MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirosoma linguale DSM 74 plasmid pSLIN03

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013733	GTTA	2	8	19	26	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013733	TAA	2	6	47	52	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013733	TATT	2	8	85	92	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013733	ATT	2	6	766	771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013733	AAAC	2	8	821	828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013733	TGT	2	6	1277	1282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013733	TGT	2	6	1792	1797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013733	TAC	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013733	CAG	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013733	AG	3	6	1908	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013733	A	6	6	1924	1929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013733	T	6	6	1993	1998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013733	TGCT	2	8	2036	2043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013733	ATA	2	6	2047	2052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013733	CGAA	2	8	2156	2163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013733	TTG	2	6	2336	2341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013733	TAC	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013733	TGT	2	6	2357	2362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013733	CTG	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013733	ATA	2	6	2506	2511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013733	GCC	2	6	2534	2539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013733	A	6	6	2563	2568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013733	CAA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013733	TCG	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013733	TTG	2	6	3152	3157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013733	ATGT	2	8	3170	3177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013733	ACCC	2	8	3217	3224	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_013733	GT	3	6	4033	4038	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013733	GGC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013733	GCGG	2	8	5650	5657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013733	TGGG	2	8	5680	5687	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013733	GAT	2	6	5791	5796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013733	CCAA	2	8	7602	7609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013733	ACCC	2	8	9359	9366	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_013733	TACC	2	8	9486	9493	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_013733	ATA	2	6	9520	9525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013733	AAGT	2	8	10017	10024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013733	TTC	2	6	10027	10032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013733	TGG	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013733	AACT	2	8	10179	10186	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013733	CGA	2	6	10517	10522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013733	TTAA	2	8	10523	10530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013733	CAA	2	6	10559	10564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013733	GTT	2	6	10570	10575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013733	GCAT	2	8	10692	10699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013733	CGT	2	6	10745	10750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013733	ACCG	2	8	10804	10811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013733	TCA	2	6	10816	10821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013733	GAG	2	6	10842	10847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013733	T	16	16	10909	10924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013733	GCCC	2	8	10967	10974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_013733	TGC	2	6	11019	11024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013733	AGCAG	2	10	11040	11049	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013733	AGGC	2	8	11065	11072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013733	ACC	2	6	11093	11098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013733	GAT	2	6	11104	11109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013733	GAT	2	6	11245	11250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013733	CAT	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013733	ACC	2	6	11278	11283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_013733	GAT	2	6	11343	11348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013733	GTA	2	6	11415	11420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013733	GCA	2	6	13579	13584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013733	T	6	6	13641	13646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013733	GTT	2	6	13657	13662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013733	TTG	2	6	13669	13674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013733	CCA	2	6	13679	13684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013733	CAT	2	6	13691	13696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013733	CAG	2	6	13722	13727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013733	GCA	2	6	13787	13792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013733	CAT	2	6	13896	13901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_013733	ATTG	2	8	14005	14012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013733	ACA	2	6	16923	16928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013733	ACT	2	6	18335	18340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013733	GTT	2	6	18376	18381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013733	ATA	2	6	20359	20364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013733	TTG	2	6	20368	20373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013733	TAA	2	6	20988	20993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013733	CTA	2	6	21262	21267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013733	CTG	2	6	21295	21300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013733	T	6	6	21329	21334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013733	GTTT	2	8	21384	21391	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013733	CTACT	2	10	21436	21445	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013733	TAA	2	6	21494	21499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013733	C	6	6	21651	21656	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NC_013733	ACG	2	6	21733	21738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013733	TCT	2	6	22953	22958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013733	GGTC	2	8	22973	22980	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013733	CTT	2	6	23325	23330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013733	A	6	6	23444	23449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013733	T	6	6	23450	23455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013733	TTA	2	6	23512	23517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013733	TTA	2	6	23526	23531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013733	TAGG	2	8	23538	23545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013733	GGA	2	6	23569	23574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013733	AAG	3	9	23929	23937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013733	ACA	2	6	25036	25041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013733	TGG	2	6	25185	25190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013733	GTTA	2	8	25288	25295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013733	ATT	2	6	25432	25437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013733	CTA	2	6	25599	25604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013733	TCT	2	6	25641	25646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013733	CTT	2	6	25670	25675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013733	AAAGT	2	10	25676	25685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013733	AAT	2	6	25694	25699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013733	ACT	2	6	25702	25707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013733	TAC	2	6	25709	25714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013733	TGA	2	6	25820	25825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013733	A	7	7	25828	25834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013733	TTAC	2	8	25875	25882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013733	T	6	6	25983	25988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013733	TA	3	6	26092	26097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013733	CAAGGG	2	12	26300	26311	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013733	CAA	2	6	26436	26441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013733	AATC	2	8	26661	26668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013733	AGG	2	6	26669	26674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013733	ATCA	2	8	26688	26695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013733	AT	3	6	26752	26757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013733	GAA	2	6	26788	26793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013733	TCA	2	6	26810	26815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013733	T	6	6	27319	27324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013733	A	6	6	27332	27337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013733	GTT	2	6	27374	27379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013733	GAC	2	6	27395	27400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013733	CTT	2	6	27522	27527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013733	ATC	2	6	28605	28610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013733	TA	3	6	28618	28623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013733	TATAA	2	10	28649	28658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013733	TAT	2	6	28674	28679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013733	TTTTC	2	10	28684	28693	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013733	TATAGT	2	12	28701	28712	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013733	TG	3	6	28751	28756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013733	AT	3	6	28896	28901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013733	TGC	2	6	30851	30856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013733	AAT	3	9	30890	30898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013733	T	7	7	30924	30930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013733	A	6	6	30955	30960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013733	TAA	3	9	30969	30977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013733	TTAAT	2	10	31013	31022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013733	GTAT	2	8	31036	31043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013733	TCC	2	6	31129	31134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013733	CAT	2	6	31143	31148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013733	GAAT	2	8	31207	31214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013733	TAT	2	6	31310	31315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013733	CTC	2	6	31347	31352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_013733	TAA	2	6	31443	31448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013733	ACC	2	6	31464	31469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_013733	CGC	2	6	32146	32151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013733	CTCA	2	8	32190	32197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013733	GTG	2	6	32209	32214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013733	TGG	2	6	32408	32413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013733	GGT	2	6	32807	32812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013733	CCGAC	2	10	32968	32977	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_013733	ACT	2	6	32999	33004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013733	TAC	2	6	33006	33011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013733	A	6	6	33037	33042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013733	AAG	2	6	33123	33128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_013733	TAC	2	6	33173	33178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013733	CTTT	2	8	33207	33214	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
159	NC_013733	CAAG	2	8	33377	33384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_013733	AG	3	6	33392	33397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_013733	GTA	2	6	33495	33500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013733	ACA	2	6	33570	33575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_013733	CTC	2	6	33591	33596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_013733	ACA	2	6	34633	34638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_013733	ATA	2	6	34663	34668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013733	T	7	7	35467	35473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013733	ACATA	2	10	35474	35483	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_013733	ACA	2	6	35495	35500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_013733	TGT	2	6	35526	35531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_013733	TAG	2	6	35940	35945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_013733	AAT	2	6	36000	36005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_013733	AGA	2	6	36019	36024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.