MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Saccharomonospora viridis DSM 43017 chromosome

Total Repeats: 12182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013159	GA	3	6	2812508	2812513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_013159	TAGT	2	8	2812551	2812558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_013159	GTCC	2	8	2813198	2813205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_013159	CGTC	2	8	2813294	2813301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8005	NC_013159	TCG	2	6	2813310	2813315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_013159	CAC	2	6	2813342	2813347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_013159	TGC	2	6	2813349	2813354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_013159	GAC	2	6	2813840	2813845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_013159	GAC	2	6	2813896	2813901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_013159	AAC	2	6	2813921	2813926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_013159	CCTG	2	8	2813958	2813965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_013159	TCC	2	6	2814006	2814011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8013	NC_013159	TCC	2	6	2814019	2814024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_013159	TCG	2	6	2814459	2814464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_013159	AAC	2	6	2814481	2814486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_013159	ACG	2	6	2814607	2814612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_013159	CGC	2	6	2814712	2814717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_013159	ACCG	2	8	2814724	2814731	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8019	NC_013159	GAG	2	6	2814745	2814750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_013159	GAA	2	6	2817006	2817011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_013159	CGG	2	6	2818532	2818537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_013159	GAC	2	6	2819588	2819593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_013159	TG	3	6	2819613	2819618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_013159	GCC	2	6	2819629	2819634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_013159	TCAGC	2	10	2819680	2819689	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8026	NC_013159	TGT	2	6	2819825	2819830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_013159	CGGTG	2	10	2819886	2819895	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8028	NC_013159	CCG	2	6	2819938	2819943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_013159	TCGGC	2	10	2819971	2819980	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8030	NC_013159	GGGC	2	8	2819981	2819988	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8031	NC_013159	GGCGTC	2	12	2819991	2820002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_013159	CGA	2	6	2820023	2820028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_013159	GCC	2	6	2820099	2820104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_013159	GAC	2	6	2820140	2820145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_013159	CAG	2	6	2820252	2820257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_013159	GAGG	2	8	2820357	2820364	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_013159	CA	3	6	2820372	2820377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_013159	CGG	2	6	2820472	2820477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_013159	CGA	2	6	2820511	2820516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_013159	TGC	2	6	2820584	2820589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_013159	CCGG	2	8	2820616	2820623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_013159	ACC	2	6	2820741	2820746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_013159	ACC	2	6	2820755	2820760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8044	NC_013159	ACG	2	6	2820827	2820832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_013159	GACCA	2	10	2820856	2820865	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8046	NC_013159	AC	3	6	2820885	2820890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_013159	GTCG	2	8	2821323	2821330	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8048	NC_013159	CGG	2	6	2821357	2821362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_013159	GGT	2	6	2821376	2821381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_013159	CGA	2	6	2821411	2821416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_013159	AC	3	6	2821425	2821430	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8052	NC_013159	GA	3	6	2821448	2821453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_013159	AC	3	6	2821507	2821512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_013159	CCG	2	6	2821516	2821521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_013159	CCA	2	6	2821535	2821540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_013159	CACC	2	8	2821563	2821570	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8057	NC_013159	CCG	2	6	2821591	2821596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_013159	ATGA	2	8	2821664	2821671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_013159	AC	3	6	2821762	2821767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8060	NC_013159	GAC	2	6	2821782	2821787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_013159	GA	3	6	2822807	2822812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_013159	GC	3	6	2822837	2822842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_013159	GAA	2	6	2822845	2822850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_013159	GAC	2	6	2822902	2822907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_013159	CCG	2	6	2822918	2822923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_013159	TCC	2	6	2822975	2822980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_013159	ACG	2	6	2822988	2822993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_013159	CAC	2	6	2823066	2823071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_013159	CACC	2	8	2823990	2823997	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8070	NC_013159	ACGCC	2	10	2824008	2824017	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8071	NC_013159	GAC	2	6	2824060	2824065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_013159	GAC	2	6	2824076	2824081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_013159	ACG	2	6	2824086	2824091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_013159	ACG	2	6	2824093	2824098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_013159	GTCT	2	8	2824127	2824134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8076	NC_013159	GGA	3	9	2824142	2824150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_013159	GAG	2	6	2826272	2826277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_013159	ACG	2	6	2829637	2829642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_013159	A	6	6	2830336	2830341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_013159	TCA	2	6	2830386	2830391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_013159	ATG	2	6	2830495	2830500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_013159	CGC	2	6	2830537	2830542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_013159	GAC	2	6	2830630	2830635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_013159	C	6	6	2830677	2830682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8085	NC_013159	CCG	2	6	2830699	2830704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8086	NC_013159	ATGG	2	8	2830707	2830714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_013159	AAC	2	6	2830723	2830728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_013159	CCGC	2	8	2830767	2830774	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8089	NC_013159	GCC	2	6	2830775	2830780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8090	NC_013159	ACCC	2	8	2830826	2830833	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8091	NC_013159	GCC	2	6	2830834	2830839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_013159	CAC	3	9	2830851	2830859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_013159	ACCG	2	8	2830860	2830867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8094	NC_013159	C	6	6	2830932	2830937	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8095	NC_013159	ACC	2	6	2830958	2830963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8096	NC_013159	CCG	2	6	2830974	2830979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_013159	GGTGG	2	10	2830994	2831003	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_013159	CGACA	2	10	2832484	2832493	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8099	NC_013159	CCTT	2	8	2832505	2832512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_013159	CGC	2	6	2832527	2832532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_013159	ACG	2	6	2837163	2837168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_013159	GGT	2	6	2837214	2837219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_013159	GTC	2	6	2837249	2837254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_013159	CGGT	2	8	2837264	2837271	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8105	NC_013159	CGA	2	6	2838253	2838258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_013159	CGG	2	6	2839678	2839683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_013159	ACG	2	6	2839724	2839729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_013159	CCG	2	6	2839749	2839754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_013159	TCC	2	6	2840175	2840180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8110	NC_013159	CT	3	6	2840217	2840222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8111	NC_013159	ACA	2	6	2840325	2840330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_013159	ACC	2	6	2840354	2840359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8113	NC_013159	GATC	2	8	2840417	2840424	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8114	NC_013159	AC	3	6	2840433	2840438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8115	NC_013159	AGC	2	6	2840443	2840448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_013159	ACGCG	2	10	2840552	2840561	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8117	NC_013159	ACC	3	9	2840574	2840582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8118	NC_013159	ATT	2	6	2840592	2840597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_013159	TG	3	6	2840612	2840617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_013159	CCG	2	6	2840757	2840762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_013159	GTG	2	6	2841274	2841279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_013159	TGC	2	6	2841285	2841290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_013159	CCA	2	6	2841291	2841296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_013159	GCC	2	6	2841323	2841328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8125	NC_013159	TCC	2	6	2842013	2842018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8126	NC_013159	CG	3	6	2842132	2842137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_013159	CTG	2	6	2842151	2842156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_013159	CGA	2	6	2842165	2842170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_013159	GAG	2	6	2842175	2842180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_013159	GCC	2	6	2842199	2842204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8131	NC_013159	CA	3	6	2842275	2842280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8132	NC_013159	CGC	2	6	2842287	2842292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8254	NC_013159	AC	4	8	2869785	2869792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8255	NC_013159	TGA	2	6	2869812	2869817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8261	NC_013159	GAC	2	6	2870180	2870185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8263	NC_013159	GCA	2	6	2871491	2871496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8374	NC_013159	ACGC	2	8	2911172	2911179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8375	NC_013159	CCGCG	2	10	2911181	2911190	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8376	NC_013159	GATGA	2	10	2911217	2911226	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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8379	NC_013159	CGGC	2	8	2911324	2911331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8380	NC_013159	CA	3	6	2911373	2911378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8385	NC_013159	GGTGG	2	10	2918521	2918530	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8386	NC_013159	CA	3	6	2918538	2918543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8387	NC_013159	ACC	2	6	2918562	2918567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8388	NC_013159	TC	3	6	2919839	2919844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8389	NC_013159	TCA	2	6	2921590	2921595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8391	NC_013159	CTC	2	6	2921664	2921669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8393	NC_013159	CCGG	2	8	2921808	2921815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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