MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012632	AT	4	8	2636669	2636676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_012632	ACTT	2	8	2636677	2636684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10003	NC_012632	A	6	6	2639221	2639226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_012632	AGC	2	6	2639245	2639250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_012632	TAAACA	2	12	2639251	2639262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10006	NC_012632	AAGA	2	8	2639270	2639277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_012632	TCT	2	6	2639332	2639337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_012632	ATT	2	6	2639366	2639371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_012632	CA	3	6	2639765	2639770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_012632	TTA	2	6	2639819	2639824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_012632	A	6	6	2639834	2639839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_012632	TAA	2	6	2640656	2640661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_012632	TTTAT	2	10	2640671	2640680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_012632	TAAT	2	8	2648759	2648766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_012632	ATC	2	6	2648805	2648810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_012632	A	6	6	2648826	2648831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_012632	AAAAAT	2	12	2648851	2648862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_012632	TTC	2	6	2649095	2649100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_012632	ATAA	2	8	2649123	2649130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_012632	TTA	2	6	2649187	2649192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_012632	ATA	2	6	2649202	2649207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_012632	ATA	2	6	2649250	2649255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_012632	A	7	7	2649346	2649352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_012632	ATA	2	6	2654785	2654790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_012632	CTC	2	6	2654929	2654934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_012632	TAAC	2	8	2655385	2655392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10027	NC_012632	TA	3	6	2655398	2655403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_012632	TTC	2	6	2655409	2655414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_012632	CATA	2	8	2655419	2655426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_012632	TCT	2	6	2655440	2655445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_012632	TCA	2	6	2655501	2655506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_012632	CCT	2	6	2655518	2655523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_012632	TCC	2	6	2655551	2655556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_012632	ACC	2	6	2655602	2655607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_012632	CCTCTT	2	12	2655637	2655648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_012632	TA	3	6	2655789	2655794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012632	AAC	2	6	2655803	2655808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_012632	TAA	2	6	2655816	2655821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_012632	TAAG	2	8	2655847	2655854	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_012632	GGAG	2	8	2655860	2655867	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_012632	TCCC	2	8	2655906	2655913	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10042	NC_012632	TGA	2	6	2655930	2655935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_012632	CCT	2	6	2655937	2655942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_012632	ACTAC	2	10	2655962	2655971	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10045	NC_012632	CAC	2	6	2656222	2656227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_012632	CTTG	2	8	2656245	2656252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10047	NC_012632	GTC	2	6	2656293	2656298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_012632	ACT	2	6	2656306	2656311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_012632	TC	3	6	2656347	2656352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_012632	GATG	2	8	2656412	2656419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_012632	TCC	2	6	2656439	2656444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_012632	TCAA	2	8	2656582	2656589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10053	NC_012632	GTA	2	6	2656617	2656622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_012632	AAC	2	6	2656654	2656659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_012632	TA	3	6	2656782	2656787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_012632	CTT	2	6	2657698	2657703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10057	NC_012632	TAC	2	6	2657741	2657746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_012632	AGTG	2	8	2657780	2657787	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_012632	GTC	2	6	2657798	2657803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_012632	TATTTA	2	12	2657811	2657822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_012632	TA	3	6	2657821	2657826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_012632	TCA	2	6	2657893	2657898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_012632	CTT	2	6	2657962	2657967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_012632	GAGG	2	8	2658004	2658011	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_012632	GTATGA	2	12	2658036	2658047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_012632	GTT	2	6	2658168	2658173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_012632	ACTT	2	8	2658198	2658205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10068	NC_012632	GAT	2	6	2658360	2658365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_012632	AG	3	6	2658466	2658471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_012632	ATG	2	6	2658504	2658509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_012632	ATG	2	6	2658566	2658571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_012632	CAA	2	6	2658606	2658611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_012632	TAC	2	6	2659340	2659345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_012632	TAT	2	6	2659365	2659370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_012632	ATA	2	6	2659389	2659394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_012632	TTG	2	6	2659433	2659438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_012632	GAA	2	6	2659457	2659462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_012632	TA	3	6	2659468	2659473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_012632	GTTA	2	8	2659479	2659486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_012632	A	6	6	2659943	2659948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_012632	ATT	3	9	2660011	2660019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_012632	ATTT	3	12	2660411	2660422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_012632	T	6	6	2662642	2662647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_012632	ATAG	2	8	2662680	2662687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_012632	TA	3	6	2663563	2663568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_012632	T	6	6	2663571	2663576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_012632	TA	4	8	2663588	2663595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_012632	TA	3	6	2663622	2663627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_012632	TTC	2	6	2663646	2663651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_012632	GAA	2	6	2663658	2663663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_012632	AT	3	6	2663727	2663732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_012632	TCC	2	6	2663749	2663754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10093	NC_012632	TTA	2	6	2663807	2663812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_012632	T	6	6	2666185	2666190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_012632	TA	3	6	2666220	2666225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_012632	AAG	2	6	2666592	2666597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_012632	ATA	2	6	2668150	2668155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_012632	CAG	2	6	2668188	2668193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_012632	TAC	2	6	2668321	2668326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_012632	CA	3	6	2668462	2668467	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_012632	CTT	2	6	2668537	2668542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_012632	AT	4	8	2668560	2668567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_012632	CT	3	6	2670399	2670404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10104	NC_012632	GAT	2	6	2670426	2670431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_012632	TA	3	6	2670432	2670437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_012632	A	6	6	2670458	2670463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_012632	TAC	2	6	2673476	2673481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_012632	TA	3	6	2673492	2673497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_012632	TAC	2	6	2673947	2673952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_012632	A	6	6	2673973	2673978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_012632	TTCA	2	8	2674004	2674011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10112	NC_012632	TTA	2	6	2674082	2674087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_012632	ATA	2	6	2674825	2674830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_012632	AAG	2	6	2674859	2674864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_012632	GAC	2	6	2674865	2674870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_012632	CTAT	2	8	2674904	2674911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_012632	AT	3	6	2674959	2674964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_012632	ATT	2	6	2674978	2674983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_012632	TAT	2	6	2675061	2675066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_012632	AG	3	6	2675174	2675179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_012632	AGG	2	6	2675195	2675200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_012632	ACT	2	6	2675211	2675216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_012632	TTA	3	9	2675234	2675242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_012632	TAT	2	6	2675259	2675264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_012632	AT	3	6	2675276	2675281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_012632	A	6	6	2675383	2675388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_012632	AT	3	6	2675397	2675402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_012632	TAA	2	6	2675691	2675696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_012632	TTA	2	6	2679086	2679091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_012632	TAA	2	6	2679122	2679127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_012632	CCA	3	9	2679139	2679147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_012632	TAA	2	6	2679195	2679200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_012632	CAT	2	6	2679226	2679231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_012632	AG	3	6	2679234	2679239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_012632	AT	4	8	2679314	2679321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_012632	ATAA	2	8	2679393	2679400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_012632	CTT	2	6	2679961	2679966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10138	NC_012632	TTA	2	6	2682010	2682015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_012632	TAA	2	6	2682049	2682054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_012632	TAA	2	6	2683955	2683960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_012632	CT	3	6	2683961	2683966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10142	NC_012632	ACTT	2	8	2684720	2684727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10143	NC_012632	AACT	2	8	2684781	2684788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10144	NC_012632	TCA	2	6	2684908	2684913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10145	NC_012632	ATA	2	6	2684915	2684920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_012632	ACA	2	6	2685024	2685029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_012632	CTT	2	6	2685119	2685124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10148	NC_012632	TTA	2	6	2685231	2685236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10149	NC_012632	TACT	2	8	2685240	2685247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10150	NC_012632	ATT	2	6	2685315	2685320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_012632	CATT	2	8	2685338	2685345	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10152	NC_012632	TTA	2	6	2685346	2685351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_012632	TA	3	6	2685350	2685355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_012632	TA	3	6	2687335	2687340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_012632	ATA	2	6	2687357	2687362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_012632	AAGT	2	8	2690940	2690947	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10157	NC_012632	TA	3	6	2690961	2690966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10158	NC_012632	T	6	6	2690968	2690973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10159	NC_012632	TTAA	2	8	2691067	2691074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10161	NC_012632	A	6	6	2691106	2691111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10162	NC_012632	TA	3	6	2691134	2691139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10163	NC_012632	T	8	8	2692395	2692402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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