MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.4 chromosome

Total Repeats: 8135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012726	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012726	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012726	TC	3	6	62	67	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012726	TTTC	2	8	135	142	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012726	GT	3	6	180	185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012726	ATT	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012726	GTCAC	2	10	358	367	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012726	ATT	2	6	384	389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012726	TAA	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012726	T	7	7	447	453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012726	TAAA	2	8	2369	2376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012726	TA	5	10	2385	2394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012726	T	6	6	3251	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012726	T	6	6	3275	3280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012726	TAT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012726	TACAAA	2	12	5743	5754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012726	TAT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012726	AAG	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012726	TTAAA	2	10	5884	5893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012726	ACA	2	6	5897	5902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012726	ATT	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012726	GAA	2	6	6095	6100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012726	ATGTT	2	10	6113	6122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012726	GA	3	6	6165	6170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012726	ATC	2	6	6189	6194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012726	GTTC	2	8	6203	6210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012726	TCA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012726	T	6	6	7695	7700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012726	TA	3	6	7715	7720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012726	TA	3	6	9057	9062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012726	GTA	2	6	9070	9075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012726	CATC	2	8	9904	9911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012726	ATT	2	6	16340	16345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012726	TGGTAT	2	12	17808	17819	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012726	TAA	2	6	17845	17850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012726	TAT	2	6	17907	17912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012726	CAT	2	6	17933	17938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012726	GGTT	2	8	17953	17960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012726	CATA	2	8	17965	17972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012726	ATT	2	6	17979	17984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012726	TAT	2	6	17994	17999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012726	GAT	2	6	24563	24568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012726	TGA	2	6	24592	24597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012726	GAT	2	6	24616	24621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012726	TAGA	2	8	24636	24643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012726	ATA	2	6	24664	24669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012726	CA	3	6	26327	26332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012726	AT	3	6	26333	26338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012726	TAA	2	6	27070	27075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012726	TAG	2	6	27089	27094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012726	AAAAT	2	10	27152	27161	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012726	ATAA	2	8	28222	28229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012726	TA	3	6	28237	28242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012726	TTA	2	6	31433	31438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012726	AGA	2	6	31465	31470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012726	AT	3	6	32700	32705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012726	CTTTTC	2	12	32725	32736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012726	ATC	2	6	32780	32785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012726	ACA	2	6	32790	32795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012726	TAA	2	6	34216	34221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012726	TAC	2	6	34252	34257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012726	GGT	2	6	34267	34272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012726	T	6	6	35284	35289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012726	ACT	2	6	36979	36984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012726	TATTTA	2	12	38254	38265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012726	A	6	6	38292	38297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012726	AT	4	8	38495	38502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012726	ATTT	2	8	38509	38516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012726	AAAT	2	8	38520	38527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012726	AT	3	6	38529	38534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012726	AAAT	2	8	38585	38592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012726	AT	3	6	38591	38596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012726	GAT	2	6	38617	38622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012726	CTG	2	6	38658	38663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012726	ATT	2	6	38689	38694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012726	TTC	2	6	38715	38720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012726	GGT	2	6	38730	38735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012726	TAA	2	6	38781	38786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012726	TAA	2	6	38875	38880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012726	ATT	2	6	38988	38993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012726	AATA	2	8	38995	39002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012726	TGGTG	2	10	39035	39044	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012726	AT	3	6	40792	40797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012726	TA	4	8	42466	42473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012726	GTT	2	6	44736	44741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012726	TTA	2	6	44755	44760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012726	ATC	2	6	44775	44780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012726	TAGC	2	8	45777	45784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012726	TAA	2	6	45874	45879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012726	GTT	2	6	45887	45892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012726	TGA	2	6	45944	45949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012726	T	7	7	45957	45963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012726	TCT	2	6	45977	45982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012726	TC	3	6	48112	48117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012726	TCTAGT	2	12	48124	48135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012726	TCAA	2	8	48196	48203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_012726	TTA	2	6	48221	48226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012726	AGA	2	6	48233	48238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012726	TAT	2	6	48257	48262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012726	TAT	2	6	49685	49690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012726	ATA	2	6	49691	49696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012726	T	7	7	50852	50858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012726	TTC	2	6	50873	50878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_012726	T	6	6	50898	50903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012726	TTG	2	6	50915	50920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012726	AAGT	2	8	50990	50997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012726	CAA	2	6	51030	51035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012726	TTAT	2	8	51066	51073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012726	ATCT	2	8	51081	51088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012726	AGA	2	6	58215	58220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012726	AACA	2	8	58813	58820	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012726	CA	3	6	58893	58898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012726	TAA	2	6	58899	58904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012726	AAG	2	6	58936	58941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012726	TCC	2	6	58966	58971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012726	TGA	2	6	58987	58992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012726	ATG	2	6	59012	59017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012726	T	7	7	59051	59057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012726	TAATT	2	10	61019	61028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012726	CTT	2	6	61071	61076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012726	GTTT	2	8	65372	65379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012726	TAT	2	6	65390	65395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012726	A	6	6	65445	65450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012726	ATT	2	6	65474	65479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012726	TTG	2	6	68098	68103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012726	TAA	2	6	68144	68149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012726	TCAT	2	8	68164	68171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012726	ACT	2	6	68859	68864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012726	TCTA	2	8	68892	68899	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_012726	A	7	7	68899	68905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012726	TTC	2	6	68932	68937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012726	TAA	2	6	68976	68981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012726	TAA	2	6	69024	69029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012726	TAT	2	6	69030	69035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012726	AT	4	8	69051	69058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012726	TTC	2	6	69620	69625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012726	CAT	3	9	69646	69654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012726	TA	3	6	70177	70182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012726	TA	3	6	70220	70225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012726	CT	3	6	71539	71544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_012726	TAT	2	6	71595	71600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012726	AAC	2	6	72031	72036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012726	AATAAA	2	12	72041	72052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012726	GTTTT	2	10	72057	72066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012726	GAT	2	6	72951	72956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012726	AAT	2	6	72978	72983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012726	ATA	2	6	74410	74415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012726	T	6	6	74421	74426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012726	AAG	2	6	74449	74454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012726	A	6	6	76257	76262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012726	AT	3	6	80752	80757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012726	ATA	2	6	80771	80776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012726	CTT	2	6	82144	82149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_012726	ATA	2	6	82179	82184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012726	ATATG	2	10	82187	82196	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_012726	ATA	2	6	101324	101329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_012726	TA	3	6	101542	101547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_012726	ATA	2	6	101577	101582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_012726	TCT	2	6	132018	132023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_012726	TACG	2	8	132104	132111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
291	NC_012726	CTA	2	6	132153	132158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_012726	CTAAGC	2	12	132170	132181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_012726	CA	3	6	132258	132263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
294	NC_012726	CA	3	6	132349	132354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
295	NC_012726	AGGA	2	8	132411	132418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NC_012726	AAT	2	6	132490	132495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_012726	GAT	2	6	132516	132521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_012726	TAAA	2	8	132548	132555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_012726	ATT	2	6	132631	132636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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326	NC_012726	GAA	3	9	153923	153931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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365	NC_012726	T	6	6	184891	184896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_012726	GTT	2	6	202861	202866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_012726	TAT	2	6	207289	207294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_012726	TAT	3	9	218217	218225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_012726	T	6	6	219642	219647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_012726	TCT	2	6	221085	221090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_012726	TGA	2	6	221101	221106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_012726	TA	3	6	227638	227643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_012726	CTA	2	6	227651	227656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
416	NC_012726	A	6	6	230011	230016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_012726	T	6	6	233725	233730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
418	NC_012726	A	6	6	233731	233736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_012726	ATGC	2	8	233757	233764	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
420	NC_012726	T	6	6	233774	233779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_012726	AAT	2	6	233837	233842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_012726	GTAAGC	2	12	236418	236429	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
423	NC_012726	TTC	2	6	236450	236455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_012726	TC	3	6	236473	236478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
425	NC_012726	AAT	2	6	236766	236771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_012726	A	6	6	236785	236790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_012726	AAG	2	6	238549	238554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_012726	ATT	2	6	238560	238565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_012726	AATA	2	8	238566	238573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_012726	TTA	2	6	239950	239955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_012726	TAT	2	6	241863	241868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_012726	TA	3	6	242651	242656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_012726	ATT	2	6	247142	247147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_012726	TA	3	6	248107	248112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_012726	A	6	6	248120	248125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_012726	TTA	2	6	255275	255280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_012726	ATT	2	6	255531	255536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_012726	ATT	2	6	255642	255647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_012726	ATT	2	6	255701	255706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_012726	ATT	2	6	260622	260627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_012726	AAT	2	6	265565	265570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_012726	TA	4	8	266720	266727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_012726	AT	3	6	266769	266774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_012726	TA	3	6	266786	266791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_012726	GTA	2	6	266827	266832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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