MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salinibacter ruber M8 plasmid pSR11

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014026	GCG	2	6	106	111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014026	CGC	2	6	149	154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014026	AAT	2	6	183	188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014026	GAGAG	2	10	225	234	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014026	GAC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014026	T	6	6	2750	2755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014026	CG	3	6	2765	2770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014026	GACG	2	8	2771	2778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014026	CA	4	8	2787	2794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014026	GT	3	6	2796	2801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014026	TG	3	6	2805	2810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014026	GAC	2	6	2893	2898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014026	GCC	2	6	2981	2986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014026	CGG	2	6	2991	2996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014026	TGGC	2	8	3030	3037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014026	CGGG	2	8	3064	3071	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014026	CT	3	6	3180	3185	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014026	AGG	2	6	3777	3782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014026	TCT	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014026	CA	3	6	6762	6767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014026	TAGG	2	8	9367	9374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014026	TAGG	2	8	10067	10074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014026	CGG	2	6	10101	10106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014026	CATTA	2	10	10192	10201	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014026	GC	4	8	10244	10251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014026	CGCC	2	8	10287	10294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_014026	GA	3	6	10306	10311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014026	GAA	2	6	10599	10604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014026	CGG	2	6	10633	10638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014026	GCG	2	6	10692	10697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014026	GTT	2	6	10727	10732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014026	CA	3	6	10750	10755	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014026	TAA	2	6	11020	11025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014026	TTA	2	6	11029	11034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014026	TTA	2	6	11039	11044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014026	CCG	2	6	11058	11063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014026	CT	4	8	11067	11074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014026	CA	4	8	11094	11101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014026	GCG	2	6	11195	11200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014026	CAT	2	6	11207	11212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.