MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	TTTC	2	8	40	47	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013453	CT	3	6	89	94	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013453	TCA	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013453	T	6	6	111	116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013453	TAAA	2	8	395	402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013453	A	6	6	453	458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013453	A	8	8	478	485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013453	TCT	2	6	501	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013453	GAAT	2	8	511	518	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013453	AAT	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013453	ATT	2	6	610	615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013453	ATA	2	6	619	624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013453	CAA	2	6	630	635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013453	ATT	2	6	646	651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013453	AGT	2	6	709	714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013453	AGGATA	2	12	718	729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013453	AAG	2	6	756	761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013453	A	6	6	844	849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013453	TCT	2	6	855	860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013453	ATTA	2	8	870	877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013453	GAT	3	9	879	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013453	ATT	2	6	888	893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013453	AAT	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013453	TATGG	2	10	1038	1047	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013453	AT	3	6	1115	1120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013453	ATA	2	6	1151	1156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013453	TA	3	6	1155	1160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013453	GA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013453	T	6	6	1215	1220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013453	TAG	2	6	1240	1245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013453	TAT	2	6	1255	1260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013453	ACT	2	6	1269	1274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013453	ACT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013453	TA	4	8	1287	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013453	AT	3	6	1323	1328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013453	CCT	2	6	2938	2943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013453	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013453	AGT	2	6	3011	3016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013453	TCT	2	6	3065	3070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013453	AAT	2	6	3099	3104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013453	GAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013453	T	6	6	3231	3236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013453	T	7	7	3243	3249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013453	AAT	2	6	3287	3292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013453	AAAT	2	8	3307	3314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013453	T	6	6	3571	3576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013453	TG	4	8	4180	4187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013453	T	6	6	4215	4220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013453	TC	3	6	4238	4243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013453	T	6	6	4392	4397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013453	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013453	AT	3	6	4421	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013453	ACA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013453	AT	3	6	4540	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013453	GAA	2	6	4556	4561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013453	TAT	2	6	4592	4597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013453	ATC	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013453	A	6	6	5394	5399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013453	AAT	2	6	5406	5411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013453	TCCAA	2	10	5435	5444	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013453	AAT	2	6	5469	5474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013453	CTA	2	6	5543	5548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013453	TTA	2	6	5748	5753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013453	TAG	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013453	GTT	2	6	5804	5809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013453	TAT	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013453	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013453	ATC	2	6	5853	5858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013453	TAA	2	6	5866	5871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013453	AAAT	2	8	6033	6040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013453	ATT	3	9	6050	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013453	TTA	2	6	6068	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013453	ATT	2	6	7688	7693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013453	T	6	6	7713	7718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013453	ATT	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013453	T	7	7	7723	7729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013453	TTA	2	6	7790	7795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013453	AAT	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013453	TTAA	2	8	7871	7878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013453	TAT	2	6	7924	7929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013453	T	7	7	7929	7935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013453	TAT	2	6	7960	7965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013453	T	7	7	7986	7992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013453	TTA	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013453	AT	3	6	8031	8036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013453	TGA	2	6	8082	8087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013453	ATT	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013453	T	6	6	8127	8132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013453	AAGATG	2	12	8586	8597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013453	A	6	6	8634	8639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013453	A	6	6	8650	8655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013453	TA	3	6	8656	8661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013453	GCT	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013453	A	6	6	8683	8688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013453	TTA	2	6	8699	8704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013453	AAT	2	6	8753	8758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013453	AAATC	2	10	8806	8815	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_013453	A	6	6	8825	8830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013453	ACA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013453	TATAA	2	10	9908	9917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013453	TAT	2	6	9920	9925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013453	A	6	6	9970	9975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013453	AACAAA	2	12	9984	9995	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013453	T	7	7	10008	10014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013453	AGGA	2	8	11316	11323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013453	GA	3	6	11322	11327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013453	A	7	7	12005	12011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013453	TAT	3	9	12012	12020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013453	TAT	2	6	12036	12041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013453	ATC	2	6	12073	12078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013453	T	6	6	12115	12120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013453	AGA	2	6	12815	12820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013453	TAT	2	6	12888	12893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013453	T	6	6	12918	12923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013453	AT	3	6	12948	12953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013453	T	6	6	12969	12974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013453	GAA	2	6	12977	12982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013453	TA	3	6	12987	12992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013453	A	6	6	13151	13156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013453	ATA	2	6	13173	13178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013453	A	6	6	13178	13183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013453	A	7	7	13222	13228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013453	TAT	2	6	13250	13255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013453	TTCA	2	8	13285	13292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013453	CT	3	6	13334	13339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013453	T	6	6	13339	13344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013453	ATA	2	6	13366	13371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013453	CTG	2	6	13382	13387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013453	T	6	6	14089	14094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013453	AAG	2	6	14151	14156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013453	AAG	2	6	14159	14164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013453	TAA	2	6	14177	14182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013453	CAA	2	6	14237	14242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013453	T	6	6	14967	14972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013453	TATTTA	2	12	15070	15081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013453	AATT	2	8	15114	15121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013453	CTT	2	6	15133	15138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013453	AT	4	8	15150	15157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013453	AT	3	6	15201	15206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013453	CAA	2	6	15233	15238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013453	TCA	2	6	15239	15244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_013453	AGT	2	6	15285	15290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013453	ATACC	2	10	15316	15325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_013453	ATT	2	6	15361	15366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013453	TTAA	2	8	15380	15387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013453	AAT	2	6	15394	15399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013453	AG	3	6	15409	15414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013453	AGA	2	6	16320	16325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013453	ATT	2	6	16337	16342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013453	ATATA	2	10	17122	17131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013453	AAT	2	6	17168	17173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013453	GCA	2	6	17185	17190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013453	TTG	2	6	17251	17256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.