518	22523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_014157	CTG	2	6	22533	22538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_014157	TGCC	2	8	22545	22552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_014157	AG	3	6	22560	22565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014157	TTTC	2	8	22572	22579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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168	NC_014157	CCT	2	6	22644	22649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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171	NC_014157	TCAC	2	8	22973	22980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_014157	CTT	2	6	23103	23108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_014157	AGG	2	6	26998	27003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_014157	CG	3	6	27132	27137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
176	NC_014157	CTG	2	6	27166	27171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_014157	GATA	2	8	27210	27217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014157	AGT	2	6	27218	27223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_014157	GCA	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_014157	GCA	2	6	27897	27902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_014157	CAG	2	6	32810	32815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_014157	ATAC	2	8	32896	32903	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
186	NC_014157	CCT	2	6	32958	32963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
187	NC_014157	CCT	2	6	32973	32978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_014157	TCA	2	6	33822	33827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_014157	CTC	2	6	33915	33920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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193	NC_014157	CGG	2	6	34398	34403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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196	NC_014157	GGC	2	6	34499	34504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_014157	TGG	2	6	34508	34513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_014157	TTCC	2	8	34858	34865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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227	NC_014157	G	6	6	49641	49646	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
228	NC_014157	GA	3	6	51843	51848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
229	NC_014157	GAGG	2	8	51852	51859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_014157	CT	3	6	70219	70224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
286	NC_014157	AT	3	6	70235	70240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_014157	GAG	2	6	70393	70398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_014157	GAG	2	6	70427	70432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
294	NC_014157	AAG	2	6	70484	70489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014157	GAG	2	6	70507	70512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_014157	ACC	2	6	84271	84276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.