MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 chromosome

Total Repeats: 7546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012926	TCA	2	6	1252864	1252869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_012926	TAA	2	6	1252905	1252910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_012926	T	6	6	1252994	1252999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_012926	TGT	2	6	1253002	1253007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_012926	TCA	2	6	1253044	1253049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_012926	TCA	2	6	1253052	1253057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_012926	CTTT	2	8	1253127	1253134	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4508	NC_012926	TG	3	6	1253135	1253140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_012926	A	6	6	1254045	1254050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_012926	CAA	2	6	1254058	1254063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_012926	GTT	2	6	1254077	1254082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_012926	CCA	2	6	1254316	1254321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NC_012926	CA	3	6	1254365	1254370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4514	NC_012926	C	6	6	1254587	1254592	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4515	NC_012926	ACT	2	6	1254593	1254598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_012926	ATTCT	2	10	1254613	1254622	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4517	NC_012926	CTC	2	6	1254942	1254947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_012926	TACT	2	8	1254955	1254962	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_012926	AAT	2	6	1255043	1255048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_012926	A	6	6	1255080	1255085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_012926	ATT	2	6	1255101	1255106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_012926	TCTTT	2	10	1255139	1255148	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4523	NC_012926	TGG	2	6	1255159	1255164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_012926	AGCT	2	8	1255305	1255312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4525	NC_012926	TCTT	2	8	1255345	1255352	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4526	NC_012926	AT	3	6	1255378	1255383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_012926	CGG	2	6	1255480	1255485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_012926	CAA	2	6	1255569	1255574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012926	TG	3	6	1256778	1256783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_012926	AAAC	2	8	1256797	1256804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4531	NC_012926	AAT	2	6	1256843	1256848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_012926	TAT	2	6	1256951	1256956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_012926	A	6	6	1256985	1256990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_012926	T	6	6	1256991	1256996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_012926	AAT	2	6	1256998	1257003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_012926	T	7	7	1257008	1257014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_012926	AATA	2	8	1257028	1257035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_012926	A	7	7	1257046	1257052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_012926	C	6	6	1260059	1260064	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4540	NC_012926	GCT	2	6	1260068	1260073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_012926	T	6	6	1260143	1260148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_012926	TTC	2	6	1260156	1260161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_012926	AGT	2	6	1260218	1260223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_012926	CTT	2	6	1260275	1260280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_012926	TAA	2	6	1260284	1260289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_012926	TCA	2	6	1260313	1260318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_012926	CCTT	2	8	1260346	1260353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_012926	TCAA	2	8	1260379	1260386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4549	NC_012926	TTC	2	6	1260403	1260408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_012926	CTGC	2	8	1260569	1260576	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4551	NC_012926	CTTC	2	8	1260581	1260588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_012926	ATA	2	6	1260598	1260603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_012926	CT	3	6	1260634	1260639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_012926	T	6	6	1260639	1260644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_012926	TTG	2	6	1260646	1260651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_012926	AGG	2	6	1260741	1260746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_012926	TCT	2	6	1260767	1260772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_012926	TTG	2	6	1260784	1260789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_012926	GAATG	2	10	1260818	1260827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_012926	GGA	2	6	1260867	1260872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_012926	CGGT	2	8	1260907	1260914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4562	NC_012926	TCA	2	6	1260935	1260940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_012926	TCA	2	6	1260960	1260965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_012926	AG	3	6	1260966	1260971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_012926	CAG	2	6	1260981	1260986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_012926	TTGG	2	8	1261011	1261018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4568	NC_012926	GAT	2	6	1261042	1261047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_012926	GT	3	6	1261065	1261070	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_012926	CCA	2	6	1261088	1261093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_012926	A	6	6	1261158	1261163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_012926	CTG	2	6	1261165	1261170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_012926	ATA	2	6	1261199	1261204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_012926	CCGT	2	8	1261289	1261296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_012926	TTG	2	6	1261316	1261321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4577	NC_012926	TCT	2	6	1261463	1261468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4579	NC_012926	TCC	2	6	1261594	1261599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_012926	TCA	2	6	1261631	1261636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4582	NC_012926	ATCA	2	8	1264767	1264774	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4587	NC_012926	TAT	2	6	1266225	1266230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_012926	A	6	6	1266248	1266253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_012926	A	6	6	1266281	1266286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_012926	AAT	2	6	1266293	1266298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4593	NC_012926	T	6	6	1267202	1267207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_012926	ATTC	2	8	1267210	1267217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_012926	T	6	6	1268912	1268917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_012926	TAC	2	6	1268933	1268938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_012926	T	7	7	1268955	1268961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012926	TATT	2	8	1268964	1268971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_012926	CTTA	2	8	1269010	1269017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4600	NC_012926	TCA	2	6	1269048	1269053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_012926	TAGT	2	8	1269084	1269091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_012926	T	6	6	1269091	1269096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_012926	AG	3	6	1269101	1269106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_012926	TA	3	6	1269172	1269177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_012926	T	6	6	1269193	1269198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_012926	AGC	2	6	1269204	1269209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_012926	GATT	2	8	1269229	1269236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_012926	TTTTC	2	10	1271114	1271123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4609	NC_012926	ACC	2	6	1272920	1272925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4610	NC_012926	GGT	2	6	1272935	1272940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_012926	CCAG	2	8	1272968	1272975	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_012926	TAC	2	6	1273054	1273059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_012926	GAA	2	6	1273154	1273159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_012926	ATC	2	6	1273160	1273165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4615	NC_012926	TA	3	6	1273190	1273195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_012926	ATA	2	6	1273235	1273240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_012926	CAT	2	6	1273301	1273306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_012926	GGA	2	6	1273359	1273364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_012926	ACT	2	6	1273460	1273465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_012926	GAT	2	6	1273481	1273486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_012926	T	6	6	1273628	1273633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_012926	ACA	2	6	1273674	1273679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_012926	CAA	2	6	1273696	1273701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_012926	CCA	2	6	1273705	1273710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_012926	A	6	6	1273730	1273735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_012926	ACC	2	6	1276897	1276902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_012926	CTT	3	9	1276922	1276930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_012926	CTTG	2	8	1277300	1277307	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_012926	TTC	2	6	1277325	1277330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_012926	AGCC	2	8	1277390	1277397	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_012926	TCT	2	6	1277467	1277472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4633	NC_012926	CAG	2	6	1277495	1277500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4752	NC_012926	TAGT	2	8	1310419	1310426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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