MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sanguibacter keddieii DSM 10542 chromosome

Total Repeats: 11100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013521	CCG	2	6	4217538	4217543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_013521	GACCG	2	10	4217565	4217574	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11003	NC_013521	GCAC	2	8	4217585	4217592	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_013521	GC	3	6	4217628	4217633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_013521	GAC	2	6	4217644	4217649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_013521	AG	4	8	4217652	4217659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_013521	CAGG	2	8	4218423	4218430	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_013521	GC	3	6	4218472	4218477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_013521	AGC	2	6	4218478	4218483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_013521	GCT	2	6	4218512	4218517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_013521	GTCC	2	8	4219935	4219942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11012	NC_013521	CG	3	6	4220019	4220024	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11013	NC_013521	ACA	2	6	4220141	4220146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_013521	GTCT	2	8	4220147	4220154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11015	NC_013521	CA	3	6	4220223	4220228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_013521	CGCC	2	8	4221605	4221612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11017	NC_013521	GAG	2	6	4221691	4221696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_013521	GGGTGG	2	12	4221697	4221708	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_013521	GGGC	2	8	4222834	4222841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11020	NC_013521	CGG	2	6	4222848	4222853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_013521	CCG	2	6	4222868	4222873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_013521	CCTC	2	8	4222891	4222898	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11023	NC_013521	CCTG	2	8	4222913	4222920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_013521	TGC	2	6	4222925	4222930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_013521	CGA	2	6	4223678	4223683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_013521	GC	3	6	4223686	4223691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_013521	TC	3	6	4224234	4224239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_013521	CCT	2	6	4224589	4224594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_013521	AGG	2	6	4224626	4224631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_013521	CGGT	2	8	4224666	4224673	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_013521	CA	3	6	4224718	4224723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_013521	TGG	2	6	4224742	4224747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_013521	GCCG	2	8	4227587	4227594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_013521	G	6	6	4227644	4227649	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_013521	TCG	2	6	4227691	4227696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_013521	CCA	2	6	4227743	4227748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11037	NC_013521	TCGAT	2	10	4227882	4227891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11038	NC_013521	GAG	2	6	4227938	4227943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_013521	C	6	6	4229845	4229850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11040	NC_013521	CCCCT	2	10	4229898	4229907	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11041	NC_013521	CGG	2	6	4233163	4233168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_013521	ACG	2	6	4233195	4233200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_013521	CG	4	8	4233234	4233241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_013521	CGT	2	6	4233245	4233250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_013521	CT	3	6	4235743	4235748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_013521	TGG	2	6	4235768	4235773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_013521	TGG	2	6	4235780	4235785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_013521	ACA	2	6	4235803	4235808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_013521	GC	3	6	4240433	4240438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11050	NC_013521	GAC	3	9	4240442	4240450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_013521	GCC	2	6	4242310	4242315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_013521	ACC	2	6	4242346	4242351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_013521	AGC	2	6	4242402	4242407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_013521	CAC	2	6	4242429	4242434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11055	NC_013521	CCG	2	6	4242442	4242447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_013521	CAC	2	6	4242453	4242458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_013521	CGGG	2	8	4243818	4243825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_013521	CAC	4	12	4243835	4243846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_013521	CAG	2	6	4243878	4243883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_013521	CCT	2	6	4243898	4243903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11061	NC_013521	ACC	2	6	4243906	4243911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11062	NC_013521	CCCGG	2	10	4243947	4243956	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11063	NC_013521	CCG	2	6	4243976	4243981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11064	NC_013521	GC	3	6	4243995	4244000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_013521	CGG	2	6	4246440	4246445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_013521	GGC	2	6	4246448	4246453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_013521	GGC	2	6	4246455	4246460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_013521	CCG	2	6	4248756	4248761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11069	NC_013521	GCC	2	6	4248782	4248787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_013521	GCTG	2	8	4248793	4248800	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11071	NC_013521	TCC	2	6	4248854	4248859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_013521	GATCG	2	10	4248875	4248884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11073	NC_013521	GAC	2	6	4248899	4248904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_013521	ACT	2	6	4248926	4248931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_013521	GCG	2	6	4248962	4248967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11076	NC_013521	CGA	2	6	4248974	4248979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_013521	CGA	2	6	4248983	4248988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_013521	GAC	2	6	4249080	4249085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_013521	GGTT	2	8	4249151	4249158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_013521	GT	3	6	4249188	4249193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_013521	GCT	2	6	4249229	4249234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_013521	TCG	2	6	4249425	4249430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_013521	TGG	2	6	4249431	4249436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_013521	CGG	2	6	4249450	4249455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_013521	CGG	2	6	4249458	4249463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_013521	GC	3	6	4249464	4249469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_013521	GC	3	6	4250370	4250375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11088	NC_013521	GTG	2	6	4251021	4251026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_013521	AGC	2	6	4252167	4252172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_013521	TCG	2	6	4252176	4252181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_013521	CTC	2	6	4252200	4252205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11092	NC_013521	CGT	2	6	4252215	4252220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_013521	GTC	2	6	4252227	4252232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_013521	CGA	2	6	4252244	4252249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_013521	CCG	2	6	4252871	4252876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11096	NC_013521	GCA	2	6	4252926	4252931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_013521	ACCC	2	8	4253233	4253240	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11098	NC_013521	GAA	2	6	4253302	4253307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_013521	CGG	2	6	4253319	4253324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_013521	AAC	2	6	4253384	4253389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.