MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis BM407 plasmid pBM407

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012923	TTG	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012923	AAG	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012923	AGAA	2	8	977	984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012923	A	6	6	2364	2369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012923	AGT	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012923	A	6	6	2387	2392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012923	ACT	2	6	2398	2403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012923	T	7	7	2405	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012923	T	7	7	2494	2500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012923	AATT	2	8	2520	2527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012923	TTA	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012923	TAA	2	6	2554	2559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012923	TAAA	2	8	2627	2634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012923	TCC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012923	TAT	2	6	3369	3374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012923	TAG	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012923	TTG	2	6	3564	3569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012923	ATG	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012923	CAGTTT	2	12	3618	3629	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012923	TA	3	6	3632	3637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012923	TCC	2	6	3719	3724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012923	TGAG	2	8	3787	3794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012923	CTTT	2	8	3858	3865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012923	AC	3	6	3992	3997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012923	CTGCT	2	10	4019	4028	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_012923	A	7	7	4030	4036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012923	TCT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012923	CCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_012923	A	6	6	4456	4461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012923	TCA	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012923	TA	3	6	4511	4516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012923	TAA	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012923	ATA	2	6	4564	4569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012923	AAAG	2	8	4575	4582	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012923	TAT	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012923	AAC	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012923	ATC	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012923	CTC	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012923	TCA	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012923	A	6	6	4785	4790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012923	A	6	6	4797	4802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012923	CTAC	2	8	4845	4852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012923	CA	3	6	4865	4870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012923	AAT	2	6	4900	4905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012923	AGA	2	6	4911	4916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012923	ACA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012923	CT	4	8	5664	5671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012923	TAATG	2	10	5693	5702	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012923	TCG	2	6	7257	7262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012923	ACT	2	6	7286	7291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012923	T	7	7	7295	7301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012923	TCATT	2	10	7328	7337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_012923	AGT	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012923	T	6	6	7461	7466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012923	CGATTT	2	12	7501	7512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012923	T	6	6	7510	7515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012923	TGATA	2	10	7530	7539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012923	ATT	2	6	7581	7586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012923	ATC	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012923	CT	3	6	7669	7674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012923	TTA	2	6	7684	7689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012923	T	6	6	7767	7772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012923	CT	4	8	7788	7795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012923	ATA	2	6	7867	7872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012923	A	6	6	7872	7877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012923	T	7	7	7893	7899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012923	ATT	2	6	7900	7905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012923	CCAA	2	8	7932	7939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012923	CCA	2	6	7947	7952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012923	ACC	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012923	TTC	2	6	8015	8020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012923	CTT	2	6	8029	8034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012923	T	6	6	8039	8044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012923	T	8	8	8056	8063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012923	CTT	2	6	8068	8073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012923	ATT	2	6	8074	8079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012923	GAT	2	6	8131	8136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012923	CTG	2	6	8150	8155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012923	GCT	2	6	8274	8279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012923	CATT	2	8	8347	8354	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_012923	AT	3	6	8379	8384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012923	TAT	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012923	T	6	6	8423	8428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012923	AAC	2	6	8481	8486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012923	AT	3	6	8491	8496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012923	TG	3	6	8515	8520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012923	TTGTT	2	10	8521	8530	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012923	AT	3	6	8550	8555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012923	T	6	6	8563	8568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012923	T	6	6	8610	8615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012923	A	7	7	8626	8632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012923	T	6	6	8646	8651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012923	CAC	2	6	8676	8681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012923	ATC	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012923	AAAAG	2	10	8781	8790	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012923	TTTC	2	8	8905	8912	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012923	AAT	2	6	8944	8949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012923	A	6	6	8950	8955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012923	GCA	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012923	TA	3	6	8968	8973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012923	TGC	2	6	8990	8995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012923	CTTC	2	8	9012	9019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012923	GCT	2	6	9049	9054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012923	TTC	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012923	TCC	2	6	9098	9103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012923	GCA	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012923	AAT	2	6	9120	9125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012923	TCA	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012923	CA	3	6	9190	9195	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012923	ATCCT	2	10	9215	9224	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012923	AAT	2	6	9255	9260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012923	ATA	2	6	9270	9275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012923	TAA	2	6	9353	9358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012923	GCA	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012923	CCT	2	6	9458	9463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012923	CAG	2	6	9486	9491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012923	ACA	3	9	9521	9529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012923	TCA	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012923	TTC	3	9	9559	9567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012923	CATT	2	8	9588	9595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012923	TAT	2	6	9640	9645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012923	T	6	6	9664	9669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012923	AAC	2	6	9722	9727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012923	AT	3	6	9732	9737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012923	TG	3	6	9756	9761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012923	TTGTT	2	10	9762	9771	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012923	AT	3	6	9791	9796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012923	T	6	6	9850	9855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012923	A	7	7	9866	9872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012923	CTT	2	6	9887	9892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012923	ATCA	2	8	9915	9922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_012923	ATA	2	6	10275	10280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012923	AGGT	2	8	10315	10322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012923	TGT	2	6	10337	10342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012923	ATA	2	6	10364	10369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012923	ATT	2	6	10375	10380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012923	AT	3	6	10395	10400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012923	ACC	2	6	10454	10459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012923	CAT	2	6	10469	10474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012923	CAT	2	6	10660	10665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012923	TCT	2	6	10728	10733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_012923	T	6	6	10741	10746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012923	A	6	6	10761	10766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012923	TCC	2	6	10821	10826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_012923	T	6	6	10866	10871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012923	T	6	6	10877	10882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012923	TCC	2	6	10983	10988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_012923	A	6	6	11095	11100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012923	CTT	2	6	11141	11146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_012923	ATAA	2	8	11231	11238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012923	A	6	6	11245	11250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012923	CATAC	2	10	11328	11337	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
153	NC_012923	TTC	2	6	11465	11470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_012923	ATT	2	6	11489	11494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012923	CCT	2	6	11504	11509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_012923	CCA	2	6	11536	11541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_012923	CCA	2	6	11560	11565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_012923	CCA	2	6	11593	11598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_012923	CAT	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_012923	AT	3	6	11668	11673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_012923	TG	3	6	11693	11698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_012923	TTGTT	2	10	11699	11708	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012923	AT	3	6	11728	11733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012923	T	6	6	11741	11746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_012923	T	6	6	11788	11793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012923	A	8	8	11804	11811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012923	CTT	2	6	11826	11831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_012923	ATCA	2	8	11854	11861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
169	NC_012923	ATT	2	6	12766	12771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_012923	TCTAT	2	10	12791	12800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_012923	ATT	2	6	12822	12827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012923	TA	4	8	12847	12854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012923	T	7	7	12874	12880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012923	T	8	8	12882	12889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012923	TA	4	8	12914	12921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012923	T	6	6	12941	12946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012923	TAAA	2	8	13986	13993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_012923	TCC	2	6	14709	14714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_012923	TAT	2	6	14728	14733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_012923	TAG	2	6	14748	14753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_012923	ATTT	2	8	14782	14789	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_012923	TAA	2	6	14868	14873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012923	A	7	7	21862	21868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_012923	A	7	7	21896	21902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012923	CA	3	6	21921	21926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
186	NC_012923	AGT	2	6	21941	21946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012923	T	6	6	22012	22017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012923	ACG	3	9	22109	22117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_012923	GTT	2	6	22263	22268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_012923	TTA	2	6	22272	22277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_012923	CTT	2	6	22309	22314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_012923	CTT	2	6	22399	22404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_012923	GATT	2	8	22511	22518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
194	NC_012923	CTT	2	6	22537	22542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_012923	GCG	2	6	22543	22548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_012923	TCA	2	6	22566	22571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_012923	GTTA	2	8	22577	22584	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
198	NC_012923	TGT	2	6	22723	22728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_012923	TCT	2	6	22800	22805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
200	NC_012923	AAC	3	9	22817	22825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
201	NC_012923	GATT	2	8	22919	22926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
202	NC_012923	CTT	2	6	22945	22950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
203	NC_012923	TCA	2	6	22974	22979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
204	NC_012923	GTTA	2	8	22985	22992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
205	NC_012923	T	6	6	22997	23002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_012923	TGG	2	6	23051	23056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
207	NC_012923	TGA	2	6	23389	23394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
208	NC_012923	GTA	2	6	23418	23423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_012923	TAT	2	6	24299	24304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_012923	TAG	2	6	24319	24324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
212	NC_012923	AT	3	6	24447	24452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_012923	TA	3	6	24505	24510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.