MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus M.16.27 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012632	TGA	2	6	1221609	1221614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_012632	CAC	2	6	1221624	1221629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_012632	TAA	2	6	1229305	1229310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_012632	AGG	2	6	1230587	1230592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_012632	GTA	2	6	1230814	1230819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_012632	AT	3	6	1230826	1230831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_012632	A	6	6	1230857	1230862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_012632	ATA	2	6	1230899	1230904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_012632	CGGG	2	8	1231302	1231309	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6510	NC_012632	CGA	2	6	1231401	1231406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_012632	G	6	6	1231454	1231459	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_012632	CGG	2	6	1231547	1231552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_012632	GCC	2	6	1231609	1231614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_012632	CTC	2	6	1231665	1231670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_012632	GTG	2	6	1231683	1231688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_012632	GAG	2	6	1231761	1231766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_012632	TCT	2	6	1231798	1231803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_012632	GC	3	6	1231895	1231900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6519	NC_012632	ACCA	2	8	1231994	1232001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6520	NC_012632	TTA	2	6	1232061	1232066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_012632	GAC	2	6	1232515	1232520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_012632	CGG	2	6	1232546	1232551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_012632	CTC	2	6	1232567	1232572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_012632	GCC	2	6	1232582	1232587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_012632	CAC	2	6	1232640	1232645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_012632	C	6	6	1232650	1232655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6527	NC_012632	CGG	2	6	1232739	1232744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_012632	GCT	3	9	1232774	1232782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_012632	CTT	2	6	1232916	1232921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_012632	G	6	6	1233036	1233041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_012632	CTA	2	6	1233416	1233421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_012632	C	6	6	1233449	1233454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6533	NC_012632	ACCT	2	8	1233593	1233600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6534	NC_012632	TAGG	2	8	1233654	1233661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_012632	GCC	2	6	1233721	1233726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_012632	GTTTG	2	10	1233732	1233741	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_012632	TCC	2	6	1233791	1233796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_012632	CTA	2	6	1233802	1233807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_012632	TCG	2	6	1233845	1233850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_012632	AGG	2	6	1233874	1233879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_012632	CGAGC	2	10	1233962	1233971	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6542	NC_012632	GGCT	2	8	1233980	1233987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_012632	TCC	2	6	1234092	1234097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_012632	C	6	6	1234238	1234243	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6545	NC_012632	GA	3	6	1234250	1234255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_012632	C	6	6	1234263	1234268	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6547	NC_012632	GT	3	6	1234321	1234326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_012632	TTG	2	6	1234356	1234361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_012632	CTCC	2	8	1234537	1234544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6550	NC_012632	CCCGG	2	10	1234578	1234587	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6551	NC_012632	GTG	2	6	1234606	1234611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_012632	CCT	2	6	1234676	1234681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_012632	GGC	2	6	1234838	1234843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_012632	CAC	2	6	1234866	1234871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6555	NC_012632	TGC	2	6	1234945	1234950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_012632	AGCC	2	8	1234985	1234992	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_012632	TGG	2	6	1235004	1235009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_012632	TCC	2	6	1235010	1235015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_012632	CGG	2	6	1235198	1235203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_012632	C	6	6	1235219	1235224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6561	NC_012632	G	6	6	1235407	1235412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_012632	C	7	7	1235419	1235425	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6563	NC_012632	CTC	2	6	1235513	1235518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_012632	CTC	2	6	1235559	1235564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_012632	CGG	2	6	1235790	1235795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_012632	TA	3	6	1235864	1235869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_012632	GAGG	2	8	1235893	1235900	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_012632	TAA	2	6	1235902	1235907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_012632	TAT	2	6	1235956	1235961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_012632	TA	3	6	1235982	1235987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_012632	TAA	2	6	1236008	1236013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_012632	GA	3	6	1236031	1236036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_012632	GAA	2	6	1236160	1236165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_012632	GA	3	6	1236183	1236188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_012632	TA	3	6	1236201	1236206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_012632	TCA	2	6	1236227	1236232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_012632	TAAA	2	8	1236281	1236288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_012632	A	6	6	1236286	1236291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_012632	TCAA	2	8	1236330	1236337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6580	NC_012632	AT	3	6	1236411	1236416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_012632	TTGA	2	8	1236429	1236436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_012632	TCTT	2	8	1236701	1236708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6583	NC_012632	ATT	2	6	1236713	1236718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_012632	GTGAG	2	10	1236721	1236730	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_012632	TTA	2	6	1236738	1236743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_012632	TTC	2	6	1237000	1237005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_012632	ATAGA	2	10	1237139	1237148	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012632	TAT	2	6	1237169	1237174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_012632	TAT	2	6	1237265	1237270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_012632	A	6	6	1237271	1237276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_012632	AT	5	10	1237298	1237307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_012632	TAAA	2	8	1239983	1239990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_012632	TAA	2	6	1240006	1240011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_012632	T	6	6	1240022	1240027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_012632	TTA	2	6	1240078	1240083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_012632	A	6	6	1240118	1240123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_012632	AG	3	6	1240168	1240173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_012632	AGGA	2	8	1240273	1240280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_012632	GA	3	6	1240290	1240295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_012632	AAT	2	6	1240310	1240315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_012632	ATT	2	6	1240346	1240351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_012632	GTA	2	6	1240437	1240442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_012632	TAGA	2	8	1240461	1240468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_012632	TAC	2	6	1240470	1240475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_012632	GAA	2	6	1240494	1240499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_012632	TCA	2	6	1240503	1240508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_012632	TAT	2	6	1240558	1240563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_012632	CTA	2	6	1240643	1240648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_012632	AAG	2	6	1240713	1240718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_012632	CTAC	2	8	1240793	1240800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6611	NC_012632	GTT	2	6	1240811	1240816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_012632	TCCT	2	8	1240848	1240855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_012632	GAA	2	6	1240898	1240903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_012632	AGG	2	6	1240936	1240941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_012632	ATAC	2	8	1240961	1240968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6616	NC_012632	AAG	2	6	1241007	1241012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_012632	ATA	2	6	1241107	1241112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_012632	AGG	2	6	1241202	1241207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_012632	TTC	2	6	1241217	1241222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_012632	TCT	2	6	1241227	1241232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_012632	ATA	2	6	1241506	1241511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_012632	TC	3	6	1241519	1241524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6623	NC_012632	ATT	2	6	1241541	1241546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_012632	TAT	2	6	1241599	1241604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_012632	TA	3	6	1241631	1241636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_012632	ATC	2	6	1241642	1241647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_012632	CTT	2	6	1241674	1241679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_012632	GAG	2	6	1241688	1241693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_012632	TAGCTT	2	12	1241710	1241721	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6630	NC_012632	TAA	2	6	1241822	1241827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_012632	A	6	6	1241848	1241853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_012632	T	6	6	1241896	1241901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6633	NC_012632	CAT	2	6	1241902	1241907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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