MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 11746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012623	TTA	2	6	230015	230020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012623	AAG	2	6	231584	231589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012623	TCGTT	2	10	232676	232685	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_012623	GTT	2	6	232693	232698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012623	CTAGT	2	10	232729	232738	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1006	NC_012623	GGTA	2	8	232835	232842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012623	AT	3	6	232862	232867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012623	TTTCA	2	10	232903	232912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_012623	ATT	2	6	232951	232956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012623	TA	3	6	232957	232962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012623	ATA	2	6	233850	233855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012623	ACT	2	6	233937	233942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012623	TGA	2	6	233951	233956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012623	TTA	2	6	233984	233989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012623	GGA	2	6	234099	234104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012623	TA	3	6	234196	234201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012623	AAG	2	6	234220	234225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012623	AT	3	6	234777	234782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_012623	AATA	3	12	234811	234822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_012623	T	7	7	234823	234829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012623	A	6	6	235141	235146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012623	TA	3	6	235244	235249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012623	TCTT	2	8	235278	235285	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_012623	AT	3	6	235288	235293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_012623	TTA	3	9	235350	235358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012623	ATA	2	6	235366	235371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012623	TAA	2	6	235372	235377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012623	AAGT	2	8	235408	235415	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012623	TAG	2	6	235425	235430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_012623	TA	3	6	235462	235467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012623	ATA	2	6	238284	238289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_012623	CTTTTT	2	12	238294	238305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1033	NC_012623	GA	3	6	238378	238383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012623	AATA	2	8	238406	238413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012623	A	6	6	238526	238531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012623	ATT	2	6	238553	238558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_012623	CCTAG	2	10	238568	238577	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_012623	TAC	2	6	239525	239530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_012623	CTTT	2	8	239606	239613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1040	NC_012623	TTA	2	6	239618	239623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_012623	ATT	2	6	239652	239657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012623	CT	3	6	239671	239676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_012623	T	6	6	239698	239703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012623	A	6	6	243095	243100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012623	ATA	2	6	243114	243119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_012623	CAA	2	6	243168	243173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012623	GAA	2	6	243177	243182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_012623	TAT	2	6	243208	243213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012623	CAA	2	6	243262	243267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012623	GGA	2	6	244283	244288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012623	GAAG	2	8	244291	244298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012623	CTT	2	6	244356	244361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012623	GCT	2	6	244365	244370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_012623	TAA	2	6	244427	244432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012623	GAG	3	9	244470	244478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012623	CT	3	6	244496	244501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_012623	ATC	2	6	244594	244599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_012623	AAC	2	6	244603	244608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_012623	TGA	2	6	244637	244642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012623	CA	3	6	244674	244679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_012623	TAC	2	6	245179	245184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_012623	T	6	6	245240	245245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012623	CT	3	6	245258	245263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_012623	TTA	2	6	245987	245992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012623	CTT	2	6	246063	246068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_012623	TTA	2	6	246074	246079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012623	ATT	2	6	246356	246361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012623	T	6	6	246389	246394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012623	TTA	2	6	246420	246425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012623	TA	3	6	246437	246442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_012623	AGT	2	6	246669	246674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_012623	TTA	2	6	246717	246722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012623	CT	3	6	246725	246730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_012623	TTC	2	6	246777	246782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_012623	AATA	3	12	246803	246814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012623	AG	3	6	246820	246825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012623	TGA	2	6	246896	246901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_012623	TAA	2	6	247592	247597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_012623	TTC	2	6	247602	247607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_012623	TC	3	6	247606	247611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_012623	AGA	2	6	247632	247637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012623	AG	3	6	247645	247650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012623	TTA	2	6	247751	247756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012623	AAC	2	6	247805	247810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_012623	AAG	2	6	247821	247826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_012623	GGCT	2	8	247916	247923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_012623	ACA	2	6	247952	247957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012623	TAGT	2	8	247999	248006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012623	TAT	3	9	248044	248052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012623	A	6	6	249305	249310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012623	ATA	2	6	249324	249329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012623	CAA	2	6	249375	249380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_012623	GAA	2	6	249384	249389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012623	TAT	2	6	249412	249417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012623	GAT	2	6	249433	249438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_012623	CCA	2	6	249454	249459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_012623	CAA	2	6	249470	249475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_012623	CAC	2	6	249603	249608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_012623	AGT	2	6	249646	249651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012623	GA	3	6	249702	249707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_012623	CA	3	6	249850	249855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_012623	ATTTC	2	10	249975	249984	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_012623	TA	3	6	249995	250000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012623	GAG	2	6	250034	250039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_012623	TAG	2	6	250075	250080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012623	GAA	2	6	250135	250140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012623	GTT	2	6	250142	250147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012623	GAA	2	6	250180	250185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012623	CTT	2	6	250230	250235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_012623	CCTTC	2	10	250255	250264	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1111	NC_012623	TCT	2	6	250317	250322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_012623	TTA	2	6	250373	250378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012623	TTAT	2	8	250399	250406	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012623	CTA	2	6	250433	250438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012623	TTA	2	6	250446	250451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012623	ATTT	2	8	250461	250468	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012623	AGG	2	6	250472	250477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012623	AGG	2	6	250497	250502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012623	C	11	11	250521	250531	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1120	NC_012623	GATA	2	8	251490	251497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012623	TAC	2	6	251507	251512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_012623	TAA	2	6	251517	251522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012623	A	6	6	255596	255601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012623	TTAC	2	8	255618	255625	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_012623	T	6	6	255729	255734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_012623	AT	3	6	255764	255769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012623	TAT	2	6	255777	255782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012623	AAT	2	6	256980	256985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012623	TA	3	6	258101	258106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012623	TAT	3	9	258190	258198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012623	ACG	2	6	258210	258215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_012623	AT	3	6	258940	258945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012623	TAA	2	6	258963	258968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012623	TATAA	2	10	258985	258994	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_012623	A	6	6	260032	260037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_012623	TA	4	8	260044	260051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_012623	AT	3	6	261753	261758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_012623	AAGGA	2	10	261774	261783	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1153	NC_012623	ATT	2	6	265210	265215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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