MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012632	AGA	2	6	665394	665399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_012632	AAG	2	6	665726	665731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_012632	GAAG	2	8	665757	665764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_012632	AT	3	6	665805	665810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_012632	ATAA	2	8	665837	665844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_012632	GTAA	2	8	665864	665871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_012632	TCT	2	6	665960	665965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_012632	ACT	2	6	666025	666030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_012632	ATT	2	6	666071	666076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_012632	TAAAT	2	10	666712	666721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_012632	ATTT	2	8	666722	666729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_012632	GCGTT	2	10	666763	666772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3013	NC_012632	TTA	2	6	666799	666804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_012632	TAT	3	9	666809	666817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_012632	GAG	2	6	666891	666896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_012632	TGA	2	6	666897	666902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_012632	ATTA	2	8	666912	666919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_012632	TAG	2	6	666969	666974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_012632	TTGAA	2	10	667025	667034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_012632	AGAA	2	8	667099	667106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_012632	GTA	2	6	669755	669760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_012632	TAAC	2	8	669800	669807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_012632	ATT	2	6	669832	669837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_012632	TAA	2	6	669917	669922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012632	ATT	2	6	669965	669970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012632	TATCT	2	10	669975	669984	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3027	NC_012632	TTA	2	6	671397	671402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012632	TAA	2	6	671423	671428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012632	GTT	2	6	671439	671444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_012632	TAT	2	6	671480	671485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_012632	ATT	2	6	671507	671512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_012632	T	6	6	671587	671592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_012632	ATT	2	6	673451	673456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_012632	ACGT	2	8	673498	673505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_012632	GA	3	6	673584	673589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_012632	T	6	6	673611	673616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_012632	ATT	2	6	673623	673628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_012632	A	6	6	673636	673641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_012632	ATAA	2	8	673650	673657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_012632	TA	4	8	673660	673667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_012632	GATTA	2	10	673772	673781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_012632	CT	4	8	673789	673796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_012632	TA	3	6	673813	673818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_012632	T	6	6	679401	679406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_012632	AAT	2	6	679441	679446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_012632	GAT	2	6	679544	679549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3048	NC_012632	TTA	2	6	679621	679626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_012632	T	6	6	679673	679678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012632	TTA	2	6	679703	679708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_012632	TAA	2	6	679722	679727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_012632	AATG	2	8	682282	682289	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012632	TAC	2	6	683410	683415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_012632	GTAA	2	8	683420	683427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_012632	ATT	2	6	685215	685220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_012632	CCAT	2	8	685248	685255	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3057	NC_012632	GAT	2	6	685260	685265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_012632	TAA	2	6	685513	685518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_012632	AT	3	6	685537	685542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_012632	CCT	2	6	685560	685565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_012632	AAG	2	6	685616	685621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_012632	ATT	2	6	685656	685661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_012632	A	6	6	685672	685677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_012632	ATCAC	2	10	688274	688283	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3065	NC_012632	TAG	2	6	688314	688319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_012632	TTA	2	6	688341	688346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_012632	ATT	2	6	688403	688408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_012632	ACA	2	6	688433	688438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_012632	CTA	2	6	688499	688504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_012632	AAT	2	6	688526	688531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_012632	AGA	2	6	688584	688589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_012632	CTAA	2	8	688646	688653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_012632	TA	3	6	688743	688748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_012632	TTG	2	6	688802	688807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_012632	CTA	2	6	688859	688864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3077	NC_012632	TA	3	6	689693	689698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_012632	A	6	6	689724	689729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_012632	TA	3	6	689736	689741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_012632	GA	3	6	689742	689747	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3082	NC_012632	AAT	2	6	691031	691036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_012632	TAA	2	6	691114	691119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_012632	A	6	6	691172	691177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_012632	TAT	2	6	691202	691207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_012632	AGA	2	6	691286	691291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_012632	TA	4	8	691294	691301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_012632	AT	3	6	691313	691318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_012632	AAGA	2	8	691341	691348	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_012632	TTAC	2	8	691387	691394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_012632	TCT	3	9	691531	691539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_012632	T	6	6	691548	691553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_012632	TTAT	2	8	691949	691956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_012632	TTGTT	2	10	691961	691970	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_012632	TAA	2	6	691992	691997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_012632	AAAAT	2	10	692003	692012	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012632	TTC	2	6	692030	692035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_012632	A	6	6	692096	692101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_012632	TGA	2	6	692104	692109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_012632	AT	3	6	693868	693873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_012632	AAT	2	6	693894	693899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_012632	ATGT	2	8	694272	694279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_012632	AAT	2	6	694291	694296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_012632	GAGG	2	8	694342	694349	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_012632	CTC	2	6	694362	694367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_012632	AT	3	6	694452	694457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_012632	TCC	2	6	694474	694479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3112	NC_012632	TCC	2	6	694510	694515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_012632	TCA	2	6	694595	694600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_012632	TAT	2	6	694614	694619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_012632	TCTA	2	8	694620	694627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3116	NC_012632	GAT	2	6	695456	695461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_012632	TCC	2	6	695530	695535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_012632	TA	3	6	695562	695567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_012632	TAA	2	6	695586	695591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012632	AGT	2	6	695644	695649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3122	NC_012632	CTA	2	6	695768	695773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_012632	AGA	2	6	695824	695829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_012632	AGG	2	6	695835	695840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_012632	A	6	6	695859	695864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_012632	TAA	2	6	695928	695933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_012632	TTTA	2	8	695975	695982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012632	TACT	2	8	697164	697171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3129	NC_012632	CTT	2	6	697450	697455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3130	NC_012632	AT	3	6	697456	697461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_012632	T	7	7	697467	697473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_012632	AT	3	6	697524	697529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_012632	AAC	2	6	697680	697685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_012632	ATT	2	6	699983	699988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_012632	ATC	2	6	699989	699994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_012632	AT	3	6	699998	700003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_012632	TATAA	2	10	700953	700962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3403	NC_012632	TAA	2	6	735845	735850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3415	NC_012632	ATCT	2	8	736754	736761	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3416	NC_012632	CT	3	6	736760	736765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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