MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 11746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012623	TATCA	2	10	545144	545153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2502	NC_012623	TTA	2	6	545676	545681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_012623	T	6	6	545695	545700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_012623	TGG	2	6	545758	545763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_012623	TTA	2	6	545848	545853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_012623	ACT	2	6	545890	545895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_012623	T	6	6	545904	545909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_012623	TTA	2	6	545935	545940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_012623	ACC	2	6	545968	545973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2510	NC_012623	AGT	2	6	545996	546001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_012623	GAG	2	6	546060	546065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_012623	AAT	2	6	546066	546071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_012623	GAA	2	6	546202	546207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_012623	TAC	2	6	546236	546241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_012623	TGAA	2	8	546906	546913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_012623	A	6	6	547540	547545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_012623	TCA	2	6	547576	547581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_012623	CTAAC	2	10	547594	547603	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2519	NC_012623	AGTTA	2	10	547731	547740	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_012623	TAG	2	6	547749	547754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_012623	CGG	2	6	547847	547852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_012623	CCT	2	6	547969	547974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_012623	TTA	2	6	548016	548021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_012623	ATA	2	6	548033	548038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_012623	AAAG	2	8	548230	548237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_012623	TAA	2	6	548244	548249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_012623	TA	3	6	548253	548258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_012623	ATG	2	6	548262	548267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_012623	GCA	2	6	548268	548273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_012623	ATT	2	6	548307	548312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_012623	CTAG	2	8	549000	549007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_012623	CAA	2	6	549067	549072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_012623	AAT	2	6	549084	549089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_012623	CCT	2	6	549104	549109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2535	NC_012623	GAA	2	6	549229	549234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_012623	TTA	2	6	549290	549295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_012623	AT	4	8	549320	549327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_012623	GAC	2	6	549369	549374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_012623	TATG	2	8	549444	549451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_012623	CTT	2	6	549481	549486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_012623	CTT	2	6	550692	550697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_012623	T	6	6	550701	550706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_012623	AATGA	2	10	550724	550733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_012623	CAG	2	6	550748	550753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_012623	TCA	2	6	550784	550789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_012623	CTC	2	6	550843	550848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2547	NC_012623	CCA	2	6	550862	550867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2548	NC_012623	GAC	2	6	550875	550880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_012623	ATG	2	6	550888	550893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_012623	CTCC	2	8	550923	550930	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2551	NC_012623	CCT	2	6	550952	550957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_012623	AAAT	2	8	550961	550968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_012623	TAA	3	9	551045	551053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_012623	CTC	2	6	551060	551065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2555	NC_012623	TC	3	6	551064	551069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_012623	TA	3	6	551092	551097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_012623	GAGTA	2	10	551100	551109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_012623	TAG	2	6	551149	551154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_012623	GAA	2	6	551167	551172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_012623	CCTTA	2	10	551210	551219	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2561	NC_012623	TAG	2	6	551260	551265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_012623	TCA	2	6	551324	551329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_012623	GTT	2	6	551358	551363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_012623	GAT	2	6	551367	551372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_012623	AG	3	6	551465	551470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_012623	CTC	3	9	551488	551496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2567	NC_012623	TTA	2	6	551534	551539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_012623	AAT	2	6	551628	551633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_012623	GAA	2	6	551701	551706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_012623	AAG	2	6	551735	551740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_012623	ATG	2	6	551785	551790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_012623	AG	3	6	551793	551798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_012623	CCTA	2	8	551804	551811	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_012623	GAC	2	6	551821	551826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2576	NC_012623	AGC	2	6	551975	551980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_012623	AGC	2	6	552014	552019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_012623	GA	3	6	552063	552068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_012623	CAA	2	6	552074	552079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_012623	GA	3	6	552177	552182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_012623	TAGGGA	2	12	552245	552256	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_012623	CTT	2	6	552278	552283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_012623	CAG	2	6	552308	552313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_012623	CGT	2	6	552356	552361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2585	NC_012623	CTC	2	6	552377	552382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2586	NC_012623	AC	3	6	552402	552407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2587	NC_012623	TCC	2	6	552430	552435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2588	NC_012623	AAGGAG	2	12	552441	552452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_012623	TCC	2	6	552483	552488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2590	NC_012623	GGA	2	6	552497	552502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_012623	GAAG	2	8	552505	552512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_012623	CTT	2	6	552570	552575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_012623	GCT	2	6	552579	552584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_012623	TAA	2	6	552641	552646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_012623	GAG	3	9	552684	552692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_012623	CT	3	6	552710	552715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2597	NC_012623	ATC	2	6	552808	552813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_012623	AAC	2	6	552817	552822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_012623	TGA	2	6	552851	552856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_012623	CA	3	6	552888	552893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2601	NC_012623	A	6	6	553155	553160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_012623	ATA	2	6	553761	553766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_012623	TTTA	2	8	553769	553776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_012623	ATT	2	6	553780	553785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_012623	GTCA	2	8	553823	553830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2606	NC_012623	TAG	2	6	553854	553859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_012623	TTA	3	9	553866	553874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_012623	TAG	2	6	553904	553909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_012623	TAA	2	6	554043	554048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_012623	TA	3	6	554140	554145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_012623	AAT	2	6	554175	554180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_012623	A	9	9	554252	554260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_012623	AGAAA	2	10	554288	554297	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_012623	ACTA	2	8	554302	554309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2615	NC_012623	ATG	2	6	554312	554317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_012623	A	6	6	554324	554329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_012623	TAT	2	6	555795	555800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_012623	AT	3	6	555799	555804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_012623	TA	3	6	555839	555844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_012623	TA	3	6	555848	555853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_012623	T	6	6	555860	555865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_012623	TAGAT	2	10	555879	555888	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_012623	A	6	6	555891	555896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_012623	TCTA	2	8	559440	559447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2625	NC_012623	AG	3	6	560987	560992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_012623	TCAAA	2	10	561063	561072	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2627	NC_012623	TAA	2	6	561098	561103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_012623	TAAAA	2	10	561456	561465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_012623	TACTT	2	10	562875	562884	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2630	NC_012623	TTA	2	6	563048	563053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_012623	AAT	2	6	563206	563211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_012623	A	8	8	563342	563349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_012623	ATTTT	2	10	563356	563365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_012623	A	6	6	563366	563371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2636	NC_012623	TTAC	2	8	564996	565003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2770	NC_012623	ATT	2	6	657274	657279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2771	NC_012623	TA	3	6	657329	657334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2772	NC_012623	A	6	6	658274	658279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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