MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013159	CGG	2	6	1422200	1422205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013159	CCCGGA	2	12	1422233	1422244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_013159	CCG	2	6	1422261	1422266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_013159	CGC	2	6	1422327	1422332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_013159	TTC	2	6	1422336	1422341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013159	CGGC	2	8	1422362	1422369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_013159	CGT	2	6	1424906	1424911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013159	GGT	2	6	1424922	1424927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013159	GAG	2	6	1424933	1424938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_013159	AGGG	2	8	1426058	1426065	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013159	GGT	2	6	1426066	1426071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013159	GGCC	2	8	1426311	1426318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_013159	CAG	2	6	1426327	1426332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_013159	GTT	2	6	1426389	1426394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_013159	GGCT	2	8	1426446	1426453	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_013159	CCG	2	6	1426521	1426526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_013159	C	6	6	1426599	1426604	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3518	NC_013159	ACT	2	6	1426637	1426642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013159	ACA	2	6	1426660	1426665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013159	CTG	2	6	1426679	1426684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013159	ACTC	2	8	1426754	1426761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_013159	CCGG	2	8	1426780	1426787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_013159	GCC	2	6	1426826	1426831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_013159	GCTGAT	2	12	1426851	1426862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3525	NC_013159	CAC	2	6	1426869	1426874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3526	NC_013159	TCT	2	6	1426878	1426883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013159	TGAA	2	8	1426918	1426925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013159	CG	3	6	1426973	1426978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_013159	TCA	2	6	1426994	1426999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013159	CG	3	6	1427034	1427039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_013159	CG	3	6	1427095	1427100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_013159	GT	3	6	1427144	1427149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_013159	CG	3	6	1427156	1427161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_013159	CG	3	6	1427217	1427222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_013159	GGCAAC	2	12	1427378	1427389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_013159	ATC	2	6	1427476	1427481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_013159	GT	3	6	1427492	1427497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013159	GTTGG	2	10	1427662	1427671	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013159	CTC	2	6	1427740	1427745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_013159	GTGC	2	8	1427785	1427792	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_013159	CA	3	6	1427864	1427869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_013159	CTTGG	2	10	1427882	1427891	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3543	NC_013159	CAG	2	6	1427946	1427951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_013159	CGC	2	6	1428078	1428083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_013159	CGG	2	6	1428107	1428112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013159	GTTT	2	8	1428167	1428174	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013159	TA	3	6	1428290	1428295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013159	ACC	2	6	1432799	1432804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_013159	CAA	2	6	1434692	1434697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013159	CGG	2	6	1434748	1434753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013159	CGG	2	6	1434794	1434799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013159	TGC	2	6	1434919	1434924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013159	GTGAAT	2	12	1435610	1435621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013159	CTC	2	6	1435629	1435634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_013159	GAC	2	6	1435769	1435774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013159	TTG	2	6	1435811	1435816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013159	GGT	2	6	1435881	1435886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_013159	GCC	2	6	1435892	1435897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_013159	GTCT	2	8	1435898	1435905	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_013159	CCG	2	6	1435934	1435939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_013159	GGC	2	6	1435942	1435947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013159	GTC	2	6	1436021	1436026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013159	AGC	2	6	1436118	1436123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_013159	CACG	2	8	1436125	1436132	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_013159	CA	3	6	1436156	1436161	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_013159	TGT	2	6	1436193	1436198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013159	GCG	2	6	1436239	1436244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013159	TG	3	6	1436281	1436286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013159	TCT	2	6	1436335	1436340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013159	TCG	2	6	1436446	1436451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_013159	CCGCG	2	10	1436479	1436488	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3572	NC_013159	CG	4	8	1436485	1436492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_013159	GATG	2	8	1436516	1436523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013159	GAT	2	6	1436556	1436561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013159	TCT	2	6	1436617	1436622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_013159	GTTT	2	8	1436706	1436713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_013159	GTG	2	6	1436764	1436769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013159	CGC	2	6	1437000	1437005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_013159	CGA	2	6	1437072	1437077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013159	TCG	2	6	1437082	1437087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_013159	GGAG	2	8	1437097	1437104	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013159	GT	3	6	1440040	1440045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013159	CGGT	2	8	1440084	1440091	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_013159	CGG	2	6	1440108	1440113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_013159	CCG	2	6	1440117	1440122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_013159	TCC	2	6	1440780	1440785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3587	NC_013159	CGG	2	6	1440840	1440845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_013159	GGT	2	6	1440906	1440911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013159	CGGACG	2	12	1441146	1441157	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013159	CCCG	2	8	1441231	1441238	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3591	NC_013159	ACC	2	6	1441265	1441270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_013159	GGT	2	6	1441364	1441369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_013159	GCT	2	6	1441414	1441419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_013159	TTC	2	6	1441490	1441495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013159	CCCG	2	8	1441549	1441556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3596	NC_013159	GGGC	2	8	1441884	1441891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_013159	CGTC	2	8	1442057	1442064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_013159	G	6	6	1442067	1442072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013159	GTG	2	6	1442074	1442079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013159	GTG	2	6	1442178	1442183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013159	CG	3	6	1442209	1442214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_013159	TCT	2	6	1442215	1442220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013159	GTG	2	6	1442221	1442226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013159	GCT	2	6	1442282	1442287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013159	GTC	2	6	1442354	1442359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013159	TG	3	6	1442439	1442444	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_013159	TCG	3	9	1442449	1442457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013159	CGA	2	6	1442485	1442490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_013159	CG	3	6	1443621	1443626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_013159	ACC	2	6	1443672	1443677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_013159	TACGG	2	10	1443701	1443710	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3612	NC_013159	CGA	2	6	1443715	1443720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013159	G	6	6	1443771	1443776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013159	AGA	2	6	1443845	1443850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013159	CCGA	2	8	1443912	1443919	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_013159	CGA	2	6	1444010	1444015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_013159	TTCG	2	8	1444026	1444033	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3618	NC_013159	AGC	2	6	1445875	1445880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_013159	CGG	3	9	1445894	1445902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_013159	GGC	2	6	1445907	1445912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013159	GCG	2	6	1446763	1446768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013159	GGTGG	2	10	1446792	1446801	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013159	ACCG	2	8	1446812	1446819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_013159	CGG	2	6	1446834	1446839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_013159	CTCG	2	8	1446847	1446854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_013159	CCGCG	2	10	1446868	1446877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3627	NC_013159	AGA	2	6	1446899	1446904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_013159	CTG	2	6	1446906	1446911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_013159	CGA	2	6	1447176	1447181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_013159	TCGA	2	8	1447233	1447240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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