MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_013159	GGTC	2	8	4227732	4227739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12002	NC_013159	CCCTG	2	10	4227771	4227780	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12003	NC_013159	TGT	2	6	4227789	4227794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_013159	CCG	2	6	4227800	4227805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12005	NC_013159	CGG	2	6	4228723	4228728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_013159	GCC	2	6	4228732	4228737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12007	NC_013159	CGG	2	6	4228753	4228758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12008	NC_013159	CGA	2	6	4230624	4230629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_013159	GTT	2	6	4230711	4230716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_013159	TC	3	6	4230779	4230784	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12011	NC_013159	CGCTC	2	10	4233593	4233602	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12012	NC_013159	CGG	2	6	4233615	4233620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_013159	GACA	2	8	4235695	4235702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12014	NC_013159	CGGA	2	8	4235716	4235723	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12015	NC_013159	CA	3	6	4235821	4235826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12016	NC_013159	ACG	3	9	4235858	4235866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_013159	CGG	2	6	4235880	4235885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12018	NC_013159	GGA	2	6	4235982	4235987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12019	NC_013159	T	6	6	4237778	4237783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12020	NC_013159	GGC	2	6	4239234	4239239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_013159	TC	3	6	4239258	4239263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12022	NC_013159	GGC	2	6	4242304	4242309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12023	NC_013159	CGT	2	6	4248178	4248183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12026	NC_013159	CG	3	6	4250070	4250075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12027	NC_013159	CCGG	2	8	4250081	4250088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12028	NC_013159	CGGT	2	8	4250101	4250108	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12030	NC_013159	CGGCG	2	10	4250123	4250132	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12031	NC_013159	GGT	2	6	4250732	4250737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12033	NC_013159	AAGC	2	8	4253642	4253649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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12038	NC_013159	CG	3	6	4254511	4254516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12039	NC_013159	CG	3	6	4254522	4254527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12040	NC_013159	TCAC	2	8	4254537	4254544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12047	NC_013159	CGT	3	9	4256523	4256531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12049	NC_013159	GGTTC	2	10	4257043	4257052	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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12051	NC_013159	GGA	2	6	4257125	4257130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12053	NC_013159	CCT	2	6	4257216	4257221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12055	NC_013159	GCCC	2	8	4257248	4257255	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12056	NC_013159	CCGCGG	2	12	4257264	4257275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12057	NC_013159	GCC	2	6	4257356	4257361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12060	NC_013159	CGGC	2	8	4257413	4257420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12062	NC_013159	GGC	2	6	4257485	4257490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12063	NC_013159	ACCG	2	8	4257503	4257510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12064	NC_013159	CGG	2	6	4257533	4257538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12065	NC_013159	GCC	2	6	4257545	4257550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12067	NC_013159	CGCC	2	8	4257591	4257598	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12068	NC_013159	GCGA	2	8	4257610	4257617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12074	NC_013159	CCT	2	6	4264508	4264513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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12078	NC_013159	CA	3	6	4265400	4265405	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12079	NC_013159	TTCC	2	8	4266158	4266165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12080	NC_013159	CGG	2	6	4266174	4266179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12081	NC_013159	GCCGTT	2	12	4266200	4266211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12084	NC_013159	CA	4	8	4269851	4269858	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12087	NC_013159	CGCC	2	8	4270073	4270080	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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12091	NC_013159	GGA	2	6	4271598	4271603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12093	NC_013159	CG	3	6	4272497	4272502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12094	NC_013159	CCG	2	6	4276265	4276270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12095	NC_013159	TCAG	2	8	4278807	4278814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12096	NC_013159	CCG	2	6	4278837	4278842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12097	NC_013159	CACC	2	8	4278887	4278894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12098	NC_013159	TTC	2	6	4278979	4278984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12099	NC_013159	GAC	2	6	4279032	4279037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12101	NC_013159	CGG	2	6	4279089	4279094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12102	NC_013159	TCC	2	6	4281964	4281969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12103	NC_013159	AAC	2	6	4281988	4281993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12104	NC_013159	C	6	6	4281998	4282003	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12105	NC_013159	ACCG	2	8	4282031	4282038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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12107	NC_013159	CAA	2	6	4282156	4282161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12108	NC_013159	GCG	2	6	4282191	4282196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12109	NC_013159	CA	3	6	4282814	4282819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12110	NC_013159	GCA	2	6	4282890	4282895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_013159	GTG	2	6	4282913	4282918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_013159	GAC	2	6	4282929	4282934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12113	NC_013159	GC	3	6	4282952	4282957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12114	NC_013159	ACC	2	6	4282973	4282978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12115	NC_013159	CTC	2	6	4283203	4283208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12116	NC_013159	GCCG	2	8	4283216	4283223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12117	NC_013159	AC	3	6	4283330	4283335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12118	NC_013159	TCG	2	6	4283965	4283970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12119	NC_013159	GC	3	6	4283985	4283990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12120	NC_013159	CTC	2	6	4283995	4284000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12121	NC_013159	GTC	2	6	4284068	4284073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12122	NC_013159	CTC	2	6	4284076	4284081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12123	NC_013159	CCG	2	6	4284206	4284211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12126	NC_013159	CCG	2	6	4284262	4284267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12127	NC_013159	GAA	2	6	4284358	4284363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12128	NC_013159	G	6	6	4286353	4286358	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12129	NC_013159	CGGT	2	8	4286361	4286368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12130	NC_013159	TAC	2	6	4288016	4288021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12131	NC_013159	GCC	2	6	4290826	4290831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12132	NC_013159	CCT	2	6	4290869	4290874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12133	NC_013159	CGA	2	6	4290875	4290880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12134	NC_013159	CG	3	6	4290918	4290923	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12135	NC_013159	CGG	2	6	4290950	4290955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12136	NC_013159	CAA	2	6	4290956	4290961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12137	NC_013159	GGC	2	6	4291055	4291060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12138	NC_013159	CGC	2	6	4291080	4291085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12139	NC_013159	CAC	2	6	4291086	4291091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12140	NC_013159	CGT	2	6	4291116	4291121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12141	NC_013159	CGC	3	9	4291122	4291130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12142	NC_013159	CCCG	2	8	4291138	4291145	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12143	NC_013159	CG	3	6	4291148	4291153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12144	NC_013159	CCCGCC	2	12	4291186	4291197	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
12145	NC_013159	GTCCG	2	10	4291210	4291219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12146	NC_013159	CCG	2	6	4291245	4291250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12147	NC_013159	CTC	2	6	4291287	4291292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12148	NC_013159	ACG	2	6	4291339	4291344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12149	NC_013159	CCCG	2	8	4293185	4293192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12150	NC_013159	GGC	2	6	4293269	4293274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12151	NC_013159	TTG	2	6	4294815	4294820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12152	NC_013159	ACA	2	6	4294842	4294847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12153	NC_013159	GT	3	6	4296321	4296326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12154	NC_013159	GACG	2	8	4296335	4296342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12155	NC_013159	AGC	2	6	4296382	4296387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12156	NC_013159	GA	3	6	4297425	4297430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12157	NC_013159	CGGCA	2	10	4297889	4297898	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12158	NC_013159	GAG	2	6	4297979	4297984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12159	NC_013159	CAG	3	9	4299137	4299145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12160	NC_013159	CCAC	2	8	4299150	4299157	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12161	NC_013159	CGT	2	6	4299889	4299894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12162	NC_013159	GAA	2	6	4299916	4299921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12163	NC_013159	CCG	2	6	4299962	4299967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12164	NC_013159	AACG	2	8	4300084	4300091	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12165	NC_013159	AAC	2	6	4300098	4300103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12166	NC_013159	GAAGCG	2	12	4300117	4300128	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12167	NC_013159	GT	3	6	4300131	4300136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12168	NC_013159	CGC	2	6	4301481	4301486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12169	NC_013159	CA	3	6	4301497	4301502	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12170	NC_013159	GAG	2	6	4301530	4301535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12171	NC_013159	TGG	2	6	4302500	4302505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12172	NC_013159	CCA	2	6	4302510	4302515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12173	NC_013159	TTG	2	6	4305239	4305244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12174	NC_013159	CG	3	6	4305326	4305331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12175	NC_013159	CCG	2	6	4305392	4305397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12177	NC_013159	GCCG	2	8	4307358	4307365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12178	NC_013159	CGT	2	6	4307757	4307762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12181	NC_013159	GCC	2	6	4308016	4308021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12182	NC_013159	CTG	2	6	4308056	4308061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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