MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sideroxydans lithotrophicus ES-1 chromosome

Total Repeats: 4703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013959	TG	3	6	349210	349215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013959	GTTTT	2	10	349278	349287	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013959	T	6	6	349284	349289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013959	T	6	6	349305	349310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013959	CCG	2	6	349323	349328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_013959	CGA	2	6	349356	349361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013959	GAG	2	6	349406	349411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013959	CTTT	2	8	349481	349488	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_013959	AAAG	2	8	349500	349507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013959	CGA	2	6	349530	349535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013959	CAA	2	6	349562	349567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_013959	GAAAA	2	10	354439	354448	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013959	AG	3	6	354794	354799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013959	TGC	2	6	355195	355200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013959	TGG	2	6	355206	355211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013959	AC	3	6	357082	357087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_013959	TA	3	6	357135	357140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013959	GCT	2	6	357164	357169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013959	A	7	7	357181	357187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013959	AGA	2	6	357202	357207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013959	AAC	2	6	357208	357213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013959	TGA	2	6	357242	357247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013959	TGAG	2	8	357332	357339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013959	A	6	6	357364	357369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013959	GGC	2	6	357418	357423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013959	GCA	2	6	357449	357454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013959	TGG	2	6	357469	357474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013959	CGA	2	6	357653	357658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013959	GAC	2	6	357678	357683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013959	GCA	2	6	357727	357732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013959	GTGA	2	8	357780	357787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013959	GAAA	2	8	357822	357829	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013959	AGA	2	6	357869	357874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013959	CAG	2	6	357895	357900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013959	G	6	6	358042	358047	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013959	GGA	2	6	358086	358091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013959	GAG	2	6	358215	358220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013959	TACC	2	8	358359	358366	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_013959	TGC	2	6	358428	358433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_013959	GTC	2	6	358440	358445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013959	TCGTG	2	10	358449	358458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
542	NC_013959	CAT	2	6	358508	358513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013959	GGA	2	6	358552	358557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013959	AC	3	6	358772	358777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
545	NC_013959	AGG	2	6	358831	358836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013959	CCT	2	6	358913	358918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_013959	GTT	2	6	358958	358963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013959	GACG	2	8	359012	359019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
549	NC_013959	CCA	2	6	359116	359121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_013959	GTC	2	6	359180	359185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_013959	CCA	2	6	359205	359210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_013959	GAA	2	6	359223	359228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013959	GAA	2	6	359305	359310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013959	AAAG	2	8	359313	359320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013959	ATG	2	6	359513	359518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013959	CTGA	2	8	359641	359648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_013959	GGA	2	6	359700	359705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013959	AAAT	2	8	359706	359713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013959	TAG	2	6	359729	359734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013959	GCGA	2	8	359737	359744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
561	NC_013959	AGC	2	6	359751	359756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013959	G	6	6	359897	359902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013959	TCC	2	6	359907	359912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_013959	AAAC	2	8	360276	360283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
565	NC_013959	TC	3	6	360299	360304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_013959	GACA	2	8	360429	360436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
567	NC_013959	AAC	2	6	360467	360472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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569	NC_013959	AGC	2	6	360557	360562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013959	CAT	2	6	360563	360568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013959	AAAG	2	8	360571	360578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013959	GTC	2	6	360599	360604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013959	CAATG	2	10	360891	360900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
574	NC_013959	TGA	2	6	361004	361009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013959	GA	3	6	361133	361138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_013959	ATG	2	6	361338	361343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013959	TTGA	2	8	361356	361363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_013959	GT	3	6	361656	361661	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_013959	GGA	2	6	361750	361755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013959	GGT	2	6	361870	361875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013959	TCC	2	6	361935	361940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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588	NC_013959	TA	3	6	362197	362202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013959	AGT	2	6	362398	362403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013959	GCA	2	6	362411	362416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013959	T	6	6	362428	362433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_013959	GAC	2	6	362503	362508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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598	NC_013959	TGG	2	6	362718	362723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013959	GCA	2	6	362736	362741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_013959	ACA	2	6	362858	362863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_013959	GT	4	8	362874	362881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013959	GCG	2	6	362883	362888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_013959	G	6	6	362993	362998	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013959	AGA	2	6	363033	363038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013959	GCA	2	6	363092	363097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013959	GAAG	2	8	363105	363112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013959	GCA	2	6	364492	364497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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610	NC_013959	TAA	2	6	367714	367719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013959	CGG	2	6	368016	368021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013959	CCG	2	6	369993	369998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013959	T	6	6	370001	370006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013959	ATC	2	6	370008	370013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013959	C	6	6	373545	373550	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
616	NC_013959	GC	3	6	373684	373689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_013959	CA	3	6	373755	373760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_013959	GGC	2	6	373827	373832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013959	TGG	2	6	373864	373869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013959	GCA	2	6	373870	373875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_013959	CCA	2	6	373882	373887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_013959	AGCA	2	8	373895	373902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_013959	AG	3	6	373985	373990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013959	TTC	2	6	374036	374041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013959	TCG	2	6	374173	374178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013959	GCC	2	6	374189	374194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013959	GCA	2	6	374229	374234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_013959	AGC	2	6	374327	374332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013959	GCC	2	6	374389	374394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_013959	CAGAC	2	10	374403	374412	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
631	NC_013959	CGA	2	6	374423	374428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013959	GAG	2	6	374473	374478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013959	GCG	2	6	374516	374521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013959	GCC	2	6	374529	374534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_013959	T	8	8	374549	374556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013959	GGTGTT	2	12	374600	374611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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638	NC_013959	AGCG	2	8	375512	375519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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