MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013159	CGT	2	6	1236911	1236916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_013159	AGT	2	6	1236955	1236960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013159	GTT	2	6	1237551	1237556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_013159	CCG	2	6	1237583	1237588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_013159	CTA	2	6	1237599	1237604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_013159	CGTG	2	8	1237667	1237674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_013159	TTG	2	6	1237676	1237681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013159	G	6	6	1237733	1237738	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_013159	GTC	2	6	1237802	1237807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_013159	GTG	2	6	1237882	1237887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_013159	GTG	2	6	1237962	1237967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013159	CTT	2	6	1237981	1237986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013159	GGC	2	6	1238956	1238961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_013159	C	7	7	1238961	1238967	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3015	NC_013159	GT	3	6	1240195	1240200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_013159	CGC	3	9	1240233	1240241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_013159	GGTG	2	8	1240266	1240273	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013159	GCC	2	6	1240282	1240287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_013159	CG	3	6	1240317	1240322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_013159	GAT	2	6	1240349	1240354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013159	GC	3	6	1240405	1240410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_013159	C	6	6	1240442	1240447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3023	NC_013159	TCC	2	6	1240487	1240492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_013159	GCC	2	6	1240495	1240500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_013159	CTGC	2	8	1240555	1240562	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3026	NC_013159	CGC	2	6	1240593	1240598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_013159	CG	3	6	1240603	1240608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3028	NC_013159	GTC	2	6	1240637	1240642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_013159	GACAC	2	10	1240666	1240675	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3030	NC_013159	CGC	2	6	1240678	1240683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_013159	TCGT	2	8	1240713	1240720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_013159	CGA	2	6	1241000	1241005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_013159	GTG	2	6	1241031	1241036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013159	CGG	2	6	1241052	1241057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_013159	TGT	2	6	1241059	1241064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013159	CTGA	2	8	1241126	1241133	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_013159	CACC	2	8	1241143	1241150	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3038	NC_013159	CGC	2	6	1241255	1241260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_013159	GCC	2	6	1241268	1241273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_013159	CGG	2	6	1241324	1241329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_013159	CGG	2	6	1241339	1241344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_013159	GATCA	2	10	1241366	1241375	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3043	NC_013159	CTCG	2	8	1241380	1241387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3044	NC_013159	GCCTG	2	10	1241514	1241523	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3045	NC_013159	CG	3	6	1241541	1241546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_013159	CGA	2	6	1241602	1241607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_013159	TG	3	6	1241728	1241733	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_013159	ATC	2	6	1241741	1241746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_013159	TCGT	2	8	1241783	1241790	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3050	NC_013159	GCG	2	6	1241846	1241851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_013159	GAA	2	6	1241958	1241963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013159	GAC	2	6	1241967	1241972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_013159	TGTT	2	8	1242229	1242236	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013159	TGG	2	6	1242283	1242288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013159	G	6	6	1243514	1243519	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013159	GGCGC	2	10	1243535	1243544	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3057	NC_013159	TCG	2	6	1243587	1243592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_013159	CGG	2	6	1243610	1243615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_013159	TGC	2	6	1243718	1243723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_013159	GCT	2	6	1243725	1243730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_013159	GTC	2	6	1244785	1244790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_013159	GAC	2	6	1244791	1244796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_013159	G	6	6	1244821	1244826	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_013159	GA	3	6	1244899	1244904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_013159	CT	3	6	1244909	1244914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_013159	CGT	2	6	1244933	1244938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_013159	CG	3	6	1244985	1244990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3068	NC_013159	CGC	2	6	1245025	1245030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3069	NC_013159	ACG	2	6	1245098	1245103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_013159	CCCA	2	8	1245147	1245154	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3071	NC_013159	TGA	2	6	1245184	1245189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013159	CCGG	2	8	1245190	1245197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3073	NC_013159	CGC	2	6	1245212	1245217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_013159	GCC	2	6	1245257	1245262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3075	NC_013159	ACC	2	6	1245307	1245312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_013159	CCG	2	6	1245318	1245323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_013159	GCCC	2	8	1245362	1245369	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3078	NC_013159	GCGA	2	8	1245435	1245442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3079	NC_013159	ACC	2	6	1245443	1245448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_013159	AGC	2	6	1245459	1245464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_013159	GTGCG	2	10	1245545	1245554	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3082	NC_013159	CGG	2	6	1245592	1245597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_013159	CGG	2	6	1245607	1245612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_013159	GTA	2	6	1245635	1245640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013159	GT	3	6	1245691	1245696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013159	AGT	2	6	1245709	1245714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_013159	GAA	2	6	1245737	1245742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_013159	CAGC	2	8	1245779	1245786	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3089	NC_013159	GGT	2	6	1245853	1245858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013159	TTC	2	6	1245899	1245904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_013159	AGC	2	6	1246057	1246062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_013159	GCCCA	2	10	1246071	1246080	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3093	NC_013159	GTC	2	6	1246082	1246087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_013159	GTC	2	6	1246116	1246121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_013159	CTC	2	6	1246187	1246192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_013159	TGGGG	2	10	1246228	1246237	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_013159	CCT	2	6	1248243	1248248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_013159	CGTG	2	8	1248261	1248268	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3099	NC_013159	GTG	2	6	1248272	1248277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_013159	AGG	3	9	1248288	1248296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013159	CGT	2	6	1252359	1252364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013159	GT	3	6	1252363	1252368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013159	GGCA	2	8	1252371	1252378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_013159	TACG	2	8	1252471	1252478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3105	NC_013159	TCG	2	6	1252506	1252511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3106	NC_013159	GGC	2	6	1252512	1252517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_013159	GGT	2	6	1252549	1252554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013159	CTG	2	6	1252612	1252617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_013159	CGA	2	6	1252622	1252627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_013159	TTG	2	6	1252663	1252668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013159	GGA	2	6	1252689	1252694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013159	TGG	2	6	1254040	1254045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013159	CAC	2	6	1254051	1254056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3114	NC_013159	GCC	2	6	1255652	1255657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_013159	AGGC	2	8	1255701	1255708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_013159	GCA	2	6	1255718	1255723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_013159	AGG	2	6	1256334	1256339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013159	GCGG	2	8	1256997	1257004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3119	NC_013159	GCC	2	6	1257019	1257024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_013159	ACGGG	2	10	1257091	1257100	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3121	NC_013159	CTC	2	6	1260794	1260799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_013159	TCCT	2	8	1261665	1261672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_013159	CGT	2	6	1261675	1261680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_013159	ATG	2	6	1261692	1261697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013159	CGA	2	6	1261710	1261715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_013159	GC	3	6	1266120	1266125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_013159	TTTG	2	8	1266159	1266166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013159	CTC	2	6	1267850	1267855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3129	NC_013159	TCG	2	6	1271896	1271901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_013159	AC	3	6	1271938	1271943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_013159	TGAC	2	8	1275566	1275573	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_013159	GGC	2	6	1275616	1275621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3139	NC_013159	ACC	2	6	1275833	1275838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3257	NC_013159	TCGC	2	8	1309963	1309970	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3258	NC_013159	CG	3	6	1309992	1309997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3259	NC_013159	GGC	2	6	1309999	1310004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3261	NC_013159	CAG	2	6	1310096	1310101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_013159	CGA	2	6	1310265	1310270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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