MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN05

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013735	A	7	7	28	34	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013735	TA	3	6	73	78	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013735	AGA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013735	GCA	2	6	137	142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013735	TAG	2	6	146	151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013735	ATT	2	6	154	159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013735	ATCCA	2	10	201	210	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013735	AAC	2	6	236	241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013735	ATA	2	6	254	259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013735	T	6	6	447	452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013735	ACC	2	6	461	466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013735	A	6	6	539	544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013735	TCA	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013735	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013735	GCT	2	6	665	670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013735	AAAG	2	8	712	719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013735	T	8	8	768	775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013735	AT	3	6	834	839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013735	TA	3	6	870	875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013735	TA	6	12	878	889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013735	AG	3	6	945	950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013735	GTTT	2	8	1891	1898	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013735	TA	3	6	1922	1927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013735	TGGT	2	8	2924	2931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013735	TAC	2	6	2945	2950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013735	ATAA	2	8	3933	3940	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013735	ATA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013735	TTA	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013735	A	7	7	4130	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013735	A	6	6	4151	4156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013735	GGA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013735	A	6	6	4162	4167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013735	AGC	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013735	AAAG	2	8	4225	4232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013735	AAAGG	2	10	4243	4252	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013735	GGC	2	6	4254	4259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013735	TAGT	2	8	4272	4279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013735	AT	3	6	4523	4528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013735	TG	3	6	4575	4580	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013735	GTA	2	6	4590	4595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013735	TGGA	2	8	4622	4629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013735	TCG	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013735	TCG	2	6	4708	4713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013735	ACCC	2	8	4730	4737	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_013735	A	7	7	6639	6645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013735	T	6	6	6648	6653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013735	CAAA	2	8	6660	6667	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013735	ACT	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013735	GCC	2	6	6715	6720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013735	GGT	2	6	7015	7020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013735	T	8	8	7058	7065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013735	AAT	2	6	7076	7081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013735	TTA	2	6	7101	7106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013735	T	8	8	7150	7157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013735	TG	3	6	7169	7174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013735	TAA	2	6	7175	7180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013735	ACGA	2	8	7611	7618	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013735	GGT	2	6	7625	7630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013735	ACC	2	6	7644	7649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013735	T	6	6	7652	7657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013735	GTT	2	6	7663	7668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013735	GTTAT	2	10	7704	7713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013735	AT	3	6	7817	7822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013735	TCA	2	6	7832	7837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013735	TAA	2	6	7848	7853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013735	ACG	2	6	7949	7954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013735	GAA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013735	A	6	6	7988	7993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013735	GAAC	2	8	8001	8008	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013735	CTC	2	6	8014	8019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013735	TTG	2	6	8075	8080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013735	TAGAGA	2	12	8108	8119	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013735	TCA	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013735	ATT	2	6	8170	8175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013735	TTG	2	6	8184	8189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013735	AAT	2	6	8196	8201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013735	ATAA	2	8	8218	8225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013735	AT	3	6	8248	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013735	CAG	2	6	8265	8270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013735	AT	3	6	8450	8455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013735	GAA	2	6	8486	8491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013735	ATC	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013735	AT	3	6	8643	8648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.