MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stackebrandtia nassauensis DSM 44728 chromosome

Total Repeats: 13084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013947	TGT	2	6	767821	767826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013947	GCG	2	6	767845	767850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013947	TCG	2	6	767872	767877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013947	CGT	2	6	768484	768489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013947	GAC	2	6	768517	768522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013947	GCG	2	6	768539	768544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013947	CG	3	6	768619	768624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_013947	CAG	2	6	768649	768654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_013947	CCG	2	6	768757	768762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_013947	CA	3	6	768780	768785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013947	ACCTC	2	10	771528	771537	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1512	NC_013947	GTC	2	6	771581	771586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_013947	AGCG	2	8	771693	771700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_013947	TGG	2	6	772573	772578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013947	GCG	2	6	772582	772587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013947	GGAA	2	8	772619	772626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013947	GTA	2	6	773322	773327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013947	AGTT	2	8	773425	773432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013947	TC	3	6	774579	774584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_013947	GGT	2	6	774598	774603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013947	GTC	2	6	775581	775586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_013947	CGC	2	6	775591	775596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_013947	CGG	2	6	775600	775605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_013947	CCACT	2	10	776762	776771	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1525	NC_013947	AGT	2	6	776776	776781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013947	GCG	3	9	776788	776796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013947	GCGT	2	8	776800	776807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_013947	GGC	2	6	776858	776863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013947	CGA	2	6	776875	776880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_013947	CAG	2	6	776894	776899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013947	CTC	2	6	776938	776943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_013947	CG	3	6	776969	776974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1533	NC_013947	CTC	2	6	778948	778953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1534	NC_013947	GCC	2	6	778957	778962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_013947	GCC	2	6	778965	778970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_013947	CCG	2	6	778979	778984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_013947	CGT	2	6	780001	780006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_013947	TCG	2	6	780017	780022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_013947	GC	3	6	780053	780058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_013947	ATCG	2	8	783301	783308	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1541	NC_013947	CGGG	2	8	784007	784014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_013947	CGC	2	6	784069	784074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_013947	G	6	6	784100	784105	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013947	CCG	4	12	789243	789254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_013947	TGG	2	6	790043	790048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013947	GGGT	2	8	790098	790105	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013947	CGC	2	6	790901	790906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_013947	GCG	2	6	790924	790929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_013947	TCA	2	6	792447	792452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_013947	TGA	2	6	792455	792460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013947	AGG	2	6	792466	792471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013947	CCGGC	2	10	793946	793955	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1553	NC_013947	TGG	2	6	793958	793963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013947	ACC	2	6	794407	794412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_013947	GTGAT	2	10	795696	795705	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013947	CAG	2	6	795709	795714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_013947	TA	3	6	802230	802235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013947	CCG	3	9	802335	802343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_013947	GGCC	2	8	803165	803172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_013947	ACGA	2	8	804081	804088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_013947	GGA	2	6	804189	804194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013947	CGAT	2	8	805305	805312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_013947	GGTC	2	8	805331	805338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_013947	GGC	2	6	805355	805360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_013947	CGGCG	2	10	805391	805400	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1566	NC_013947	CCG	2	6	805404	805409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_013947	CCAA	2	8	805472	805479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_013947	GTGAT	2	10	809477	809486	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013947	CCA	2	6	809505	809510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1570	NC_013947	GCCT	2	8	809520	809527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_013947	CCG	2	6	810349	810354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_013947	GC	3	6	810369	810374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_013947	GC	3	6	810387	810392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_013947	TTGT	2	8	810881	810888	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013947	GCAA	2	8	810913	810920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1579	NC_013947	GGC	2	6	812133	812138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_013947	GCC	2	6	812203	812208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1581	NC_013947	AC	4	8	812662	812669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1582	NC_013947	AC	3	6	812674	812679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_013947	GCC	2	6	812701	812706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_013947	CGG	2	6	812778	812783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1588	NC_013947	GT	3	6	820374	820379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013947	TCG	2	6	820430	820435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1595	NC_013947	GAC	2	6	820743	820748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1597	NC_013947	GCAGG	2	10	820813	820822	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_013947	TCC	2	6	820829	820834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_013947	GC	3	6	822075	822080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_013947	GCC	2	6	822084	822089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_013947	GCC	2	6	822102	822107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_013947	CTG	2	6	822116	822121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_013947	GCC	2	6	822129	822134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_013947	CCG	2	6	822159	822164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_013947	TC	3	6	822172	822177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_013947	ACG	2	6	823733	823738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_013947	G	6	6	823780	823785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013947	CGAG	2	8	827190	827197	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_013947	AGC	2	6	827291	827296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013947	CTC	2	6	829662	829667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_013947	GTC	2	6	829692	829697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013947	GTGA	2	8	829728	829735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013947	AC	3	6	829738	829743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_013947	TGC	2	6	831037	831042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013947	CTG	2	6	831074	831079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_013947	AATT	2	8	831104	831111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013947	AAT	2	6	831119	831124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013947	TCGATC	2	12	831145	831156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013947	ATG	2	6	831171	831176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1621	NC_013947	GAC	2	6	832960	832965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_013947	GGT	2	6	833356	833361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013947	GCCA	2	8	833387	833394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_013947	GCC	2	6	834011	834016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_013947	ATGTGG	2	12	834072	834083	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013947	GGC	2	6	834112	834117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_013947	TGGTC	2	10	834122	834131	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1628	NC_013947	TCGC	2	8	835839	835846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_013947	GCC	2	6	835847	835852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1630	NC_013947	GGC	2	6	835855	835860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013947	GCC	2	6	835893	835898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_013947	GTTAA	2	10	837507	837516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013947	TCG	2	6	837532	837537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1635	NC_013947	TGG	3	9	842980	842988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1905	NC_013947	GAA	2	6	1018074	1018079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1906	NC_013947	CCG	2	6	1018149	1018154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1907	NC_013947	GGC	2	6	1018157	1018162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1908	NC_013947	CAA	2	6	1018237	1018242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1909	NC_013947	ACG	2	6	1018388	1018393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1910	NC_013947	TCGG	2	8	1018428	1018435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1911	NC_013947	CCCG	2	8	1019083	1019090	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1912	NC_013947	GCGAA	2	10	1019099	1019108	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1913	NC_013947	AGCG	2	8	1019158	1019165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1914	NC_013947	CCT	2	6	1019343	1019348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1915	NC_013947	TTA	2	6	1019382	1019387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_013947	AGCG	2	8	1019416	1019423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1917	NC_013947	GAAGTA	2	12	1019438	1019449	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1918	NC_013947	TG	4	8	1019452	1019459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_013947	GAT	2	6	1019560	1019565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_013947	TGC	2	6	1019583	1019588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1921	NC_013947	C	6	6	1019758	1019763	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1922	NC_013947	TAC	2	6	1019817	1019822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_013947	CTGTTG	2	12	1019830	1019841	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1924	NC_013947	GCAA	2	8	1019869	1019876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1925	NC_013947	TGTGG	2	10	1019980	1019989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1926	NC_013947	CTG	2	6	1020103	1020108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1927	NC_013947	AC	3	6	1020152	1020157	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1928	NC_013947	TGA	2	6	1020966	1020971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1929	NC_013947	CTG	2	6	1021113	1021118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1930	NC_013947	CGGTAC	2	12	1021159	1021170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1931	NC_013947	TGA	2	6	1021179	1021184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_013947	TGA	2	6	1021204	1021209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_013947	TGTCA	2	10	1021215	1021224	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1934	NC_013947	TGT	2	6	1021246	1021251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_013947	TGG	2	6	1021258	1021263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_013947	GGT	2	6	1021320	1021325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1938	NC_013947	TGTGG	2	10	1021375	1021384	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1939	NC_013947	CGA	2	6	1022911	1022916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1942	NC_013947	GCC	2	6	1024009	1024014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1943	NC_013947	GCG	2	6	1024045	1024050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1944	NC_013947	GACG	2	8	1024644	1024651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1945	NC_013947	TCG	2	6	1024671	1024676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1946	NC_013947	CGAA	2	8	1024724	1024731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1947	NC_013947	ACC	2	6	1024761	1024766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1948	NC_013947	TCCT	2	8	1025633	1025640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1949	NC_013947	GAGC	2	8	1025662	1025669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1953	NC_013947	ACC	2	6	1029766	1029771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1955	NC_013947	GAC	2	6	1033621	1033626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1978	NC_013947	TGG	2	6	1039938	1039943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1988	NC_013947	TA	3	6	1055100	1055105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1989	NC_013947	CGC	2	6	1057982	1057987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1992	NC_013947	GGT	2	6	1061348	1061353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1994	NC_013947	CG	3	6	1061367	1061372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1995	NC_013947	CCCGC	2	10	1061383	1061392	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1996	NC_013947	CAG	2	6	1061410	1061415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1997	NC_013947	ACG	2	6	1062075	1062080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1998	NC_013947	TGTC	2	8	1063988	1063995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1999	NC_013947	TC	3	6	1064451	1064456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_013947	CCA	2	6	1064577	1064582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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