MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptomyces scabiei 87.22 chromosome

Total Repeats: 33312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_013929	CCG	2	6	10056667	10056672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33002	NC_013929	CCG	2	6	10056718	10056723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33003	NC_013929	GGT	2	6	10056807	10056812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33004	NC_013929	GAG	2	6	10056837	10056842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33005	NC_013929	TGA	2	6	10057834	10057839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33006	NC_013929	GAC	2	6	10057842	10057847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33007	NC_013929	GCTG	2	8	10058891	10058898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33008	NC_013929	AGG	2	6	10058899	10058904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33009	NC_013929	TCGGC	2	10	10058952	10058961	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33010	NC_013929	CCCGA	2	10	10059618	10059627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33011	NC_013929	CCG	2	6	10059629	10059634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33012	NC_013929	CG	3	6	10059633	10059638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33013	NC_013929	CAGCG	2	10	10059648	10059657	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33014	NC_013929	CTG	2	6	10059708	10059713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33015	NC_013929	CCT	2	6	10063540	10063545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33016	NC_013929	GGTC	2	8	10064467	10064474	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33017	NC_013929	TGC	2	6	10064480	10064485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33018	NC_013929	CGG	2	6	10064536	10064541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33019	NC_013929	GAG	2	6	10064563	10064568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33020	NC_013929	GTAC	2	8	10064572	10064579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33021	NC_013929	CTC	2	6	10064583	10064588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33022	NC_013929	CGG	2	6	10066173	10066178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33023	NC_013929	CGT	2	6	10066648	10066653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33024	NC_013929	CGT	2	6	10066672	10066677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33025	NC_013929	ATC	2	6	10066715	10066720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33026	NC_013929	ACG	2	6	10066734	10066739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33027	NC_013929	GGC	2	6	10066742	10066747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33028	NC_013929	TGC	2	6	10066764	10066769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33029	NC_013929	GCCG	2	8	10066867	10066874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33030	NC_013929	CCT	2	6	10066882	10066887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33031	NC_013929	CAG	2	6	10066924	10066929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33032	NC_013929	CACCC	2	10	10066930	10066939	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
33033	NC_013929	GCC	2	6	10066961	10066966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33034	NC_013929	CGG	2	6	10067041	10067046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33035	NC_013929	TCG	2	6	10067070	10067075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33036	NC_013929	GAC	2	6	10067127	10067132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33037	NC_013929	CGC	2	6	10067198	10067203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33038	NC_013929	CGC	2	6	10067209	10067214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33039	NC_013929	CG	3	6	10067270	10067275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33040	NC_013929	CGG	2	6	10068568	10068573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33041	NC_013929	CCA	2	6	10068575	10068580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33042	NC_013929	GGC	2	6	10068614	10068619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33043	NC_013929	GCCG	2	8	10068628	10068635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33044	NC_013929	CAA	2	6	10068705	10068710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33045	NC_013929	GCAC	2	8	10068719	10068726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33046	NC_013929	AGC	2	6	10068812	10068817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33047	NC_013929	ATC	2	6	10068818	10068823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33048	NC_013929	GACG	2	8	10068923	10068930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33049	NC_013929	CCCG	2	8	10068955	10068962	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33050	NC_013929	CCAT	2	8	10068973	10068980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33051	NC_013929	CTC	2	6	10069044	10069049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33052	NC_013929	GTCAC	2	10	10069057	10069066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33053	NC_013929	CGG	2	6	10070621	10070626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33054	NC_013929	GGCC	2	8	10070629	10070636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33055	NC_013929	CCG	2	6	10070652	10070657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33056	NC_013929	CA	3	6	10070669	10070674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33057	NC_013929	CAC	2	6	10073196	10073201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33058	NC_013929	CGC	2	6	10073216	10073221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33059	NC_013929	CGTG	2	8	10074230	10074237	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33060	NC_013929	CGC	2	6	10074251	10074256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33061	NC_013929	CGTCG	2	10	10074260	10074269	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33062	NC_013929	ATG	2	6	10074272	10074277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33063	NC_013929	GCA	2	6	10074279	10074284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33064	NC_013929	TCG	2	6	10074290	10074295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33065	NC_013929	AATC	2	8	10074337	10074344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33066	NC_013929	TTC	2	6	10074348	10074353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33067	NC_013929	GA	3	6	10074378	10074383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33068	NC_013929	CAA	2	6	10080559	10080564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33069	NC_013929	GAG	2	6	10080565	10080570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33070	NC_013929	CGT	2	6	10082071	10082076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33071	NC_013929	GCGGTG	2	12	10082525	10082536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
33072	NC_013929	CAG	2	6	10082540	10082545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33073	NC_013929	GAT	2	6	10082570	10082575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33074	NC_013929	GGGC	2	8	10082596	10082603	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33075	NC_013929	GGC	2	6	10082612	10082617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33076	NC_013929	TG	3	6	10082672	10082677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33077	NC_013929	GT	3	6	10082709	10082714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33078	NC_013929	GTGC	2	8	10083404	10083411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33079	NC_013929	TAC	2	6	10083438	10083443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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33081	NC_013929	GCT	2	6	10084721	10084726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33082	NC_013929	GCC	2	6	10084743	10084748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33083	NC_013929	GAG	2	6	10084767	10084772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33084	NC_013929	CG	3	6	10084782	10084787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33085	NC_013929	TGA	2	6	10084810	10084815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33086	NC_013929	CCGG	2	8	10084825	10084832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33087	NC_013929	CCG	2	6	10084888	10084893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33088	NC_013929	CGG	2	6	10087763	10087768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33089	NC_013929	TGG	2	6	10087916	10087921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33090	NC_013929	GCG	2	6	10087926	10087931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33091	NC_013929	CGAC	2	8	10087938	10087945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33092	NC_013929	GTT	2	6	10087961	10087966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33093	NC_013929	GGA	2	6	10088000	10088005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33094	NC_013929	ACG	2	6	10088082	10088087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33095	NC_013929	GAC	2	6	10088089	10088094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33096	NC_013929	GCG	2	6	10088106	10088111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33097	NC_013929	CGG	2	6	10088203	10088208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33098	NC_013929	CCGGTC	2	12	10088250	10088261	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33099	NC_013929	CGGT	2	8	10088317	10088324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33100	NC_013929	CGTC	2	8	10088344	10088351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33101	NC_013929	GATG	2	8	10088541	10088548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33102	NC_013929	ACC	2	6	10088583	10088588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33103	NC_013929	TCC	2	6	10088604	10088609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33104	NC_013929	GAA	2	6	10088616	10088621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33105	NC_013929	CGA	2	6	10091410	10091415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33106	NC_013929	GCG	2	6	10091456	10091461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33107	NC_013929	CGG	2	6	10092718	10092723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33108	NC_013929	GTG	2	6	10092789	10092794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33109	NC_013929	GC	3	6	10092841	10092846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33110	NC_013929	GAC	2	6	10092848	10092853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33111	NC_013929	GAC	2	6	10092914	10092919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33112	NC_013929	ATC	2	6	10092977	10092982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33113	NC_013929	CCCG	2	8	10093009	10093016	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33114	NC_013929	GCA	2	6	10093989	10093994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33115	NC_013929	GGAT	2	8	10094001	10094008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33116	NC_013929	ACG	2	6	10094041	10094046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33118	NC_013929	GGA	2	6	10094076	10094081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33119	NC_013929	CT	3	6	10094143	10094148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33120	NC_013929	C	6	6	10098233	10098238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33121	NC_013929	CGC	2	6	10099235	10099240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33122	NC_013929	CGCC	2	8	10099255	10099262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33123	NC_013929	GGGC	2	8	10102457	10102464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33124	NC_013929	CGG	2	6	10102495	10102500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33125	NC_013929	GAC	2	6	10103213	10103218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33126	NC_013929	TCA	2	6	10103235	10103240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33127	NC_013929	GAC	2	6	10103261	10103266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33128	NC_013929	TGA	2	6	10103281	10103286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33129	NC_013929	GGGC	2	8	10109423	10109430	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33130	NC_013929	CGT	2	6	10109455	10109460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33131	NC_013929	GC	3	6	10109492	10109497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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33135	NC_013929	CCCG	3	12	10109559	10109570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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33142	NC_013929	GCCG	2	8	10112328	10112335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33143	NC_013929	CGG	2	6	10112439	10112444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33151	NC_013929	AT	3	6	10112717	10112722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33152	NC_013929	GCCG	2	8	10114045	10114052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33153	NC_013929	CGG	2	6	10114057	10114062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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33240	NC_013929	TCG	2	6	10127525	10127530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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33248	NC_013929	CTG	2	6	10129308	10129313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33249	NC_013929	CCA	2	6	10129340	10129345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33250	NC_013929	GCG	2	6	10129369	10129374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33251	NC_013929	CGC	3	9	10129545	10129553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33252	NC_013929	CTCGAT	2	12	10129711	10129722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33253	NC_013929	GGC	2	6	10129743	10129748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33254	NC_013929	GGT	2	6	10129767	10129772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33257	NC_013929	CGGT	2	8	10129912	10129919	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33258	NC_013929	ATG	2	6	10129925	10129930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33268	NC_013929	GC	3	6	10130105	10130110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33269	NC_013929	AGT	2	6	10130189	10130194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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33271	NC_013929	CT	3	6	10132868	10132873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33272	NC_013929	CT	3	6	10133287	10133292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33273	NC_013929	TGG	2	6	10133342	10133347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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33281	NC_013929	GAC	2	6	10133609	10133614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33282	NC_013929	GGCA	2	8	10133615	10133622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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33287	NC_013929	AGG	2	6	10133743	10133748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33288	NC_013929	G	6	6	10133747	10133752	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33289	NC_013929	CCA	2	6	10133790	10133795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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33302	NC_013929	GTCC	2	8	10148041	10148048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33303	NC_013929	CGCCC	2	10	10148133	10148142	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
33304	NC_013929	G	6	6	10148151	10148156	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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33308	NC_013929	AGCC	2	8	10148249	10148256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.