MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptosporangium roseum DSM 43021 chromosome

Total Repeats: 35733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_013595	CCCA	2	8	5228314	5228321	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18002	NC_013595	GCTG	2	8	5228334	5228341	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18003	NC_013595	CGA	2	6	5228377	5228382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_013595	TGG	2	6	5228405	5228410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_013595	ACT	2	6	5228436	5228441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18006	NC_013595	CGC	2	6	5228470	5228475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18007	NC_013595	GCC	2	6	5228480	5228485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18008	NC_013595	CGC	2	6	5228496	5228501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18009	NC_013595	GCT	2	6	5228509	5228514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18010	NC_013595	TCG	2	6	5228517	5228522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18011	NC_013595	TGC	2	6	5228541	5228546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_013595	CTG	2	6	5228612	5228617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_013595	TGG	2	6	5228624	5228629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18014	NC_013595	TGC	2	6	5228649	5228654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_013595	CCT	2	6	5228670	5228675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18016	NC_013595	TTC	2	6	5228735	5228740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18017	NC_013595	TGT	2	6	5228781	5228786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_013595	TGG	2	6	5228850	5228855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_013595	CGTGGT	2	12	5228878	5228889	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18020	NC_013595	CAG	2	6	5228956	5228961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18021	NC_013595	GC	3	6	5228976	5228981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18022	NC_013595	TCG	2	6	5229060	5229065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_013595	CCG	2	6	5229081	5229086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_013595	CCG	3	9	5229132	5229140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18025	NC_013595	TCA	2	6	5229144	5229149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_013595	CCA	2	6	5229168	5229173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18027	NC_013595	ACC	2	6	5229182	5229187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18028	NC_013595	CCG	2	6	5229198	5229203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18029	NC_013595	AGGCC	2	10	5229220	5229229	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18030	NC_013595	CA	3	6	5229255	5229260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18031	NC_013595	CATCCT	2	12	5229304	5229315	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_013595	GTG	2	6	5229419	5229424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18033	NC_013595	CAT	2	6	5229445	5229450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_013595	CAGG	2	8	5229485	5229492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18035	NC_013595	GAT	2	6	5229517	5229522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18036	NC_013595	CCG	2	6	5229552	5229557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18037	NC_013595	GC	3	6	5229571	5229576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18038	NC_013595	GCC	2	6	5229578	5229583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18039	NC_013595	TTC	2	6	5229625	5229630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_013595	GACC	2	8	5229690	5229697	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18041	NC_013595	CGG	2	6	5229727	5229732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_013595	GTC	2	6	5229738	5229743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_013595	GCGAT	2	10	5229754	5229763	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18044	NC_013595	CGGC	2	8	5229785	5229792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18045	NC_013595	ACA	2	6	5229797	5229802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_013595	CGC	2	6	5229810	5229815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18047	NC_013595	GGCC	2	8	5229907	5229914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18048	NC_013595	GTA	2	6	5229949	5229954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18049	NC_013595	CAGCG	2	10	5230012	5230021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18050	NC_013595	CGA	2	6	5230034	5230039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18051	NC_013595	GTT	2	6	5230110	5230115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_013595	GTC	2	6	5230126	5230131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18053	NC_013595	TGG	2	6	5230136	5230141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_013595	CCG	2	6	5230156	5230161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18055	NC_013595	GGT	2	6	5230170	5230175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_013595	TGC	2	6	5230229	5230234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_013595	GAT	2	6	5230236	5230241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18058	NC_013595	CGC	2	6	5230302	5230307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18059	NC_013595	CCGCG	2	10	5230356	5230365	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18060	NC_013595	AAG	2	6	5230372	5230377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_013595	CCG	2	6	5230406	5230411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18062	NC_013595	GCAC	2	8	5230445	5230452	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18063	NC_013595	TGGC	2	8	5230474	5230481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18064	NC_013595	TGG	2	6	5230537	5230542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18065	NC_013595	GAA	2	6	5230574	5230579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18066	NC_013595	TGC	2	6	5231768	5231773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_013595	A	6	6	5232574	5232579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_013595	ATC	2	6	5232680	5232685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18069	NC_013595	TTGA	2	8	5232689	5232696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18070	NC_013595	TGGC	2	8	5232724	5232731	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18071	NC_013595	ACC	2	6	5232748	5232753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18072	NC_013595	GTTC	2	8	5232773	5232780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18073	NC_013595	GA	3	6	5232783	5232788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_013595	GT	3	6	5233531	5233536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_013595	GTC	2	6	5233556	5233561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18076	NC_013595	GCA	2	6	5233625	5233630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18077	NC_013595	CAC	2	6	5233677	5233682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_013595	GAGCGG	2	12	5233705	5233716	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18079	NC_013595	GGC	2	6	5233721	5233726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18080	NC_013595	GCC	2	6	5233733	5233738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18081	NC_013595	CAG	2	6	5233741	5233746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_013595	ACG	2	6	5233754	5233759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_013595	ACC	2	6	5233760	5233765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18084	NC_013595	GGCG	2	8	5233794	5233801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18085	NC_013595	GC	3	6	5233835	5233840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18086	NC_013595	TGCGCG	2	12	5233841	5233852	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18087	NC_013595	CGGC	2	8	5233858	5233865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18088	NC_013595	CCA	2	6	5233916	5233921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18089	NC_013595	GC	3	6	5233924	5233929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18090	NC_013595	GCG	2	6	5233956	5233961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18091	NC_013595	CAT	3	9	5233968	5233976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18092	NC_013595	CGC	3	9	5233980	5233988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18093	NC_013595	CTG	2	6	5234011	5234016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18094	NC_013595	CTG	2	6	5234041	5234046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18095	NC_013595	TC	3	6	5234071	5234076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18096	NC_013595	ATC	2	6	5234084	5234089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18097	NC_013595	GACGC	2	10	5234112	5234121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18098	NC_013595	CG	3	6	5234171	5234176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18099	NC_013595	GCC	2	6	5234203	5234208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18100	NC_013595	CGGCT	2	10	5234210	5234219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18101	NC_013595	TGC	2	6	5234244	5234249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18102	NC_013595	TTG	2	6	5234311	5234316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18103	NC_013595	AG	3	6	5234383	5234388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18104	NC_013595	CGA	2	6	5237935	5237940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18105	NC_013595	CCT	2	6	5237949	5237954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18106	NC_013595	TTCC	2	8	5237975	5237982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18107	NC_013595	GCGG	2	8	5243828	5243835	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18108	NC_013595	CGGTGG	2	12	5243912	5243923	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18109	NC_013595	GC	3	6	5243981	5243986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18110	NC_013595	CG	3	6	5244128	5244133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18111	NC_013595	TGCT	2	8	5244178	5244185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18112	NC_013595	TGG	2	6	5244214	5244219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_013595	GCAG	2	8	5244231	5244238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18114	NC_013595	TGG	2	6	5244245	5244250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_013595	TGA	2	6	5244273	5244278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_013595	GTT	2	6	5244280	5244285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_013595	GGGCC	2	10	5244286	5244295	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18118	NC_013595	CGG	2	6	5244320	5244325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18119	NC_013595	CCG	2	6	5244350	5244355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18120	NC_013595	GATC	2	8	5244450	5244457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18121	NC_013595	GT	3	6	5250485	5250490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_013595	GCT	2	6	5250510	5250515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18123	NC_013595	GATG	2	8	5250615	5250622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18124	NC_013595	GT	3	6	5250650	5250655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18125	NC_013595	TCG	2	6	5250717	5250722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18126	NC_013595	GTC	2	6	5250769	5250774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18127	NC_013595	CCG	2	6	5250825	5250830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18128	NC_013595	CCT	2	6	5251131	5251136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18129	NC_013595	CGA	2	6	5251189	5251194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18131	NC_013595	CCA	2	6	5251315	5251320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18133	NC_013595	CCG	2	6	5251365	5251370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18142	NC_013595	GCC	2	6	5252527	5252532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18249	NC_013595	CCA	2	6	5267572	5267577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18250	NC_013595	ACGA	2	8	5267590	5267597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18251	NC_013595	TCC	2	6	5267614	5267619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18252	NC_013595	GCC	2	6	5267715	5267720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18253	NC_013595	CAC	2	6	5267762	5267767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18254	NC_013595	TGGA	2	8	5267769	5267776	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18258	NC_013595	CG	3	6	5267858	5267863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18472	NC_013595	CTGC	2	8	5289744	5289751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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18496	NC_013595	TCAGG	2	10	5297609	5297618	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18497	NC_013595	CGC	2	6	5298062	5298067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18498	NC_013595	TCG	2	6	5298070	5298075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18499	NC_013595	CGAAGT	2	12	5298098	5298109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18500	NC_013595	AAG	2	6	5298149	5298154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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