MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus Y.N.15.51 chromosome

Total Repeats: 11746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_012623	GAA	2	6	2333830	2333835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_012623	ATA	2	6	2333838	2333843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_012623	GAA	2	6	2333844	2333849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_012623	AAAC	2	8	2333891	2333898	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10005	NC_012623	TAGA	2	8	2333910	2333917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_012623	GAA	2	6	2333924	2333929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_012623	ATT	2	6	2333983	2333988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_012623	TGA	2	6	2334087	2334092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_012623	GTA	2	6	2334117	2334122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_012623	GAT	2	6	2334151	2334156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_012623	TGT	2	6	2334180	2334185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_012623	TAC	2	6	2334217	2334222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_012623	ATTT	2	8	2334291	2334298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_012623	AAT	2	6	2334307	2334312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_012623	ATT	2	6	2334343	2334348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_012623	TTC	2	6	2334461	2334466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_012623	CCTCT	2	10	2334478	2334487	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10018	NC_012623	AT	3	6	2334549	2334554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_012623	GAAA	2	8	2335184	2335191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_012623	ATA	2	6	2335202	2335207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_012623	GAT	2	6	2335413	2335418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_012623	ATC	2	6	2335434	2335439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_012623	CCA	2	6	2335444	2335449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_012623	TC	3	6	2335466	2335471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_012623	TGG	2	6	2335475	2335480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_012623	TTC	2	6	2335585	2335590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_012623	AGA	2	6	2335621	2335626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_012623	ATCT	2	8	2335743	2335750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_012623	CT	3	6	2335775	2335780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_012623	TGA	2	6	2335785	2335790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_012623	CAA	2	6	2335818	2335823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_012623	TCC	2	6	2335851	2335856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10033	NC_012623	TTGA	2	8	2335864	2335871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_012623	TGA	2	6	2335958	2335963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_012623	CCT	2	6	2336128	2336133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_012623	T	6	6	2336218	2336223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_012623	TA	3	6	2336272	2336277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_012623	ATT	2	6	2336303	2336308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_012623	CT	3	6	2336381	2336386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_012623	CTC	2	6	2336402	2336407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_012623	CTTT	2	8	2336425	2336432	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_012623	TTTC	2	8	2336452	2336459	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_012623	TTA	2	6	2336496	2336501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_012623	AGG	2	6	2336511	2336516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_012623	TCC	2	6	2336566	2336571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10046	NC_012623	AAG	2	6	2336595	2336600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_012623	ATCC	2	8	2336621	2336628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_012623	TCC	2	6	2336644	2336649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_012623	AACA	2	8	2336671	2336678	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10050	NC_012623	TAA	2	6	2336698	2336703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_012623	CTCTT	2	10	2336789	2336798	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10052	NC_012623	ATT	2	6	2336826	2336831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_012623	ACT	2	6	2336860	2336865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_012623	AGTT	2	8	2336866	2336873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_012623	GTTTAT	2	12	2336905	2336916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_012623	AT	3	6	2336915	2336920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_012623	T	6	6	2336934	2336939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_012623	TGA	2	6	2336957	2336962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_012623	TAA	2	6	2337027	2337032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_012623	CTTA	2	8	2337116	2337123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10061	NC_012623	TAT	3	9	2337141	2337149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_012623	AAC	2	6	2337163	2337168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_012623	TG	3	6	2337225	2337230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_012623	AAT	2	6	2337264	2337269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_012623	TTA	2	6	2337308	2337313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_012623	TTA	2	6	2337336	2337341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_012623	CTC	2	6	2337353	2337358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_012623	CAA	2	6	2337426	2337431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_012623	AAT	3	9	2337436	2337444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_012623	ATC	2	6	2337512	2337517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_012623	CCT	2	6	2337525	2337530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_012623	CT	3	6	2337536	2337541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10073	NC_012623	AGG	2	6	2337551	2337556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_012623	CTA	2	6	2337684	2337689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_012623	TGT	2	6	2337748	2337753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_012623	TTTC	2	8	2337835	2337842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_012623	GTA	2	6	2337885	2337890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_012623	CTT	2	6	2337997	2338002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10079	NC_012623	TCT	2	6	2338015	2338020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_012623	TTA	2	6	2338038	2338043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_012623	AT	3	6	2338056	2338061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_012623	GAG	2	6	2338201	2338206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_012623	TAA	2	6	2338225	2338230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_012623	TA	3	6	2338234	2338239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_012623	AGG	2	6	2338294	2338299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_012623	AAG	2	6	2338376	2338381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_012623	TAA	2	6	2338456	2338461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_012623	T	6	6	2340723	2340728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_012623	GCTTG	2	10	2340779	2340788	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10090	NC_012623	AGA	2	6	2340894	2340899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_012623	TAT	2	6	2340934	2340939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_012623	A	6	6	2342169	2342174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_012623	ATT	2	6	2342187	2342192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_012623	CGA	2	6	2342262	2342267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_012623	TCT	2	6	2342286	2342291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_012623	CCTT	2	8	2342378	2342385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10097	NC_012623	GTG	2	6	2342509	2342514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_012623	GTA	2	6	2342554	2342559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_012623	GAC	2	6	2342686	2342691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_012623	TCA	2	6	2342693	2342698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_012623	AGGA	2	8	2342704	2342711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_012623	ATT	2	6	2342725	2342730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_012623	AGG	2	6	2342776	2342781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_012623	TGA	2	6	2342823	2342828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_012623	GAC	2	6	2342836	2342841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_012623	ATT	2	6	2342879	2342884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_012623	CTG	2	6	2342885	2342890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_012623	GA	3	6	2342899	2342904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_012623	TGAAA	2	10	2342922	2342931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_012623	AT	3	6	2342996	2343001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_012623	ATA	2	6	2343109	2343114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_012623	ATGG	2	8	2343128	2343135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_012623	GAT	2	6	2343181	2343186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_012623	AAG	2	6	2343342	2343347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_012623	TATAAA	2	12	2343361	2343372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_012623	ATT	2	6	2343380	2343385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_012623	AAT	2	6	2343390	2343395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_012623	TGA	2	6	2343418	2343423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_012623	TGAT	2	8	2343436	2343443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_012623	AAATAT	2	12	2346411	2346422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_012623	ATT	2	6	2346432	2346437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_012623	ATA	2	6	2346460	2346465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_012623	ATC	2	6	2346478	2346483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_012623	TAT	2	6	2346489	2346494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_012623	TA	3	6	2346507	2346512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_012623	TAAAA	2	10	2347351	2347360	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_012623	GCT	2	6	2347372	2347377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_012623	TA	4	8	2347438	2347445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_012623	AACA	2	8	2347465	2347472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10130	NC_012623	T	6	6	2348303	2348308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_012623	CGT	2	6	2348358	2348363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10138	NC_012623	TGG	2	6	2348613	2348618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_012623	TACCT	2	10	2374607	2374616	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10254	NC_012623	ATTTTT	2	12	2374629	2374640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10256	NC_012623	AAG	2	6	2374823	2374828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_012623	TCTT	2	8	2374908	2374915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10258	NC_012623	TA	3	6	2374919	2374924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_012623	TAAA	2	8	2374961	2374968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10394	NC_012623	TCT	2	6	2395469	2395474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10395	NC_012623	TAT	2	6	2395476	2395481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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