MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_013159	GCA	2	6	3146382	3146387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_013159	AC	3	6	3146422	3146427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9003	NC_013159	CT	3	6	3146596	3146601	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9004	NC_013159	CGT	2	6	3146602	3146607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_013159	AGGG	2	8	3146653	3146660	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_013159	TGCTG	2	10	3146749	3146758	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9007	NC_013159	GAC	2	6	3147911	3147916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_013159	CGA	2	6	3148412	3148417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_013159	AGC	2	6	3148442	3148447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_013159	CCA	2	6	3148737	3148742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_013159	TAG	2	6	3148835	3148840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_013159	GAA	2	6	3148961	3148966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_013159	GTT	2	6	3149076	3149081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_013159	CGC	2	6	3149135	3149140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9015	NC_013159	TAG	2	6	3149160	3149165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_013159	CCCCT	2	10	3149184	3149193	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9017	NC_013159	CGC	2	6	3149460	3149465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9018	NC_013159	GTCC	2	8	3149544	3149551	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9019	NC_013159	TCGGG	2	10	3149584	3149593	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9020	NC_013159	GCC	2	6	3149596	3149601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_013159	AGG	2	6	3149626	3149631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_013159	GTAC	2	8	3149691	3149698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_013159	GGA	2	6	3149713	3149718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_013159	CGA	2	6	3150773	3150778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_013159	ACG	2	6	3150813	3150818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_013159	CGT	2	6	3150839	3150844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_013159	GACC	2	8	3151893	3151900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9028	NC_013159	TCC	2	6	3151928	3151933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9029	NC_013159	TGA	2	6	3151967	3151972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_013159	GCT	2	6	3151999	3152004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_013159	ACCC	2	8	3152027	3152034	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9032	NC_013159	TTTC	2	8	3152045	3152052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9033	NC_013159	GTG	2	6	3152061	3152066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_013159	CCG	2	6	3152067	3152072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9035	NC_013159	CA	3	6	3152100	3152105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_013159	TGA	2	6	3152121	3152126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_013159	AAC	2	6	3152212	3152217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_013159	CGAC	2	8	3152249	3152256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9039	NC_013159	AACG	2	8	3152269	3152276	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9040	NC_013159	ACG	2	6	3152284	3152289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_013159	GGA	2	6	3152324	3152329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_013159	CGAC	2	8	3152338	3152345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_013159	CT	3	6	3152738	3152743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9044	NC_013159	CCG	2	6	3152807	3152812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9045	NC_013159	TCG	2	6	3152820	3152825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_013159	ACG	2	6	3152826	3152831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_013159	GTC	2	6	3153065	3153070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_013159	GAG	2	6	3153156	3153161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_013159	GAACAC	2	12	3153200	3153211	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_013159	GTT	2	6	3153324	3153329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_013159	CCCG	2	8	3153330	3153337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9052	NC_013159	CCG	2	6	3154607	3154612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9053	NC_013159	TCG	2	6	3154620	3154625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_013159	GCC	2	6	3154633	3154638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_013159	CGAA	2	8	3154662	3154669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_013159	GTCG	2	8	3154692	3154699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9057	NC_013159	CGGCG	2	10	3154791	3154800	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9058	NC_013159	CAC	2	6	3155037	3155042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9059	NC_013159	GGCT	2	8	3155111	3155118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9060	NC_013159	GGC	2	6	3155151	3155156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_013159	GC	4	8	3155161	3155168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_013159	AGC	2	6	3155206	3155211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_013159	GCC	2	6	3155235	3155240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9064	NC_013159	GCGCC	2	10	3156295	3156304	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9065	NC_013159	CCA	2	6	3156332	3156337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9066	NC_013159	CGT	2	6	3156368	3156373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_013159	GCCG	2	8	3156383	3156390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9068	NC_013159	GCCG	2	8	3157827	3157834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_013159	GTCCAG	2	12	3157870	3157881	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_013159	CG	3	6	3157882	3157887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9071	NC_013159	CG	3	6	3157909	3157914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_013159	GCC	2	6	3158577	3158582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9073	NC_013159	GGACC	2	10	3158589	3158598	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9074	NC_013159	CGG	2	6	3160230	3160235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_013159	GCG	2	6	3160841	3160846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_013159	GAC	2	6	3162217	3162222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_013159	GCG	2	6	3162239	3162244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9078	NC_013159	TGT	2	6	3162246	3162251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_013159	CTC	2	6	3163329	3163334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9080	NC_013159	ACG	2	6	3165548	3165553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_013159	CCA	2	6	3165559	3165564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9082	NC_013159	CG	3	6	3165572	3165577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9083	NC_013159	GCC	2	6	3165595	3165600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9084	NC_013159	CAC	2	6	3165629	3165634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9085	NC_013159	GGC	2	6	3165642	3165647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_013159	AAT	2	6	3165672	3165677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_013159	GT	3	6	3168554	3168559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_013159	CGG	2	6	3170710	3170715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9089	NC_013159	CCGAC	2	10	3170735	3170744	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9090	NC_013159	CCTC	2	8	3173133	3173140	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9091	NC_013159	TGT	2	6	3173146	3173151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_013159	CCT	2	6	3174962	3174967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9093	NC_013159	CGGG	2	8	3175001	3175008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9094	NC_013159	TC	3	6	3175036	3175041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9095	NC_013159	AGG	2	6	3175229	3175234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_013159	CGAA	2	8	3175996	3176003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9097	NC_013159	CGGTCA	2	12	3176556	3176567	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_013159	GCG	2	6	3176571	3176576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9099	NC_013159	CGG	2	6	3176657	3176662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9100	NC_013159	CGA	2	6	3176669	3176674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_013159	CCGC	2	8	3176732	3176739	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9102	NC_013159	ACCA	2	8	3176758	3176765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_013159	CGAGC	2	10	3176808	3176817	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9104	NC_013159	GC	4	8	3176832	3176839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9105	NC_013159	GCC	2	6	3176868	3176873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9106	NC_013159	CGT	2	6	3178390	3178395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_013159	TCGCGT	2	12	3178418	3178429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9108	NC_013159	CCG	2	6	3178431	3178436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9109	NC_013159	GCAC	2	8	3178466	3178473	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9110	NC_013159	GTCC	2	8	3178485	3178492	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9111	NC_013159	GCG	2	6	3180822	3180827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_013159	CAA	2	6	3181823	3181828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_013159	TCG	3	9	3181921	3181929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_013159	CGT	2	6	3181931	3181936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_013159	CGC	2	6	3181937	3181942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9116	NC_013159	CCG	2	6	3181948	3181953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9117	NC_013159	TCG	2	6	3181954	3181959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9118	NC_013159	CGC	2	6	3181964	3181969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9119	NC_013159	CGG	2	6	3181971	3181976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_013159	C	6	6	3182680	3182685	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9121	NC_013159	CGTG	2	8	3184134	3184141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9122	NC_013159	ACAG	2	8	3185080	3185087	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9123	NC_013159	GCC	2	6	3186584	3186589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9124	NC_013159	GACC	2	8	3189617	3189624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_013159	TCG	2	6	3189648	3189653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9126	NC_013159	GC	4	8	3189769	3189776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9127	NC_013159	CAT	2	6	3189824	3189829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9128	NC_013159	CGA	4	12	3189878	3189889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9129	NC_013159	ACCA	2	8	3192042	3192049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9131	NC_013159	TG	3	6	3192136	3192141	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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9262	NC_013159	CCA	2	6	3254025	3254030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9263	NC_013159	GCG	2	6	3255701	3255706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9264	NC_013159	TCC	2	6	3256747	3256752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9265	NC_013159	ATCC	2	8	3256755	3256762	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9266	NC_013159	CGC	2	6	3256768	3256773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9273	NC_013159	TCC	2	6	3259666	3259671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9274	NC_013159	GTG	2	6	3259686	3259691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9284	NC_013159	GGGCC	2	10	3260154	3260163	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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9291	NC_013159	CGC	2	6	3261947	3261952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9295	NC_013159	CGC	2	6	3262103	3262108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9322	NC_013159	CCGG	2	8	3262985	3262992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9387	NC_013159	C	6	6	3265579	3265584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9388	NC_013159	CAG	2	6	3265628	3265633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9390	NC_013159	CGA	2	6	3265709	3265714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9391	NC_013159	CGG	2	6	3265751	3265756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9392	NC_013159	TGC	2	6	3265759	3265764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9394	NC_013159	CGC	2	6	3265827	3265832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9395	NC_013159	CGA	2	6	3265881	3265886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9396	NC_013159	CACAC	2	10	3265906	3265915	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9397	NC_013159	CG	3	6	3265948	3265953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9398	NC_013159	CAC	2	6	3265961	3265966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9399	NC_013159	CGA	2	6	3266013	3266018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9400	NC_013159	CGC	2	6	3266023	3266028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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9402	NC_013159	GGC	2	6	3266070	3266075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9433	NC_013159	GGC	2	6	3274639	3274644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9477	NC_013159	CG	3	6	3297908	3297913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9478	NC_013159	AC	3	6	3297930	3297935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9479	NC_013159	C	8	8	3298012	3298019	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9480	NC_013159	AGG	2	6	3298079	3298084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9481	NC_013159	ACC	2	6	3298115	3298120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9482	NC_013159	ACC	2	6	3298137	3298142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9483	NC_013159	CAA	2	6	3298283	3298288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9486	NC_013159	GAC	2	6	3298455	3298460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9488	NC_013159	ACCGA	2	10	3298513	3298522	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9489	NC_013159	TCG	2	6	3298555	3298560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9491	NC_013159	ACG	2	6	3298636	3298641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9493	NC_013159	GCGAC	2	10	3298666	3298675	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9494	NC_013159	CAC	2	6	3298711	3298716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9498	NC_013159	CGC	2	6	3300514	3300519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9499	NC_013159	GAG	2	6	3301061	3301066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9500	NC_013159	ATG	2	6	3305879	3305884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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