MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingobium japonicum UT26S chromosome 2

Total Repeats: 1398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014013	CAT	2	6	532496	532501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014013	CTG	2	6	532555	532560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_014013	GCC	2	6	532561	532566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_014013	CGC	2	6	535691	535696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_014013	CGC	2	6	535787	535792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_014013	ACC	2	6	535867	535872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_014013	GC	3	6	536225	536230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_014013	CG	4	8	536232	536239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_014013	CGC	2	6	536258	536263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014013	CAC	2	6	536267	536272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_014013	C	6	6	536289	536294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1012	NC_014013	GCAG	2	8	536336	536343	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_014013	GC	3	6	538153	538158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_014013	CCGCC	2	10	538205	538214	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1015	NC_014013	GAA	2	6	538243	538248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014013	CGA	2	6	538263	538268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014013	GCC	3	9	538288	538296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_014013	CG	3	6	538315	538320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_014013	TAG	2	6	538323	538328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014013	GTG	2	6	538378	538383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014013	GC	3	6	538480	538485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_014013	CG	4	8	538487	538494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_014013	CGC	2	6	538513	538518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_014013	CAC	2	6	538522	538527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1025	NC_014013	C	6	6	538544	538549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1026	NC_014013	GCAG	2	8	538591	538598	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_014013	CGC	2	6	539525	539530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_014013	GCG	2	6	539537	539542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_014013	TA	3	6	539587	539592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014013	GTG	2	6	541270	541275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014013	GC	3	6	541372	541377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_014013	CG	4	8	541379	541386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_014013	CGC	2	6	541405	541410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_014013	CAC	2	6	541414	541419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_014013	C	6	6	541436	541441	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1036	NC_014013	GCAG	2	8	541483	541490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_014013	CG	3	6	543221	543226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_014013	AG	3	6	543254	543259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014013	TCA	2	6	543565	543570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014013	ATC	2	6	543584	543589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014013	CG	3	6	543621	543626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_014013	CGAG	2	8	543658	543665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_014013	AGG	2	6	543711	543716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014013	AGC	2	6	543740	543745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014013	GCGGG	2	10	543820	543829	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_014013	GCC	2	6	543842	543847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_014013	CCG	2	6	543866	543871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_014013	CGG	2	6	543882	543887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_014013	AGGT	2	8	543892	543899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014013	TA	3	6	543932	543937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014013	CCAAT	2	10	543952	543961	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_014013	CG	5	10	543968	543977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_014013	GGA	2	6	544261	544266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014013	GCTAT	2	10	544344	544353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_014013	GGCG	2	8	544359	544366	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1056	NC_014013	GGC	2	6	544383	544388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014013	GCC	2	6	544392	544397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_014013	CTTC	2	8	544504	544511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_014013	TCCCCC	2	12	544537	544548	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1060	NC_014013	CGC	2	6	544587	544592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_014013	GGC	2	6	546417	546422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_014013	GCC	2	6	546425	546430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014013	CCG	2	6	546492	546497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_014013	CTTC	2	8	546538	546545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_014013	TCCCCC	2	12	546571	546582	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1066	NC_014013	CGGA	2	8	548590	548597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1067	NC_014013	CGA	2	6	549587	549592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014013	CGC	2	6	549593	549598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014013	GAG	2	6	549621	549626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014013	T	7	7	550697	550703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014013	AGG	2	6	550723	550728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014013	AGC	2	6	551001	551006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_014013	GC	3	6	551148	551153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_014013	G	6	6	551232	551237	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014013	A	7	7	551267	551273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014013	GCA	2	6	551585	551590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014013	CGAG	2	8	551677	551684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_014013	GCG	2	6	553207	553212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_014013	CCG	2	6	553238	553243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_014013	CCG	2	6	553296	553301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_014013	TGC	2	6	553313	553318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014013	AGCTC	2	10	553459	553468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1083	NC_014013	CGC	2	6	553469	553474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_014013	A	6	6	553475	553480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_014013	C	9	9	553830	553838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1086	NC_014013	TGG	2	6	553860	553865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014013	T	6	6	553872	553877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014013	TG	3	6	553933	553938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014013	AGC	2	6	554132	554137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_014013	CGAG	2	8	554160	554167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_014013	AGG	2	6	554186	554191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014013	GC	3	6	554226	554231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_014013	TC	3	6	556375	556380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_014013	TTTG	2	8	556429	556436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014013	GGTA	2	8	556440	556447	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014013	GCG	2	6	556473	556478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_014013	TACC	2	8	556534	556541	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_014013	AGC	2	6	557099	557104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014013	TGC	2	6	557181	557186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014013	GGC	2	6	557250	557255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_014013	GCC	2	6	559553	559558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_014013	GCC	2	6	559574	559579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_014013	TTGA	2	8	559613	559620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014013	TTCA	2	8	559671	559678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_014013	TTGA	2	8	559681	559688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014013	TCG	2	6	559693	559698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_014013	CGG	2	6	559708	559713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_014013	GC	3	6	559719	559724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1109	NC_014013	CGA	2	6	559727	559732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014013	GCC	2	6	559826	559831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_014013	GGC	2	6	559849	559854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014013	CGG	2	6	559922	559927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014013	CCG	2	6	559933	559938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_014013	GCC	2	6	559975	559980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_014013	A	6	6	560666	560671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014013	ATC	2	6	560721	560726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_014013	TGCC	2	8	561054	561061	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_014013	CCG	2	6	561084	561089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_014013	GGC	2	6	561102	561107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014013	AGC	2	6	561445	561450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_014013	CCG	2	6	561498	561503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_014013	AGC	2	6	561534	561539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014013	CGGAC	2	10	561554	561563	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1124	NC_014013	GCTTCG	2	12	561567	561578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014013	CGTCC	2	10	562225	562234	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1126	NC_014013	TTGGCC	2	12	562235	562246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014013	GAT	2	6	562261	562266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014013	CGGC	2	8	562300	562307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_014013	CT	3	6	563399	563404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_014013	CTC	2	6	564861	564866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_014013	GCC	2	6	564867	564872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_014013	GAAA	2	8	565903	565910	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014013	T	7	7	565937	565943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014013	GCA	2	6	566003	566008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014013	GAAC	2	8	566346	566353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_014013	GCCGG	2	10	566358	566367	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1137	NC_014013	G	6	6	566393	566398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_014013	G	7	7	566402	566408	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1147	NC_014013	CGGCC	2	10	569811	569820	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1269	NC_014013	CGGAT	2	10	621211	621220	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1271	NC_014013	CATT	2	8	621243	621250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1272	NC_014013	CGAC	2	8	621341	621348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1273	NC_014013	AATC	2	8	621435	621442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1275	NC_014013	CAA	2	6	621549	621554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1393	NC_014013	TCCC	2	8	681696	681703	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1394	NC_014013	C	6	6	681743	681748	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1395	NC_014013	CCCG	2	8	681771	681778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1396	NC_014013	ACG	2	6	681829	681834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1398	NC_014013	CGC	2	6	681848	681853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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